運(yùn)用16S+代謝組學(xué)揭示自身免疫性前列腺炎的調(diào)節(jié)機(jī)制
前言
前列腺炎是一種泌尿生殖系統(tǒng)疾病(CP/CPPS),是最常見的前列腺炎類型,約占前列腺炎人群的90%-95%。CP/CPPS以盆腔長期慢性疼痛伴或不伴低尿路癥狀為特征,已成為全球公認(rèn)的男性健康威脅。近年來越來越多的證據(jù)表明免疫失衡在發(fā)病機(jī)制中發(fā)揮了重要作用。因此,CP/CPPS也被認(rèn)為是一種器官特異性的自身免疫性疾病。T淋巴細(xì)胞,特別是CD4+T細(xì)胞,被發(fā)現(xiàn)是CP/CPPS發(fā)病機(jī)制的主要貢獻(xiàn)者,Th17細(xì)胞是CD4+T細(xì)胞的一個子集,據(jù)報道,Th17細(xì)胞與多種自身免疫性疾病的發(fā)生密切相關(guān)。
2022年7月,安徽醫(yī)科大學(xué)第一附屬醫(yī)院泌尿外科梁朝朝教授課題組在《Frontiers in Immunology》(IF:8.796)期刊發(fā)表了題為“Gut Microflora Modulates Th17/Treg Cell Differentiation in Experimental Autoimmune Prostatitis via the Short-Chain Fatty Acid Propionate”的研究成果,本研究運(yùn)用糞便16s rRNA測序和非靶向/靶向代謝組學(xué)等研究方法分析了EAP小鼠腸道微生物組和代謝產(chǎn)物,以研究EAP中腸道微生物群和相關(guān)代謝物的豐度是否發(fā)生改變,從而發(fā)現(xiàn)腸道菌群通過其代謝物對EAP小鼠模型中免疫反應(yīng)調(diào)節(jié)的影響。
杜和喜、岳少宇、牛迪為第一作者,梁朝朝、張力、陳先國、李春為共同通訊作者,歐易/鹿明生物提供該項(xiàng)目糞便16s rRNA測序和非靶向/靶向代謝組學(xué)相關(guān)工作。
研究背景
腸道菌群系在調(diào)節(jié)宿主的免疫/炎癥反應(yīng)中發(fā)揮著不可或缺的作用。一般來說,腸道菌群的系統(tǒng)功能主要?dú)w因于微生物代謝組,特別是短鏈脂肪酸(SCFAs),這是膳食纖維發(fā)酵最具特征的最終產(chǎn)物。一方面,這些細(xì)菌來源的SCFAs可以進(jìn)入循環(huán),調(diào)節(jié)腸外器官中的免疫系統(tǒng),包括Th17和Treg細(xì)胞。另一方面,SCFAs已被證明可以促進(jìn)腸道中的免疫細(xì)胞進(jìn)入循環(huán)和遠(yuǎn)端組織。因此,SCFA代謝與免疫紊亂之間的關(guān)系已被證實(shí)和接受。目前尚不清楚腸道微生物驅(qū)動的SCFAs是否對前列腺炎有影響。
研究思路
實(shí)驗(yàn)方法
研究材料:小鼠
研究流程:
1.EAP的小鼠模型建立
2.組織病理學(xué)和免疫組化
3.流式細(xì)胞儀
4.CD4+T細(xì)胞的分離和體外分化
5.慢病毒感染
6.酶聯(lián)免疫吸附測定
7.DNA提取和16s rRNA測序
8.糞便非靶向/靶向代謝組學(xué)
9.SCFAs測量分析
10.丙酸SCFA治療分析
11.蛋白印跡分析
12.實(shí)時聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)
13.糞便微生物群移植
研究結(jié)果
1.Th17和Treg細(xì)胞比例及EAP相對細(xì)胞因子水平顯著異常
