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[BioLadder云平臺] 頻率分布直方圖、折線圖

2022-05-13 10:12 作者:青蓮百奧  | 我要投稿

大家好!我是BioLadder生物信息在線可視化云平臺的工程師小宇,今天我來給大家分享怎樣用BioLadder畫出常見的頻率分布直方圖、折線圖!

?如果您反饋問題,報告Bug,提出新的需求,請直接在公眾號內(nèi)發(fā)留言給我哦!為感謝您對BioLadder的認可我們還有星爸爸同款收納包相贈哦!小宇先謝謝大家嘍!

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1.什么是頻率分布直方圖、折線圖?

頻率分布直方圖:它是用柱狀圖展現(xiàn)一組數(shù)據(jù)的分布情況,表示不同數(shù)據(jù)出現(xiàn)的頻率。

它以組距為橫坐標軸,以頻數(shù)/組距為縱軸連接組合成一個個矩形圖。由于每個矩形圖的橫軸是組距,縱軸是頻數(shù)/組距,因此每個矩形圖的面積代表的就是頻數(shù)。

頻率分布折線圖就是用折線代替柱形,所表達的含義是相似的。

?本文我們就來討論一下頻率分布直方圖、折線圖是如何繪制的。


2.繪圖前的數(shù)據(jù)準備

demo數(shù)據(jù)可以在https://www.bioladder.cn/shiny/zyp/bioladder2/model/ggplot2/densityBar/demo.xlsx下載。

本工具支持在一個圖上畫多個頻率分布直方圖,所以數(shù)據(jù)是2個維度的,行名和列名必須要有。每一列數(shù)據(jù)都會繪制一個圖形。


3. BioLadder生信云平臺在線繪制頻率分布直方圖、折線圖

不想寫代碼?可以用BioLadder生信云平臺在線繪制頻率分布直方圖、折線圖。

網(wǎng)址:https://www.bioladder.cn/web/#/chart/27

?

3.1?上傳文件

點擊“選擇”按鈕上傳自己的文件

備注:

點擊查看按鈕可以查看自己的上傳的數(shù)據(jù);點擊下載示例,可以下載demo數(shù)據(jù);

支持txt,csv,xlsx,xls四種格式;


3.2.1頻率分布直方圖、折線圖特有參數(shù)

根據(jù)需求調(diào)整參數(shù)即可

??對數(shù)處理:可以對數(shù)據(jù)做任意底數(shù)的處理

??展現(xiàn)樣式:在這里選擇繪制直方圖還是折線圖

??展先形式:堆積所有組的圖形放到一塊,便于觀察每組的相對分布情況;分層,反之。

??分成多少個區(qū)間:將數(shù)據(jù)分成多少個區(qū)間,生成多少根柱子


3.2.2?通用參數(shù)

??坐標軸選項卡:可以調(diào)整坐標軸名字,刻度大小,方向,圖例位置大小等

?

??顏色選項卡:可以調(diào)整圖案顏色,以及可以選擇畫板背景主題。


3.3?提交查看

上傳完數(shù)據(jù),并調(diào)好參數(shù)后,點擊右上方“提交”按鈕,圖像會出現(xiàn)在左側(cè)。如果沒有上傳自己的數(shù)據(jù),會使用默認的demo數(shù)據(jù)繪圖。


3.4?下載

可以直接點擊下載按鈕,快捷下載當(dāng)前所看到的圖形。也可以點擊更多選項,對圖片的寬高,格式等做調(diào)整。

?


更多選項里,可以手動拖拽調(diào)整圖片大小,也可以在下方的輸入框內(nèi)直接輸入想要的大小,支持下載PNG,PDF,SVG,JPEG,BMP,EPS,TIFF等多種格式。備注:關(guān)于分辨率DPI的解釋,分辨率(DPI)指的是圖像每英寸長度內(nèi)的像素點數(shù)。假如需要長10英寸,寬10英寸的,分辨率300的圖片。對應(yīng)的電腦里的像素就是10*300=3000像素。


4.BioLadder生物信息在線分析可視化云平臺

網(wǎng)址:https://www.bioladder.cn/BioLadder目前上線了生物學(xué)分析最常用的50多個模塊,主要包括以下四類:數(shù)據(jù)可視化:箱線圖,南丁格爾玫瑰圖,韋恩圖,UpSet圖,餅圖,詞云圖,小提琴圖,餅圖/甜甜圈圖,弦圖,柱形圖等組學(xué)數(shù)據(jù)分析序列的多重比對,表達數(shù)據(jù)的CV曲線圖,餅圖/甜甜圈圖,T-SNE,熱圖,趨勢分析的mFuzz,差異分析的火山圖,富集分析的氣泡圖,修飾位點上下游模體分析的seqLogo,Motif熱圖等功能分析:GO弦圖,相互作用網(wǎng)絡(luò)圖,富集分析數(shù)據(jù)預(yù)處理:歸一化,補值,F(xiàn)DR校正,長寬表互換等


好了頻率分布直方圖、折線圖的繪制就到這里了,后續(xù)大家想要了解什么內(nèi)容可以給我們評論反饋,我們會根據(jù)大家的意見持續(xù)更新。我們歡迎您以任何方式提出您的優(yōu)化意見,使BioLadder平臺成為廣大科研工作者的生物信息分析首選平臺!

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