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糖尿病數(shù)據(jù)獨(dú)家震撼挖掘-基于上百萬(wàn)臨床實(shí)驗(yàn)數(shù)_企業(yè)科研_論文作業(yè)_畢設(shè)(硬核,收藏)

2023-05-16 09:53 作者:python風(fēng)控模型  | 我要投稿


大家好,我是Toby老師,曾擔(dān)任國(guó)內(nèi)最大醫(yī)藥數(shù)據(jù)中心數(shù)據(jù)挖掘負(fù)責(zé)人。10年以上數(shù)據(jù)科學(xué)經(jīng)驗(yàn),和中科院,重科院,重慶中藥研究所,重慶兒科醫(yī)院教授有長(zhǎng)期項(xiàng)目合作。現(xiàn)在成立了重慶未來(lái)之智信息技術(shù)咨詢服務(wù)有限公司。我們公司的宗旨是用人工智能,數(shù)據(jù)科學(xué)挖掘疾病致病因子,提供疾病家庭預(yù)防和干預(yù)措施降低疾病患病率。人工智能讓生活更美好!

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糖尿病科研有個(gè)痛點(diǎn),就是臨床醫(yī)生經(jīng)驗(yàn)很難用數(shù)據(jù)科學(xué)量化實(shí)驗(yàn)來(lái)輔助證明。而數(shù)據(jù)挖掘的結(jié)論也并非全部可信,需要和臨床經(jīng)驗(yàn)豐富醫(yī)生交叉驗(yàn)證。

今天Toby老師就來(lái)解決這個(gè)痛點(diǎn),通過(guò)對(duì)上百萬(wàn)大樣本臨床患者數(shù)據(jù)挖掘,發(fā)現(xiàn)糖尿病致病因子,并和臨床經(jīng)驗(yàn)結(jié)合解釋數(shù)據(jù)挖掘結(jié)果合理性,為家庭疾病預(yù)防做出貢獻(xiàn)。

這次數(shù)據(jù)挖掘整合了多個(gè)糖尿病數(shù)據(jù)庫(kù),在國(guó)內(nèi)也屬于罕見(jiàn),Toby老師提供了非常震撼的數(shù)據(jù)挖掘結(jié)果,大家可以點(diǎn)擊收藏此文和分享給其他朋友,讓更多朋友受益。


糖尿病概述

糖尿病醫(yī)學(xué)描述:糖尿病是一組因胰島素絕對(duì)或相對(duì)分泌不足和(或)胰島素利用障礙,引起的碳水化合物、蛋白質(zhì)、脂肪代謝紊亂性疾病。以高血糖為主要標(biāo)志。
糖尿病有一型和二型,是由于胰腺分泌胰島素紊亂或人體無(wú)法有效利用其產(chǎn)生的胰島素而發(fā)生的一種慢性疾病,是21世紀(jì)人類(lèi)面臨的健康問(wèn)題之一.糖尿病伴有彌漫性并發(fā)癥,其包括心血管病變、腎臟疾病、高血壓、中風(fēng)等、眼部疾病、下肢截肢上百種,由此增加了過(guò)早死亡的風(fēng)險(xiǎn).因此,糖尿病防治形勢(shì)十分嚴(yán)峻。

糖尿病最早記錄可追述到古埃及。

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中國(guó)黃帝內(nèi)經(jīng)也有類(lèi)似糖尿病消渴癥狀的描述。

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17世紀(jì)英國(guó)醫(yī)生托馬斯.威利斯記錄了尿甜如蜜,這也是糖尿病的一個(gè)癥狀。

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1889年,醫(yī)學(xué)家發(fā)現(xiàn),狗被切除胰腺后,患上了糖尿病。因此推斷糖尿病和胰腺有關(guān)系。

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1921年,加拿大醫(yī)生班廷和生理學(xué)家貝斯特成功提取出了胰島素,并證實(shí)了胰島素可以降低血糖。大家為了紀(jì)念班廷醫(yī)生,把他生日11月14日定為世界糖尿病日。

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糖尿病主要分為四類(lèi):1型糖尿病2型糖尿病,妊娠期糖尿病,特殊類(lèi)型糖尿病。

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1型糖尿病是由于胰島β細(xì)胞破壞、胰島素絕對(duì)不足引起的一種糖尿病。

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1型糖尿病患者占比小于5%。多于兒童和青少年起病,1型糖尿病患占比80-90%。1型糖尿病患者一般在20歲前發(fā)病。

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2023年,1型糖尿病患者15萬(wàn)人左右。1型糖尿病患者大多無(wú)癥狀。

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糖尿病臨床癥狀主要體現(xiàn)為三多一少,即多飲,多食,多尿,體重減輕。細(xì)胞不能正常攝入葡萄糖,就會(huì)給大腦發(fā)出饑餓信號(hào),增加飲食。但增加飲食后,葡萄糖仍然不能進(jìn)入細(xì)胞,身體通過(guò)消耗自身脂肪來(lái)給細(xì)胞供應(yīng)葡萄糖,因此出現(xiàn)消瘦。

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糖尿病對(duì)全身危害較多,主要分類(lèi)兩類(lèi),對(duì)心血管破壞和細(xì)菌感染。

