小分子蛋白跑Western blot(WB)時有什么需要注意的地方?
??一般來說分子量越小的蛋白條帶越易呈現(xiàn)出向四周彌散的趨勢,甚至最終看不到條帶,其原因是分子量越小的蛋白所能結(jié)合到的SDS也就越少,在電場作用下,蛋白向前遷移過程中會向四周彌散,最終呈現(xiàn)不出相應(yīng)的蛋白條帶??梢詤⒖家韵路椒ń鉀Q:
? (1)?一般20kd以下的蛋白,電泳選擇15%以上的膠。
? (2)增加濃縮膠比例,濃縮膠和分離膠為1:1,或者根據(jù)自身具體情況來調(diào)整,使蛋白樣品在分離前充分聚集、壓平,一定程度上有助于蛋白分離。
? (3)?縮短電泳的距離,可以減少蛋白遷移過程的彌散程度,但需要確保目的蛋白和內(nèi)參區(qū)分開。
? (4)電泳過程中注意降溫,溫度升高會加快小蛋白分子的運動,增加彌散速度。
? (5)轉(zhuǎn)膜液不要加SDS,要加10-20%的甲醇;甲醇的作用有兩方面:一是將小分子蛋白上的SDS洗脫,帶的負電荷減少,減慢移動速度,能有效防止其穿透PVDF膜;二是可以幫助轉(zhuǎn)到膜上的蛋白固定在膜上,使其不易脫落。
? (6)轉(zhuǎn)膜一定要選擇0.22μm的PVDF膜,17kd以下的蛋白基本會穿透0.45μm的膜;當穿透嚴重時,可以用兩張0.22μm膜疊加使用。
? (7)還可以減少轉(zhuǎn)膜時間,降低轉(zhuǎn)膜的電壓電流,200mA-250mA轉(zhuǎn)15-30min差不多就可以了。
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