凌恩明星產(chǎn)品eDNA再升級(jí):海洋脊椎動(dòng)物數(shù)據(jù)庫(kù)上線?。?/h1>


凌恩生物明星產(chǎn)品魚類eDNA產(chǎn)品再次大升級(jí)!海洋脊椎動(dòng)物數(shù)據(jù)庫(kù)個(gè)性化定制服務(wù)上線!自建海洋脊椎動(dòng)物個(gè)性化數(shù)據(jù)庫(kù),更全面的物種分類,更完善的分析內(nèi)容??!
eDNA宏條形碼技術(shù)在海洋物種多樣性調(diào)查研究中的優(yōu)勢(shì)明顯,相比于傳統(tǒng)的捕撈、拖網(wǎng)監(jiān)測(cè)技術(shù),eDNA宏條形碼技術(shù)靈敏度更高,能夠檢出更多的海洋脊索物種,并且具有高時(shí)效性,在水生生態(tài)系統(tǒng)物種監(jiān)測(cè)中的意義不可低估。凌恩生物基于MitoFish和GenBank等公共數(shù)據(jù)庫(kù),自建了覆蓋全面、準(zhǔn)確、豐富的海洋脊椎動(dòng)物個(gè)性化數(shù)據(jù)庫(kù),包括魚類、海洋哺乳動(dòng)物(鯨類、海象、海獅、海豹等)。本次升級(jí)的海洋脊椎動(dòng)物數(shù)據(jù)庫(kù)數(shù)據(jù)庫(kù)具體信息如下:
脊索動(dòng)物線粒體基因組數(shù)據(jù)庫(kù)mitogenomes(http://mitofish.aori.u-tokyo.ac.jp/download.html),最新版本含有線粒體序列數(shù)量:811468,原來老版本序列數(shù)量:705284;提升比例:15%。



FishCOI數(shù)據(jù)庫(kù),根據(jù)最新Genbank數(shù)據(jù)整理,最新版本收錄線粒體序列數(shù)量:223373。原來老版本序列數(shù)量:189372;提升比例:18%。


首次添加Cetacea鯨目物種;1個(gè)綱,1個(gè)目(Artiodactyla偶蹄目),13個(gè)科,35個(gè)屬,62個(gè)種。

首次添加Carnivora食肉目物種:3個(gè)科(Odobenidae海象科,Otariidae海獅科,Phocidae海豹科),21個(gè)屬,36個(gè)種。
更完整的海水、淡水魚類分類,包括18686個(gè)淡水魚類名錄、17828 個(gè)海水魚類名錄。
增加瀕危物種魚類分析:查詢“中國(guó)生物多樣性紅色名錄”得到瀕危魚類數(shù)量:1586個(gè),其中1322個(gè)淡水魚類、65個(gè)海水魚類、264個(gè)無法分類。
物種添加了中文名稱描述,更適合中國(guó)老師,例如:“d__Eukaryota;p__Chordata;c__Actinopteri;o__Cypriniformes;f__Xenocyprididae;g__Hypophthalmichthys;s__Hypophthalmichthysmolitrix”,中文名為:“脊索動(dòng)物門;輻鰭魚綱;鯉形目;鰓魚科;鱘鰱屬;鰱魚”。
添加了魚類物種圖片,更利于老師分析。
增加潛在外來物種檢測(cè)分析。
老師自選物種構(gòu)建個(gè)性化數(shù)據(jù)庫(kù)。
凌恩生物海洋脊索動(dòng)物eDNA項(xiàng)目結(jié)題報(bào)告增加分析內(nèi)容:
1、增加各分類水平魚類拉丁名對(duì)應(yīng)的中文名稱

2、增加瀕危物種魚類統(tǒng)計(jì)分析,瀕危等級(jí)(https://m.thepaper.cn/baijiahao_12141475):滅絕(EX)、極危(CR)、瀕危(EN)、易危(VU)、近危(NT)、無危(LC)、數(shù)據(jù)缺乏(DD)。

3、增加每檢出種魚類的圖片結(jié)果目錄:fish-figure/,檢出魚類圖片,文件名即對(duì)應(yīng)魚類:g__屬名_s__種名.圖片編號(hào).jpg。

4、潛在外來物種識(shí)別統(tǒng)計(jì)分析,根據(jù)檢出的魚類物種名稱,在FishBase數(shù)據(jù)庫(kù)中獲得該物種在全球水環(huán)境中的主要分布地區(qū),結(jié)果如下表所示,根據(jù)物種主要分布地區(qū)與研究地區(qū)的比較,識(shí)別可能的外來入侵物種。

部分分析圖片展示:

快來聯(lián)系我們,開展海洋脊索動(dòng)物eDNA項(xiàng)目檢測(cè)分析吧!!