實驗員教你選抗體


最近有同學(xué)要做染色了,咨詢我該買什么抗體,抗體官網(wǎng)一個指標(biāo)竟然搜出來幾十種抗體,完全分不清楚,所以今天出一期教程,手把手教你選抗體,這樣老板就再也不用擔(dān)心我會買錯抗體啦!

抗體結(jié)構(gòu)
選抗體前當(dāng)然要對抗體的基本結(jié)構(gòu)有所了解,抗體,又名免疫球蛋白 (Ig),是一種由 B 細(xì)胞產(chǎn)生的大型 Y 形糖蛋白,可在免疫防御中起主要作用??贵w與病原體的特定分子(即抗原)發(fā)生特異性結(jié)合。
抗體以一個或者多個 Y 形單體存在,每個 Y 形單體由 4 條多肽鏈組成(圖 1)。每個 Y 形單體包含兩條相同的重鏈(H)和兩條相同的輕鏈(L),重鏈和輕鏈的序列和長度不同。Y 形單體的頂部包含可變區(qū)(V),也稱抗原結(jié)合片段(F(ab))區(qū)。該區(qū)可與給定抗原上的表位特異性緊密結(jié)合。
抗體的基本結(jié)構(gòu)包含恒定區(qū)(C)和可結(jié)晶片段(Fc)區(qū)。這一區(qū)域?qū)贵w的免疫應(yīng)答功能非常重要。此外,將熒光染料和酶經(jīng)共價鍵連接到抗體的 Fc 部位,可實現(xiàn)實驗的可視化。

***圖 1.抗體結(jié)構(gòu)。*Y 形抗體通過彈性的鉸鏈區(qū)連接到中部??乖Y(jié)合發(fā)生在由免疫球蛋白重鏈(H)和輕鏈(L)組成的可變區(qū)(V)??贵w的基本結(jié)構(gòu)由恒定區(qū)(C)組成。
根據(jù)多肽序列的微小差異,抗體的輕鏈都可分為 kappa (κ) 型或 lambda (λ) 型。重鏈結(jié)構(gòu)決定了各個抗體的總類。
哺乳動物體內(nèi)的抗體分為 5 種同種型:IgG、IgM、IgA、IgD 和 IgE。如圖 2 所示,各個同種型都有其獨特的結(jié)構(gòu)。這些同種型因 Y 形結(jié)構(gòu)的數(shù)量和重鏈種類而異。它們的生物學(xué)特性、功能區(qū)域以及結(jié)合不同抗原的能力有所不同。

?圖 2.抗體結(jié)構(gòu)及同種型。
單克隆與多克隆
多克?。?*Polyclonal)**抗體(pAb)是一種異型抗體混合物,其中的抗體來源于多個 B 細(xì)胞的免疫應(yīng)答過程,并且每種抗體均可識別同一抗原的不同表位。由于多克隆抗體可檢測蛋白上的一系列表位,因此與單克隆抗體相比,它們批間變異的風(fēng)險更高。但是,由于多克隆抗體對單一表位不存在特異性,因此與單克隆抗體相比,它們對抗原微小變化的寬容性更強(qiáng)。
單克?。∕onoclonal)抗體(mAb)由單個 B 細(xì)胞親本克隆產(chǎn)生,因此,只能識別單個抗原的一個表位。單克隆抗體對靶向的抗原表位具有高度特異性,非特異性交叉反應(yīng)性低,批間變異很小。
如何選擇抗體
應(yīng)用實驗
首先根據(jù)自己要做的實驗來篩選,有的抗體能應(yīng)用很多實驗,有的抗體則只能用于某一兩個實驗。
常見實驗簡寫:IHC-P免疫組化石蠟切片、IHC-F免疫組化冰凍切片、mIHC多色熒光免疫組化、IF免疫熒光、ICC免疫細(xì)胞化學(xué)、WB(WesternBlot)蛋白質(zhì)印跡試驗、Flow Cyt (Intra)流式、IP免疫沉淀、ELISA酶聯(lián)免疫吸附試驗。
標(biāo)記方式(偶聯(lián)物)
偶聯(lián)物從最終的圖像采集來分可分為白光和熒光;
常見白光偶聯(lián)物有:Biotin生物素、HRP辣根過氧化物酶、AKP堿性磷酸酶。
常見熒光偶聯(lián)物有:Fitc、Cy3、Cy5、AF488、AF555、AF647;具體顏色通道見下圖。
注意現(xiàn)在常用的偶聯(lián)物是偶聯(lián)在二抗上的,但是一抗的選擇決定了能不能用于某種偶聯(lián)物的二抗。

應(yīng)用種屬
接著根據(jù)你的實驗樣本來選擇一抗,通常一抗的適用種屬都有三種Mouse、Rat、Human,但有的適用于其中一種或兩種,看清楚了,這將決定你的實驗的成敗。
來源種屬
通常一抗的來源種屬有Rabbit和Mouse,二抗的來源種屬有山羊和驢。
這里要注意的是避免種屬間的交叉反應(yīng)造成的假陽性,比如樣本是小鼠的,一抗盡量用兔抗,不要用鼠抗,不然山羊抗小鼠二抗有可能會和樣本中的某些蛋白發(fā)生非特異性反應(yīng),進(jìn)而造成假陽性。
克隆號、表位
篩選到這里已經(jīng)能排除掉很大一部分抗體了,如果不是有特殊的需求,到這里就可以從篩選結(jié)果里隨意的選擇了。
但有些抗體后面會有一些()和【】,分別是什么意思呢?
()里的是抗原表位,如果對免疫原有要求,就需要選擇特別的抗體。例如,sp克隆系列中BRAF抗體(ab228461)可以識別V600E 突變的BRAF蛋白,可用于檢測發(fā)生突變且活化的 BRAF 蛋白質(zhì)。
【】的是克隆號,是抗體研發(fā)中細(xì)胞株的編號,一般單克隆才會有這個號,這個不用特別關(guān)心,知道是什么就行。

