fisher卡方案例解讀
SPSSAU-在線SPSS分析軟件
Fisher卡方
卡方檢驗研究數(shù)據(jù)的獨立性,在分析樣本量較少(比如小于40),也或者期望頻數(shù)出現(xiàn)小于5時,此時使用fisher卡方檢驗較為適合。SPSSAU醫(yī)學(xué)研究模塊中的卡方檢驗時,有提供2*2即4表格時提供fisher卡方檢驗p值,但當(dāng)為R*C結(jié)構(gòu)時,也或者為匯總表格數(shù)據(jù)時,可使用fisher卡方按鈕單獨進(jìn)行計算。
fisher卡方理論依據(jù)為超幾何分布,其利用排列的數(shù)學(xué)原理進(jìn)行計算,在樣本量較大計算量非常大,并且fisher卡方基本上均是針對小樣本量數(shù)據(jù)進(jìn)行計算,因而SPSSAU在總樣本量大于200時依舊不提供fisher卡方檢驗值。
特別提示:
SPSSAU系統(tǒng)中共有3處(包括通用方法->交叉卡方,醫(yī)學(xué)研究->卡方檢驗,醫(yī)學(xué)研究->fisher卡方)提供pearson卡方檢驗值;
SPSSAU系統(tǒng)中共有2處(醫(yī)學(xué)研究->卡方檢驗,此處僅提供2*2時fisher卡方檢驗值,醫(yī)學(xué)研究->fisher卡方)提供fisher卡方檢驗。
Fisher卡方檢驗
1 背景
當(dāng)前有一項HBV感染醫(yī)學(xué)研究,并被試分為預(yù)防組和非預(yù)防組,共兩組,并且記錄陽性和陰性的數(shù)據(jù),匯總?cè)缦卤?,似問兩組數(shù)據(jù)HBV感染率有無差別?數(shù)據(jù)如下:
2 理論
Fisher卡方檢驗利用超幾何分布原理進(jìn)行計算,共不同與pearson卡方檢驗會提供卡方值和p值兩項。Fisher卡方檢驗時僅提供p值。SPSSAU在醫(yī)學(xué)研究模塊->卡方檢驗方法中提供2*2時卡方檢驗,如果是匯總表格格式,也或者R*C結(jié)構(gòu)時,可使用fisher卡方按鈕完成計算。
3 操作
本案例操作如下,A1單元格一定要空著,并且放入的數(shù)據(jù)不包括合計數(shù)據(jù),如下圖:
4 SPSSAU輸出結(jié)果
SPSSAU共輸出3個表格,如下說明:
5文字分析
上表格展示出fisher卡方、pearson卡方和連續(xù)校正卡方統(tǒng)計量,從上表可知:fisher卡方時僅提供p值,而且從pearson卡方和連續(xù)校正卡方對應(yīng)的p值來看,3個值均呈現(xiàn)出一致性結(jié)論即:預(yù)防組與非預(yù)防組時HPV感染情況無明顯差異。
特別提示:
通常情況下:如果總樣本量>40且期望頻數(shù)值全部均大于5時,一般使用pearshon卡方值,如果總樣本量大于40,但出現(xiàn)期望頻數(shù)小于5的單元格時,可優(yōu)先使用連續(xù)校正卡方,也或者使用fisher卡方值,如果總樣本量小于40,也或者出現(xiàn)期望頻數(shù)小于1的單元格時,此時建議使用fisher卡方檢驗。具體以文獻(xiàn)為準(zhǔn)即可,可能不同文獻(xiàn)的標(biāo)準(zhǔn)不完全一致。
上表格展示各單元格的期望頻數(shù),上表格可以看到,非預(yù)防組陽性的期望頻數(shù)為3.0<5,并且總樣本量為33,因而本案例數(shù)據(jù)使用fisher卡方檢驗量較為適合。
上表格展示實際頻數(shù),并且可通過下拉選擇切換展示效果,按頻數(shù)或者按百分比展示。
6 剖析
涉及以下幾個關(guān)鍵點,分別如下:
如果希望進(jìn)行卡方多重比較等,需要使用SPSSAU醫(yī)學(xué)研究模塊里面的卡方檢驗功能;
如果總樣本量大于200時,此時SPSSAU不提供fisher卡方檢驗量,但依舊提供perason統(tǒng)計量和連續(xù)校統(tǒng)計量。