最美情侣中文字幕电影,在线麻豆精品传媒,在线网站高清黄,久久黄色视频

歡迎光臨散文網(wǎng) 會(huì)員登陸 & 注冊(cè)

一學(xué)就會(huì)!利用StringTie拼接轉(zhuǎn)錄本和定量(一)

2023-09-19 09:17 作者:小云愛(ài)生信  | 我要投稿

爾云間? 一個(gè)專(zhuān)門(mén)做科研的團(tuán)隊(duì)

歡迎點(diǎn)贊+收藏+關(guān)注

生信人R語(yǔ)言學(xué)習(xí)必備

立刻擁有一個(gè)Rstudio賬號(hào)

開(kāi)啟升級(jí)模式吧

(56線(xiàn)程,256G內(nèi)存,個(gè)人存儲(chǔ)1T)

小果之前帶大家進(jìn)行了轉(zhuǎn)錄組參考序列的比對(duì),結(jié)果也是很順利地跑出來(lái)了,接下來(lái)該做什么呢?當(dāng)然可以進(jìn)行基因表達(dá)水平分析啦。

進(jìn)行基因表達(dá)水平分析可以幫助我們了解不同組織或條件下的基因表達(dá)情況,從而揭示生物體在不同生理或環(huán)境條件下的分子響應(yīng)機(jī)制。


比如,在腫瘤研究中,我們可以通過(guò)分析腫瘤組織和正常組織的基因表達(dá)水平,找到腫瘤特異性基因并深入研究其調(diào)控機(jī)制,以期找到更好的腫瘤治療方法;在植物研究中,我們可以通過(guò)分析在逆境條件下的基因表達(dá)情況,探索植物的應(yīng)激響應(yīng)機(jī)制并發(fā)現(xiàn)植物抗逆基因,以期提高作物的耐受性。因此,基因表達(dá)水平分析是分子生物學(xué)研究的重要手段之一。


重要性已經(jīng)了解了,下面我們開(kāi)始吧,在開(kāi)始之前確保你已經(jīng)擁有參考序列比對(duì)的結(jié)果哦:

?

我們需要用到samtools,如果沒(méi)有的話(huà),需要先安裝:


使用的時(shí)候記得激活一下環(huán)境。

我們先了解一下獲得的sam數(shù)據(jù),使用代碼查看文件:

接下來(lái)等待結(jié)果即可!

格式轉(zhuǎn)化成功后就可以進(jìn)行下一步分析了!

小果今天就分享到這里,下期不見(jiàn)不散!


歡迎使用:云生信??- 學(xué)生物信息學(xué)?(biocloudservice.com)

想用服務(wù)器私信小果哦

“生信果”,生信入門(mén)、R語(yǔ)言、生信圖解讀與繪制、軟件操作、代碼復(fù)現(xiàn)、生信硬核知識(shí)技能、服務(wù)器、生物信息學(xué)的教程,以及基于R的分析和可視化等原創(chuàng)內(nèi)容,一起見(jiàn)證小白和大佬的成長(zhǎng)。


一學(xué)就會(huì)!利用StringTie拼接轉(zhuǎn)錄本和定量(一)的評(píng)論 (共 條)

分享到微博請(qǐng)遵守國(guó)家法律
醴陵市| 新竹市| 娱乐| 内丘县| 英德市| 宁乡县| 奉贤区| 五河县| 卢氏县| 镇宁| 鹿邑县| 平远县| 南和县| 定兴县| 东明县| 高雄县| 建始县| 正安县| 阜平县| 裕民县| 六安市| 巫溪县| 永顺县| 武山县| 舒兰市| 长汀县| 皮山县| 昭通市| 台江县| 彩票| 东乡族自治县| 满城县| 塔城市| 阿合奇县| 西城区| 清苑县| 苏尼特右旗| 安多县| 电白县| 新乡县| 当涂县|