在本研究中,作者首先通過兩次皮下免疫建立了EAP小鼠模型(圖1A)。EAP模型通過組織學(xué)檢查和盆腔疼痛測量結(jié)果進(jìn)行評估。如圖1B-D所示,與對照組相比,EAP組的前列腺炎癥和對觸覺異常痛的反應(yīng)頻率均明顯增加,說明小鼠EAP模型建立成功。接下來,作者分析了對照組和EAP小鼠脾臟淋巴細(xì)胞中Th17和Treg細(xì)胞的百分比。最后,作者對兩組前列腺切片進(jìn)行IL-17A和FoxP3進(jìn)行免疫組化染色。結(jié)果顯示,EAP小鼠前列腺組織中il-17a陽性染色細(xì)胞比例增加,foxp3陽性染色細(xì)胞比例降低(圖1M、N)。
圖1 | 評價EAP模型、Th17/Treg細(xì)胞比例及相關(guān)炎癥細(xì)胞因子水平
2.EAP中糞便代謝組的改變
腸道菌群在免疫穩(wěn)態(tài)中起著關(guān)鍵作用,通常通過其代謝物調(diào)節(jié)宿主的免疫系統(tǒng)。因此,作者運(yùn)用代謝組學(xué)分析來研究EAP小鼠的腸道代謝譜。通過對糞便進(jìn)行GC-MS非靶向代謝組學(xué)分析 ,發(fā)現(xiàn)對照組和EAP小鼠之間共有94種代謝物的豐度差異(圖2A,B)。我們進(jìn)一步對對照組和EAP組之間的差異表達(dá)通路進(jìn)行了KEGG通路富集分析(圖2C)。
圖2 | 對照組和EAP小鼠的代謝組學(xué)譜
3.EAP的腸道菌群與對照組有顯著差異
EAP小鼠的脂肪多樣性指數(shù)、香農(nóng)指數(shù)、辛普森指數(shù)、觀察物種指數(shù)和PD_whole_tree均顯著低于對照組,表明腸道微生物群的a-多樣性發(fā)生了顯著改變(圖3A)。PCoA分析是生物多樣性的一個指標(biāo),結(jié)果顯示對照組和EAP小鼠樣本之間存在明顯的分離,表明兩組之間的微生物群組成存在顯著差異(圖3B)。在門水平上,EAP小鼠的厚壁菌門的相對豐度較少,硝化螺旋體、芽胞菌和梭菌門。相反,作者在EAP組中檢測到擬桿菌門、藍(lán)藻菌門和白腹桿菌門的增加(圖3C)。在屬水平上,EAP中乳酸菌明顯增加,而其他9個菌群明顯減少(圖3D)。
圖3 | 對照組和EAP小鼠腸道微生物群的比較
4.EAP中丙酸顯著降低
通過靶向代謝組學(xué)測定六種最豐富的短鏈脂肪酸(乙酸、丙酸、丁酸、戊酸、異戊酸和異丁酸)在糞便和血清中的濃度。發(fā)現(xiàn)對照組小鼠糞便中丙酸的濃度高于EAP組,其他SCFAs均無差異(圖4A)。對EAP小鼠血清中SCFA濃度的分析也顯示丙酸含量顯著下降(圖4B)。
圖4 | 對照組和EAP小鼠中SCFAs的絕對濃度
5.補(bǔ)充丙酸可改善EAP,恢復(fù)體內(nèi)Th17/Treg失衡
根據(jù)飲用水中是否加入丙酸,將EAP小鼠分為未處理組(EAP組)和丙酸處理組(EAP+PA組)(圖5A)。值得注意的是,補(bǔ)充外源性丙酸顯著降低了EAP小鼠的前列腺炎癥和盆腔疼痛(圖5B-D)。此外,丙酸處理抑制了EAP小鼠脾臟淋巴細(xì)胞中Th17細(xì)胞的分化(圖5E-H),但有利于Treg細(xì)胞的分化(圖5I,J)。此外,口服補(bǔ)充丙酸可降低了EAP小鼠血清中IL-17和GM-CSF的產(chǎn)生,而增加了TGF-b和IL-10的分泌(圖5K)。在前列腺組織中觀察到與IL-17、TGF-b和IL-10水平相似的結(jié)果(圖5L)。
圖5 | 丙酸可改善EAP,恢復(fù)體內(nèi)Th17/Treg失衡
6.丙酸在體外調(diào)控Th17/Treg細(xì)胞的分化
