更實用!批量解析 Sanger 測序.ab1文件~出圖出文本
寫在前面
年前,推了兩個插件,主要針對基因克隆實驗中常見需求,即引物設計以及Sanger測序結果解讀....(主要還是為了情懷,都是我接觸生信之前一直想要的功能...),對應了三個推文:
《實用 | PCR 引物特異性?用Primer Check檢測一下》
《眼見為實!Sanger測序峰圖比對到參考序列 - 直觀!》
《有點意思!Sanger 測序峰值圖自動解析單倍型》
其中最后一個推文事實上,是在「TBtools」老鐵使用過之后做了增強。轉眼兩周過去了。萬萬沒想到,不少濕實驗的朋友過年期間一直在加班干實驗。今天下午,收到南農(nóng)和老師的反饋信息,主要建議增加一個批量模式,主要原因是,往往基因編輯的結果材料有幾十上百株系,而不僅僅是三五個...原本相關工作需要數(shù)天,有了插件可能還需要三四天,但如果支持批量模式,那么....
完全在理。收到這個反饋信息的時候,我突然覺得「TBtools」工作確實沒做到位。開發(fā)「TBtools」的出發(fā)點在于減少濕實驗科研人員在數(shù)據(jù)分析上的時間投入,讓大伙更多陪伴家人。
稍微遲疑了一會,采納了和老師的建議,并做了簡單調(diào)整,于是得到新版插件,暫時略去交互分析,重在批量處理。
Batch Sanger Sequencing Result Check
新插件的界面如下:

相關使用簡單,直接給個示例

運行結束后,可以在設置的輸出目錄中看到輸出文件,大體如下

感覺不錯~
寫在最后
Emmm.... 正如前述,
一個好用的工具,常常用戶很多;
而用戶很多的工具,常常才會是好用的工具。
PS: 「生信藥丸」上不時會恰飯,后臺留言有不少意見....大伙可以有意見,但飯就是要恰,沒得商量。
差點忘了....
插件的安裝與使用
《TBtools Cookbook》 - 寫給「TBtools」所有用戶的參考手冊?https://www.yuque.com/cjchen/hirv8i
你想知道的,都在里面了:
軟件/數(shù)據(jù)庫的下載/更新
對應功能的使用說明與具體示例
常見問題 FAQ 及解決方案
如何有效提出 TBtools 使用問題從而快速獲得回復并得到解決
插件的獲取
差點,忘了....
推文在看,隨后分享推文到朋友圈,集齊 6 個點贊,
截圖發(fā)送到「香蕉平行線」公眾號
回復 Batch Sanger Check,即可獲得下載鏈接,具體如下

PS II: Emmm... 最近與專門做學術論文編輯/潤色的機構 TopEdit (https://topeditsci.com/)有合作,對方提供了TBtools用戶專屬優(yōu)惠碼(85折),即 TBTOOLS85?,全網(wǎng)最高折扣碼,可以重復使用(如推薦給其他需要的朋友);若發(fā)現(xiàn)更高折扣,可以與我提,再爭取更高優(yōu)惠力度....
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