更大的數(shù)據(jù)庫,更多的分析內(nèi)容!凌恩明星產(chǎn)品魚類eDNA產(chǎn)品再次大升級??!


喜大普奔,凌恩生物明星產(chǎn)品魚類eDNA產(chǎn)品再次大升級!自建魚類數(shù)據(jù)庫,本次升級獲得了更大的數(shù)據(jù)庫,更全面的物種分類,更多的分析內(nèi)容,魚類物種檢測更加精準(zhǔn)?。?/strong>
eDNA宏條形碼技術(shù)在魚類多樣性調(diào)查研究中的優(yōu)勢明顯,相比于傳統(tǒng)的捕撈、拖網(wǎng)監(jiān)測技術(shù),eDNA宏條形碼技術(shù)靈敏度更高,能夠檢出更多的魚類物種,有效區(qū)分海水和淡水魚類,并且具有高時效性,在水生生態(tài)系統(tǒng)物種監(jiān)測中的意義不可低估。


凌恩生物基于MitoFish和GenBank等公共數(shù)據(jù)庫,自建了覆蓋全面、準(zhǔn)確、豐富的MitoFish數(shù)據(jù)庫和Genbank魚類線粒體數(shù)據(jù)庫。本次升級的魚類eDNA數(shù)據(jù)庫具體信息如下:
魚類線粒體基因組數(shù)據(jù)庫mitogenomes(http://mitofish.aori.u-tokyo.ac.jp/download.html),最新版本含有線粒體序列數(shù)量:811468,原來老版本序列數(shù)量:705284;提升比例:15%。



魚類線粒體COI基因數(shù)據(jù)庫(FishCOI),根據(jù)最新Genbank數(shù)據(jù)整理,最新版本含有線粒體序列數(shù)量:223373。原來老版本序列數(shù)量:189372;提升比例:18%。


更完整的海水,淡水魚類分類,包括18686個淡水魚類名錄、17828 個海水魚類名錄。
增加瀕危物種魚類分析:查詢“中國生物多樣性紅色名錄”得到瀕危魚類數(shù)量:1586個,其中1322個淡水魚類、65個海水魚類、264個無法分類。
物種添加了中文名稱描述,更適合中國老師,例如:“d__Eukaryota;p__Chordata;c__Actinopteri;o__Cypriniformes;f__Xenocyprididae;g__Hypophthalmichthys;s__Hypophthalmichthys molitrix”,中文名為:“脊索動物門;輻鰭魚綱;鯉形目;鰓魚科;鱘鰱屬;鰱魚”。
添加了魚類物種圖片,更利于老師分析。
增加潛在外來物種檢測分析。
凌恩生物魚類eDNA項(xiàng)目結(jié)題報告增加分析內(nèi)容:
1、增加各分類水平魚類拉丁名對應(yīng)的中文名稱

2、增加瀕危物種魚類統(tǒng)計(jì)分析,瀕危等級(https://m.thepaper.cn/baijiahao_12141475):滅絕(EX)、極危(CR)、瀕危(EN)、易危(VU)、近危(NT)、無危(LC)、數(shù)據(jù)缺乏(DD)。

3、增加每檢出種魚類的圖片結(jié)果目錄:fish-figure/,檢出魚類圖片,文件名即對應(yīng)魚類:g__屬名_s__種名.圖片編號.jpg。

4、潛在外來物種識別統(tǒng)計(jì)分析,根據(jù)檢出的魚類物種名稱,在FishBase數(shù)據(jù)庫中獲得該物種在全球水環(huán)境中的主要分布地區(qū),結(jié)果如下表所示,根據(jù)物種主要分布地區(qū)與研究地區(qū)的比較,識別可能的外來入侵物種。

部分分析圖片展示:

還在等什么呢?快來聯(lián)系我們,開展魚類eDNA項(xiàng)目檢測分析吧?。?/p>