單細(xì)胞蛋白質(zhì)組學(xué)你了解多少?——極微量樣本檢測
編者按
細(xì)胞是生命體的最小組成單位,細(xì)胞內(nèi)蛋白質(zhì)組豐度的動態(tài)變化對各種生命過程有重要影響。傳統(tǒng)的蛋白組學(xué)是針對組織或者大量細(xì)胞樣本進(jìn)行分析,獲得的是均質(zhì)化后的結(jié)果,掩蓋了單細(xì)胞的個體差異。單細(xì)胞蛋白組可對單個細(xì)胞蛋白進(jìn)行定性定量分析,實(shí)現(xiàn)細(xì)胞異質(zhì)性研究,揭示細(xì)胞個體之間的精細(xì)差異,對細(xì)胞及腫瘤異質(zhì)性分析、特定細(xì)胞類型分析、循環(huán)腫瘤細(xì)胞(CTC)分析、免疫研究和微量/稀有樣本研究提供了強(qiáng)大的分析手段。
鹿明生物蛋白部建立了基于tims TOF Pro2平臺的單細(xì)胞蛋白組分析方案,實(shí)驗(yàn)采用流式分選儀對細(xì)胞進(jìn)行特定類群或特定個數(shù)進(jìn)行分群,選用目前靈敏度和掃描速度最高的tims TOF Pro2 4D蛋白組平臺進(jìn)行檢測,采用無偏差的DIA模式(Data independent acquisition,數(shù)據(jù)非依賴性采集模式)進(jìn)行數(shù)據(jù)采集并提供蛋白定性定量結(jié)果,為客戶提供了從百細(xì)胞分選到百細(xì)胞蛋白質(zhì)組學(xué)檢測的一站式服務(wù),通過蛋白質(zhì)層面的檢測,最接近細(xì)胞的調(diào)控本質(zhì),能夠更加深刻和準(zhǔn)確理解疾病的根本原因,在腫瘤、免疫以及生殖發(fā)育領(lǐng)域都具有極大的研究價值。
技術(shù)流程
產(chǎn)品優(yōu)勢
1.多:基于質(zhì)譜平臺檢測,通量高、不受樣品數(shù)量的限制;
2.快:采用最新的tims TOF Pro2平臺,結(jié)合Evoseq實(shí)現(xiàn)更快更深更準(zhǔn)的檢測;
3.精:可實(shí)現(xiàn)低至單個細(xì)胞的蛋白定性定量分析,揭示細(xì)胞個體之間的精細(xì)差異;
4.準(zhǔn):采用DIA全景式質(zhì)譜掃描,有利于低豐度蛋白檢測和準(zhǔn)確定量;
5.全:蛋白鑒定種類全,不受抗體的可用性和特異性限制;
6.深:可對極微量/珍稀樣本進(jìn)行高深度蛋白組檢測;
應(yīng)用領(lǐng)域
服務(wù)優(yōu)勢
數(shù)據(jù)結(jié)果展示
分析內(nèi)容展示
送樣指南
補(bǔ)充說明
1.本實(shí)驗(yàn)無法進(jìn)行蛋白定量及SDS-PAGE質(zhì)檢,如果為已經(jīng)分選好直接上機(jī)的樣本,請務(wù)必保證細(xì)胞準(zhǔn)確計(jì)數(shù)。
2.如需要公司提供流式分選服務(wù)的請務(wù)必提前進(jìn)行咨詢溝通方案及費(fèi)用。
3.單類群細(xì)胞分選細(xì)胞數(shù)量建議≥10個,如需要使用更少細(xì)胞請?zhí)崆白稍儭?/p>
參考文獻(xiàn)
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5. Gebreyesus ST., Streamlined single-cell proteomics by an integrated microfluidic chip and data-independent acquisition mass spectrometry. Nature Communications, 2022
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鹿明公司簡介
鹿明生物成立以來一直專注于生命科學(xué)和生命技術(shù)領(lǐng)域,在蛋白組領(lǐng)域超過10年的技術(shù)沉淀及不斷研發(fā)創(chuàng)新,已成為國內(nèi)早期開展蛋白質(zhì)組且提供優(yōu)質(zhì)技術(shù)服務(wù)的領(lǐng)先者,特別是隨著布魯克tims TOF 4D蛋白質(zhì)組質(zhì)譜平臺的引進(jìn),大幅提高的質(zhì)譜平臺的性能,隨著4D質(zhì)譜平臺進(jìn)行研發(fā)技改引領(lǐng)了蛋白組檢測的新標(biāo)準(zhǔn),并基于tims TOF平臺成功研發(fā)了單細(xì)胞蛋白質(zhì)組技術(shù)服務(wù),為低至單個細(xì)胞的極微量蛋白質(zhì)組研究提供強(qiáng)大的分析工具。
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