geneXplain 很高興與您分享一篇由我們的用戶(hù)最近發(fā)表的文章 “巨噬細(xì)胞介導(dǎo)的伯氏疏螺旋體識(shí)別和清除引發(fā)了 MyD88 并促進(jìn)吞噬作用和炎癥”，其中 MyD88/TLR 信號(hào)增強(qiáng)清除的機(jī)制研究了巨噬細(xì)胞對(duì)伯氏疏螺旋體 (Bb) 的影響，這表明 MyD88 信號(hào)增強(qiáng)，不是細(xì)菌攝取或吞噬體成熟必需的。該出版物還提供了有關(guān) MyD88 介導(dǎo)的吞噬體信號(hào)傳導(dǎo)如何增強(qiáng) Bb 攝取和清除的機(jī)制見(jiàn)解。

研究者從野生型和MyD88-/-骨髓來(lái)源的巨噬細(xì)胞的三個(gè)生物重復(fù)樣本中提取RNA-seq數(shù)據(jù)，這些刺激物不受Bb刺激或刺激。使用來(lái)自 TRANSFAC 文庫(kù)的 DNA 結(jié)合基序分析了差異表達(dá)基因啟動(dòng)子中的轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合位點(diǎn)。在已識(shí)別轉(zhuǎn)錄因子上游的信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)通路中進(jìn)一步搜索主調(diào)控分子，并最終使用geneXplain平臺(tái)構(gòu)建網(wǎng)絡(luò)，該平臺(tái)允許加入網(wǎng)絡(luò)上的三個(gè)已識(shí)別層：DEG、轉(zhuǎn)錄因子和主調(diào)節(jié)器。

研究結(jié)果表明，MyD88 缺陷型巨噬細(xì)胞顯示出類(lèi)似的結(jié)合，但 Bb 的吸收減少。MyD88 被證明是轉(zhuǎn)錄因子的主要調(diào)節(jié)因子，這些因子控制富含攝取過(guò)程的 MyD88 依賴(lài)性 DEG。結(jié)果表明，MyD88信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)上調(diào)參與調(diào)節(jié)巨噬細(xì)胞膜突起的多個(gè)基因產(chǎn)物。這些基因的上調(diào)可能有助于細(xì)胞機(jī)器的重組，從而增強(qiáng)野生型巨噬細(xì)胞吸收螺旋體的能力。

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https://link.springer.com/article/10.1186/s12865-021-00418-8?fbclid=IwAR0PpiCoK8_PPrb-HVKZ0F1F6tXmAOCJhQxJq2dIccVnhDWynHEzdM_MpvE