作者通過體外實(shí)驗(yàn)進(jìn)一步評估了丙酸對EAP的影響。用丙酸分離出在Th17/Treg分化條件下的CD4+幼稚T細(xì)胞(圖6A,D)。與預(yù)期的一樣,丙酸可以抑制更多的CD4+幼稚T細(xì)胞分化為Th17細(xì)胞(圖6B),而它也與促進(jìn)向Treg細(xì)胞的分化有關(guān)(圖6E)。
圖6| 丙酸在體外調(diào)控Th17/Treg細(xì)胞的分化
7.丙酸通過調(diào)節(jié)GPR43-HDAC6軸來調(diào)節(jié)Th17/Treg細(xì)胞的分化
為了探討丙酸是否以GPR依賴的方式調(diào)控Th17和Treg細(xì)胞的分化,作者檢測了GPR43的表達(dá),這是在免疫和代謝中發(fā)揮重要作用的GPRs之一,以及細(xì)胞內(nèi)信號傳導(dǎo)HDAC6(31)。首先,在Th17和Treg細(xì)胞條件下,丙酸刺激下GPR43的表達(dá)增加,而使用LV-shGPR43則抑制了GPR43的表達(dá)(圖7A)。作者還觀察到,當(dāng)分離的CD4+T細(xì)胞用丙酸處理,并在Th17/Treg分化條件下孵育時,HDAC6的表達(dá)水平降低。然而,在LV-shGPR43感染后,它顯著增加(圖7B)。另外,抑制GPR43有助于Th17細(xì)胞分化的急劇增加(圖7C,D),而Treg細(xì)胞的分化明顯減少(圖7E,F(xiàn))。前列腺組織的免疫組化檢測顯示,在LV-shGPR43處理的EAP小鼠中,GPR43陽性細(xì)胞減少,HDAC6的表達(dá)水平增加(圖7G,H)。
圖7 | 丙酸通過調(diào)節(jié)GPR43-HDAC6軸來調(diào)節(jié)Th17/Treg細(xì)胞的分化
8.EAP糞便移植可誘導(dǎo)受體Treg細(xì)胞頻率的降低
為了進(jìn)一步確定腸道微生物群的改變是否導(dǎo)致了EAP中Th17/Treg的失衡,作者運(yùn)用糞便移植實(shí)驗(yàn),將對照組或EAP小鼠的糞便懸液灌胃到抗生素處理的偽無菌受體小鼠中(圖8A)。圖8B-E中,與對照組小鼠的糞便移植相比,EAP小鼠的糞便移植中Treg細(xì)胞的比例明顯降低(p0.05)。因此,將腸道微生物從EAP供體口服轉(zhuǎn)移到健康受體中,導(dǎo)致其Treg細(xì)胞頻率的降低。
圖8 | EAP小鼠糞便移植誘導(dǎo)受體小鼠Treg細(xì)胞頻率降低
研究討論
1.EAP中Th17/Treg處于不平衡狀態(tài)。
2.對照組和EAP小鼠的腸道微生物衍生代謝物存在顯著差異,為研究微生物衍生代謝物中脂肪酸在EAP中的作用提供了線索。
3.在EAP中,微生物源性的丙酸顯著降低。
4.丙酸有助于改善前列腺炎癥,恢復(fù)EAP誘導(dǎo)的Th17/Treg失衡。
5.丙酸有助于在體外調(diào)節(jié)Th17/Treg平衡,進(jìn)一步加強(qiáng)丙酸在EAP中的免疫調(diào)節(jié)作用
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本研究為了揭示腸道菌群是否影響CP/CPPS,及其背后的潛在機(jī)制,通過皮下免疫建立了一個實(shí)驗(yàn)性自身免疫性前列腺炎(EAP)小鼠模型,運(yùn)用糞便16srRNA測序和非靶向/靶向代謝組學(xué),探索腸道菌群在免疫穩(wěn)態(tài)和自身免疫性疾病的發(fā)展中的作用機(jī)制,為在飲食干預(yù)中補(bǔ)充微生物終產(chǎn)物來改善CP/CPPS患者的免疫障礙提供了一個新的視角。
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