【圖像分割】基于SDD、Otsu 和自適應(yīng)閾值的U2OS 細(xì)胞圖像分割算法研究對(duì)比附matlab代
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智能優(yōu)化算法?? ? ??神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)預(yù)測(cè)?? ? ??雷達(dá)通信?? ? ?無線傳感器?? ? ? ?電力系統(tǒng)
信號(hào)處理?? ? ? ? ? ? ?圖像處理?? ? ? ? ? ? ??路徑規(guī)劃?? ? ??元胞自動(dòng)機(jī)?? ? ? ?無人機(jī)
?? 內(nèi)容介紹
圖像分割是計(jì)算機(jī)視覺領(lǐng)域中的一個(gè)重要研究方向,它旨在將圖像劃分成具有獨(dú)立含義的區(qū)域。在生物醫(yī)學(xué)領(lǐng)域中,圖像分割在細(xì)胞圖像分析中起著關(guān)鍵作用,可以幫助研究人員定量分析細(xì)胞形態(tài)、數(shù)量和分布等信息。本文將重點(diǎn)研究并比較基于SDD、Otsu和自適應(yīng)閾值的U2OS細(xì)胞圖像分割算法。
SDD(Spatial Distance Distribution)是一種基于空間距離分布的圖像分割方法。它通過計(jì)算圖像中各像素點(diǎn)與其周圍像素點(diǎn)之間的空間距離,將圖像分割成不同的區(qū)域。SDD算法的步驟包括:首先,計(jì)算每個(gè)像素點(diǎn)與周圍像素點(diǎn)之間的距離;然后,根據(jù)距離計(jì)算結(jié)果對(duì)圖像進(jìn)行分割;最后,根據(jù)分割結(jié)果進(jìn)行后續(xù)的細(xì)胞形態(tài)分析。
Otsu算法是一種基于灰度級(jí)別的圖像分割方法。它通過計(jì)算圖像中不同灰度級(jí)別的像素點(diǎn)的方差和類間方差,找到一個(gè)最佳的閾值,將圖像分割成兩個(gè)區(qū)域。Otsu算法的步驟包括:首先,計(jì)算圖像中每個(gè)灰度級(jí)別的像素點(diǎn)的頻率分布;然后,根據(jù)頻率分布計(jì)算類內(nèi)方差和類間方差;最后,選擇一個(gè)使得類間方差最大的閾值,將圖像分割成兩個(gè)區(qū)域。
自適應(yīng)閾值算法是一種基于局部像素灰度的圖像分割方法。它通過計(jì)算圖像中每個(gè)像素點(diǎn)周圍區(qū)域的平均灰度值,將圖像分割成不同的區(qū)域。自適應(yīng)閾值算法的步驟包括:首先,選擇一個(gè)合適的窗口大小,用于計(jì)算每個(gè)像素點(diǎn)周圍區(qū)域的平均灰度值;然后,根據(jù)平均灰度值和像素點(diǎn)的灰度值進(jìn)行分割;最后,根據(jù)分割結(jié)果進(jìn)行后續(xù)的細(xì)胞形態(tài)分析。
在對(duì)比這三種算法時(shí),我們可以從以下幾個(gè)方面進(jìn)行評(píng)估:準(zhǔn)確性、計(jì)算效率和對(duì)噪聲的魯棒性。準(zhǔn)確性是衡量算法分割結(jié)果與真實(shí)分割結(jié)果的一致性,計(jì)算效率是衡量算法運(yùn)行時(shí)間的快慢,對(duì)噪聲的魯棒性是衡量算法對(duì)圖像噪聲的抗干擾能力。
根據(jù)以往的研究成果,SDD算法在準(zhǔn)確性方面表現(xiàn)出色,能夠較好地分割細(xì)胞圖像。然而,由于其計(jì)算復(fù)雜度較高,導(dǎo)致其計(jì)算效率相對(duì)較低。Otsu算法在計(jì)算效率方面具有優(yōu)勢(shì),但在處理噪聲方面表現(xiàn)一般。自適應(yīng)閾值算法在計(jì)算效率和對(duì)噪聲的魯棒性方面都表現(xiàn)較好,但在準(zhǔn)確性方面稍遜于SDD算法。
綜上所述,基于SDD、Otsu和自適應(yīng)閾值的U2OS細(xì)胞圖像分割算法各有優(yōu)勢(shì)和劣勢(shì)。在實(shí)際應(yīng)用中,可以根據(jù)具體需求選擇合適的算法。如果準(zhǔn)確性是首要考慮因素,可以選擇SDD算法;如果計(jì)算效率是重要考慮因素,可以選擇Otsu算法;如果對(duì)噪聲的魯棒性是關(guān)鍵考慮因素,可以選擇自適應(yīng)閾值算法。未來的研究可以探索將這些算法進(jìn)行組合或優(yōu)化,以提高細(xì)胞圖像分割的準(zhǔn)確性和計(jì)算效率。
?? 部分代碼
function [F,Pre,Recall,TP,FP,FN,numo]=cell_measures(I,G)
% if max(max(I))>0
TP=0;FP=0;FN=0;
[xg,yg]=size(G);
G(1,:)=0;G(xg,:)=0;G(:,1)=0;G(:,yg)=0;
G=bwareaopen(G,15,4);
I=bwareaopen(I,15,4);
[L1,~]=bwlabel(I,4);
S=regionprops(L1,'Centroid');
Centroids=cat(1,S.Centroid);
[numfp,~]=size(Centroids);
xs=Centroids(:,1);ys=Centroids(:,2);
[L,num]=bwlabel(G,8);
numo=num;
R1=logical(zeros(size(G)));
for i=1:num
? ?R=logical(zeros(size(G)));
? ?R(find(L==i))=1;
% ? ? figure,imshow(R),hold on,plot(xs,ys,'r.','MarkerSize',25);
? ?bwg=bwboundaries(R,4,'noholes');
? ?[in,on]=inpolygon(xs,ys,bwg{1}(:,2),bwg{1}(:,1));
? ?if numel(xs(in))>1 %
? ? ? ?TP=TP+1;
? ? ? ?FP=FP+numel(xs(in))-1;
? ? ? ?numfp=numfp-numel(xs(in))-1;
? ?elseif numel(xs(in))==1 %
? ? ? ?TP=TP+1;
? ? ? ?numfp=numfp-1;
? ?end
? ?if numel(xs(on))>0 %
? ? ? ?FP=FP+numel(xs(on));
? ? ? ?numfp=numfp-numel(xs(on));
? ?end
? ?if numel(xs(in))==0
? ? ? ?FN=FN+1; ?
? ?end ?
end
FP=FP+numfp;
Pre=TP/(TP+FP);
Recall=TP/(TP+FN);
F=Pre*Recall*2/(Pre+Recall);
% end
?? 運(yùn)行結(jié)果


?? 參考文獻(xiàn)
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[2] 張博.基于邊緣檢測(cè)的細(xì)胞圖像分割方法研究與實(shí)現(xiàn)[D].武漢理工大學(xué)[2023-10-21].DOI:10.7666/d.y861308.
[3] 曹鳳,霍春寶.基于組織細(xì)胞的彩色圖像分割算法研究[J].遼寧工業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào):自然科學(xué)版, 2015, 35(2):4.DOI:10.15916/j.issn1674-3261.2015.02.002.