其他一些特殊標(biāo)記
靶點名稱前面有Phospho表示磷酸化,磷酸化后面都有一個(),里面寫的是磷酸化的位點,比如Akt主要有兩個重要的磷酸化位點Thr308和Ser473。

靶點名稱前面加pan,表示該抗體可以檢測該靶點的所有亞型。

重組抗體是什么?
重組抗體,也稱為基因工程抗體,是指通過DNA重組技術(shù)將抗體相應(yīng)的基因序列根據(jù)需要進(jìn)行改造和重組,并構(gòu)建在質(zhì)粒上,再通過蛋白外源表達(dá)技術(shù)將構(gòu)建好的質(zhì)粒轉(zhuǎn)染/轉(zhuǎn)化入適合的宿主細(xì)胞表達(dá)獲得的抗體。屬于第三代抗體制備技術(shù),優(yōu)點是不會遭受與傳統(tǒng)單克隆抗體相同的遺傳漂移,從而確保了批次之間的一致性和質(zhì)量。
其他知識點
濃度
廠家推薦濃度一般為一個區(qū)間,可以在正式實驗前設(shè)置3-5個濃度梯度,做一次預(yù)實驗,選擇一個最佳濃度做正式實驗。
修復(fù)方式
廠家一般會推薦一個修復(fù)方式,根據(jù)不同實驗和組織選擇即可,一般有EDTA9.0、EDTA8.0、檸檬酸鈉(枸櫞酸)6.0。
細(xì)胞定位
抗體廠家大部分會告訴你亞細(xì)胞定位,就是靶蛋白的表達(dá)位置,知道在哪里表達(dá),可以作為實驗時排除假陽性的參考。
二抗后的(H+L)
H表示重鏈,L表示輕鏈。(H+L)表示用靶標(biāo)蛋白分子的重鏈和輕鏈來免疫兔子產(chǎn)生的抗體。
購買
抗體可以直接從官網(wǎng)購買,也可以從我們這種實驗室購買,可以走渠道價,有個8-9折優(yōu)惠,需要的可以文末微信。
實際問題
1、有時候抗體官網(wǎng)會有沒測試過的種屬或?qū)嶒?,預(yù)測可用于某某種屬,這個時候是用還是不用呢?
我的建議是如果實在是沒有找到測試過的抗體可以買,那就可以用。
2、官網(wǎng)適用實驗沒有自己要做的實驗或濃度怎么辦?
有的只有IHC或IF其中一個實驗的推薦濃度,這個時候就可以把二者互用。
還有的時候是只有WB沒有IHC,可以將WB的濃度縮小1000倍用于IHC。
以上兩種情況,我是實際做過的,可以做出來,其他沒做過。
抗體使用保存
收到
收到新抗體后首先要做的是:對裝有抗體的小瓶進(jìn)行離心。運輸過程中,瓶內(nèi)液體發(fā)生晃動,因此會有液體滯留在蓋子上。將小瓶放在離心機(jī)上快速離心(10,000 xg,20 秒),可以確保珍貴的抗體回落到小瓶底部,以確保抗體全部可用。
存儲
關(guān)于儲存,請記住,反復(fù)凍融可使抗體變性,使其形成聚合物,從而降低抗體的結(jié)合能力。下面關(guān)于原液和工作液存儲方式逐個說明。
原液(儲存液):一般標(biāo)注存儲-20°的會含有甘油,放-20不會凍住,標(biāo)注存儲-4°的放4°就行,放-20°會凍住。
工作液:按比例稀釋后沒用完或回收的工作液,放4°即可,不要放-20°。如果想長時間保存,稀釋液里應(yīng)該加抑菌防腐劑,但最好不要加疊氮化鈉,因為會影響HRP的活性,而且會對大部分生物體都有毒害作用,可以使用proclin。稀釋液加了抑菌防腐劑,2個月內(nèi)用沒什么影響。
避免使用無霜冰箱,抗體應(yīng)該放置于冰箱中溫度變化最小的部位,如應(yīng)放置于冰箱格里,而不應(yīng)放置于冰箱門上。
對照設(shè)置
陽性對照:抗體官網(wǎng)都會告訴你什么組織或細(xì)胞是陽性對照,可以在做實驗時用同樣濃度做一張,假如最后樣本靶標(biāo)蛋白的結(jié)果呈陰性,陽性對照呈陽性,這就說明試劑和實驗操作是沒問題的,可能組織不表達(dá)靶標(biāo)單標(biāo)。如果陽性對照也呈陰性,說明試劑或?qū)嶒灢僮魇怯袉栴}的。
陰性對照:可以用PBS替代一抗,其他不變。如果陰性對照呈現(xiàn)陽性結(jié)果,說明結(jié)果是假陽性。實驗操作或試劑應(yīng)該有問題。
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免責(zé)聲明
本方案僅用于科研實驗,不適用于臨床。