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“瀕危動物保護”運用基因組學建模有助于闡明如何拯救瀕危動物

2022-06-08 08:24 作者:上海歐易生物  | 我要投稿

前 言


在2019年,國際自然保護聯(lián)盟(IUCN)將7500多種動物、其中包括許多魚類和一些植物列入瀕危物種“紅色名單”。人類對自然的破壞正導致物種以“前所未有”的速度滅絕。一個關鍵物種的滅絕就有可能破壞當地的食物鏈,造成生態(tài)系統(tǒng)的不穩(wěn)定,甚至將導致整個生態(tài)系統(tǒng)的崩潰。人類必須利用現有的一系列技術成果來拯救那些瀕臨滅絕的物種。有文章就該問題提出以下十種促進物種保護的工作——哈勃望遠鏡技術識別鯨鯊、GPS收集大猩猩信息、克隆技術-最后的選擇、手機SIM芯片保護大象、無人機追蹤海豹、聲波成像確定石斑魚數量、基因測序助袋獾擺脫疾病、PIT標記魚類活動、脫鹽廠為羚羊提供淡水、通過網站或手機應用提高公眾關注度。


2021年5月27日,國家林業(yè)與草原局發(fā)布《關于對擬公布的第三批國家林木種質資源庫名單進行公示的公告》。在此之前,國家僅在林木方面已經公布了99處省級種質資源庫。另外,在地方政府的支持下,地區(qū)性的種質資源庫也處于積極的建設當中,而且數量還在不斷提升。在迎來測序技術的快速發(fā)展之后,保護動植物也發(fā)展出了新的方法和途徑。



基因組學促進動植物保護政策


2022年5月5日,一篇名為《Using genomics to fight extinction》的文章發(fā)表于雜志《Science》,文章中Robinson等人使用小頭鼠海豚 ( Phocoena sinus ) 的基因組數據進行報告——以檢查遺傳多樣性并預測其對未來種群數量變化可能造成的影響。他們得出的結論是:如果誤捕減少,該物種能顯示出克服遺傳威脅的潛力。該分析說明了基因組學可以在動植物保護政策的制定和實施方面提供一些幫助。



2019年7月19日,文章《Genomics guides help for dwindling species》同樣表明基因組學有助于物種減少,并提出長期研究+建模有助于闡明如何拯救基因和物種多樣性。



2bRAD-M助力物種生活環(huán)境檢測


除了對物種本身進行測序檢測之外,物種生活的環(huán)境以及自生內環(huán)境同樣也是影響物種生存的重要方面。2bRAD-M技術在此之中能夠達到種水平的物種檢測分辨率,一次測序可同時檢測細菌、真菌和古菌,面對這種較難捕獲的瀕危物種、困難的生活環(huán)境以及物種自身可能出現的低生物量(pg級別DNA)樣本、嚴重降解樣本(如FFPE)和高宿主污染樣本該技術也能做出有效的鑒定。




除了針對瀕危物種,測序技術對于普通物種包括人類自身也有積極的作用:通過對大量人類樣本的分析與統(tǒng)計,可以構建出健康、亞健康、患病等多種身體器官組織的菌群模型,以此在醫(yī)療上可以精準地達到分析、預防或治療疾病的效果。


對于瀕危物種,除了利用現有的技術對其加以保護以外,更重要的是上面所提及的通過網站或手機應用提高公眾關注度,減少人類活動對于瀕危物種的影響。


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