隨著時空組學(xué)技術(shù)的發(fā)展，海量時空組數(shù)據(jù)將不斷涌現(xiàn)。如何高效智能地對時空數(shù)據(jù)進行分析，是當(dāng)前亟需解決的問題。為此，深圳華大生命科學(xué)研究院特推出STOmics Cloud。STOmics Cloud的出現(xiàn)，為充分探索時空組學(xué)數(shù)據(jù)提供了一個領(lǐng)先的數(shù)據(jù)分析平臺，它將大大提高生命科學(xué)領(lǐng)域的多組學(xué)數(shù)據(jù)分析效率，加速科研進程，助力科研轉(zhuǎn)化。

聚焦數(shù)據(jù)分析，賦能時空項目

STOmics Cloud聚焦時空組學(xué)，以項目為核心，可對項目數(shù)據(jù)及工具進行高效整合，實現(xiàn)數(shù)據(jù)分析過程可追溯，結(jié)果可復(fù)現(xiàn)，知識可分享，項目可協(xié)作等完善的項目分析體系。同時提供標(biāo)準(zhǔn)分析、高級分析、高分辨率可視化分析等多維服務(wù)，是一個領(lǐng)先的多組學(xué)數(shù)據(jù)分析平臺。

2月28日，全新升級的STOmics Cloud（beta）將正式上線，歡迎各位老師登錄體驗。

多功能上線，助力科研探索

01：高效項目協(xié)同，全過程可控可復(fù)現(xiàn)

STOmics Cloud以項目為空間，用戶可以自定義創(chuàng)建項目，并上傳數(shù)據(jù)、搭建流程、設(shè)置分析任務(wù)，對項目中的資產(chǎn)進行管理，同時可快速將數(shù)據(jù)和工具整合進項目中，實現(xiàn)多人在線協(xié)同分析。

02：批量標(biāo)準(zhǔn)分析，多組學(xué)分析全面支持

時空多組學(xué)分析流程（SAW, STOmics Analysis Workflow）是華大自主研發(fā)的工具算法，主要應(yīng)用于時空組學(xué)數(shù)據(jù)的標(biāo)準(zhǔn)分析。SAW整合了多個Stereo-seq空間組基因表達分析工具，這些工具可用于還原以及可視化測序數(shù)據(jù)在芯片上的空間表達信息。為了高效的完成時空fq到表達矩陣的標(biāo)準(zhǔn)分析，STOmics Cloud支持批量進行SAW標(biāo)準(zhǔn)分析，快速產(chǎn)出表達矩陣結(jié)果，加速項目分析研究進程。

03：零代碼高級分析，交付報告快速生成

STOmics Cloud高級分析集成常用的聚類、細胞注釋、細胞互作、擬時序分析、功能富集分析等算法工具。無生信、編程基礎(chǔ)的研究人員也可快速具備分析能力，通過在頁面自由調(diào)整參數(shù)，進行0代碼的交互式操作完成高級分析。

04：低代碼個性分析，科研數(shù)據(jù)靈活分析

STOmics Cloud部署了Jupyter notebook工具，并提供Python和R語言等相關(guān)常用時空軟件包環(huán)境，用戶可以便捷的在網(wǎng)頁上進行代碼開發(fā)，及時獲取富媒體結(jié)果內(nèi)容。同時，用戶可通過notebook自由安裝工具，如stereopy，scanpy，speteo，SingleR等編寫代碼，完成個性化分析挖掘。

STOmics Cloud個性化分析內(nèi)測中，正式開放敬請期待。

05：高分辨可視化，細胞水平交互探索

StereoMap是華大自主研發(fā)的可視化工具，支持圖像、表達矩陣等結(jié)果的可視化展示。最高可實現(xiàn)500 nm的分辨率，支持cellbin分辨率，提供單細胞級分析視角。同時，細胞分割、組織分割等圖像數(shù)據(jù)、圖層可隨意疊加展示，高清圖像渲染數(shù)秒完成，并支持套索、配準(zhǔn)等工具，以支持數(shù)據(jù)深入分析。

06：豐富公開庫，優(yōu)質(zhì)流程一鍵復(fù)用

利用STOmics Cloud的notebook可實現(xiàn)9大個性化生信分析流程，包括：多樣本批次整合、分群聚類、解卷積注釋、cellmask手動注釋、差異分析、GO&KEGG富集、空間軌跡推斷、RNA velocity、Cell cell communication等，用戶可一鍵添加到項目中使用。

即刻體驗新功能

STOmics Cloud（beta）已于2月28日正式上線，已注冊用戶掃描二維碼，即可一鍵登錄，解鎖更絲滑、更智能、更全面的時空數(shù)據(jù)分析體驗！未注冊用戶，請耐心等待，我們會逐步開放注冊權(quán)限。

滿足用戶需求，提供更強大的數(shù)據(jù)分析工具是STOmics Cloud的核心追求。基于此，STOmics Cloud會定期進行更新迭代，不斷完善產(chǎn)品體驗。目前，除了已經(jīng)上線的功能，STOmics Cloud也在根據(jù)用戶實際科研需求開發(fā)新功能，更完善、更智能的功能將陸續(xù)上線，敬請期待！