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糖尿病會(huì)引起血管變窄,硬化或堵塞。長(zhǎng)期供血不足,肝,腦,腎,眼睛都會(huì)發(fā)生病變。

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糖尿病導(dǎo)致血管變硬。如果血管破裂出血后就會(huì)發(fā)生腦淤血,眼底出血等等。如果心腦血管堵塞就會(huì)發(fā)生心梗和腦梗。

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下圖是糖尿病視網(wǎng)膜病變和正常視力對(duì)比。

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糖尿病引起感染包括皮膚感染,肺炎,泌尿系統(tǒng)感染。

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全球糖尿病聯(lián)盟公布數(shù)據(jù)顯示2017年全球糖尿病患者4.26億,2045年預(yù)計(jì)達(dá)到6.29億。

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2017年統(tǒng)計(jì)數(shù)據(jù)中,中國(guó)20-79歲糖尿病患者1.14億,為全球最大糖尿病藥品市場(chǎng)。


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如果安裝患病率統(tǒng)計(jì),2019年估算中國(guó)糖尿病患病率排名世界第二?。

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中國(guó)糖尿病患者數(shù)量為1.2億,位居世界第一。中國(guó)是糖尿病最大藥物研發(fā)市場(chǎng)。越來(lái)越多年輕人屬于糖尿病后備軍,未來(lái)也將加入糖尿病市場(chǎng),成為藥企搖錢(qián)樹(shù)。

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下圖為中國(guó)糖尿病患病率歷史數(shù)據(jù),我們看到從1980年到2010年,糖尿病患病率從不到1%增加到11.6%。

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糖尿病發(fā)病率高,但診治人數(shù)只有30%-40%左右,家庭生活方式干預(yù)更加不足。

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糖尿病給經(jīng)濟(jì)帶來(lái)巨大負(fù)擔(dān)
糖尿病也給經(jīng)濟(jì)帶來(lái)了巨大的負(fù)擔(dān),每年診斷出的糖尿病成本約為 3270 億美元,而未確診的糖尿病和前驅(qū)糖尿病的總成本接近 4000 億美元。

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糖尿病可預(yù)防

雖然糖尿病無(wú)法治愈,但減肥、健康飲食、積極運(yùn)動(dòng)和接受藥物治療等策略可以減輕這種疾病對(duì)許多患者的危害。早期診斷可以改變生活方式和更有效的治療,使糖尿病風(fēng)險(xiǎn)預(yù)測(cè)模型成為公共和公共衛(wèi)生官員的重要工具。

糖尿病致病因子多樣化
雖然有不同類(lèi)型的糖尿病,但 II 型糖尿病是最常見(jiàn)的形式,其患病率因年齡、教育程度、收入、地點(diǎn)、種族和其他健康的社會(huì)決定因素而異。這種疾病的大部分負(fù)擔(dān)也落在社會(huì)經(jīng)濟(jì)地位較低的人身上。
本實(shí)驗(yàn)就是通過(guò)建立人工智能機(jī)器學(xué)習(xí)模型,預(yù)測(cè)糖尿病概率和挖掘糖尿病重要致病因子。


模型價(jià)值和意義

通過(guò)我們建立的人工智能機(jī)器學(xué)習(xí)預(yù)測(cè)模型,可實(shí)現(xiàn)以下一些研究問(wèn)題:
1.模型能準(zhǔn)確預(yù)測(cè)個(gè)人是否患有糖尿病。
2.模型能挖掘哪些風(fēng)險(xiǎn)因素最能預(yù)測(cè)糖尿病風(fēng)險(xiǎn)。
3.我們能使用風(fēng)險(xiǎn)因素的一個(gè)子集來(lái)準(zhǔn)確預(yù)測(cè)一個(gè)人是否患有糖尿病。
4.我們可以使用篩選幾個(gè)重要糖尿病致病特征,然后組合創(chuàng)建為一個(gè)簡(jiǎn)短的問(wèn)題,以準(zhǔn)確預(yù)測(cè)某人是否可能患有糖尿病或是否有糖尿病的高風(fēng)險(xiǎn)。

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糖尿病建模數(shù)據(jù)集介紹

此次臨床試驗(yàn)數(shù)據(jù)總?cè)藬?shù)1045238,其中糖尿病患者124989人,占比12%,和真實(shí)糖尿病患病率幾乎一致。?

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此次上百萬(wàn)患者臨床試驗(yàn)中重點(diǎn)檢測(cè)變量如下:

年齡
高血壓
肥胖
新冠病毒感染情況
插管的
肺炎
腎慢性
重癥監(jiān)護(hù)室
懷孕
是否免疫抑制
醫(yī)療單位等級(jí)
吸煙
慢性阻塞性肺病
其他疾病
心血管疾病
性別
哮喘


Toby老師模型采用新一代對(duì)稱樹(shù)算法,有效降低過(guò)度擬合,提高模型預(yù)測(cè)速度和預(yù)測(cè)能力。

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模型AUC為0.86,預(yù)測(cè)區(qū)分性能非常優(yōu)秀。大家可以看到下圖ROC曲線非常光滑。

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我們建模后發(fā)現(xiàn)年齡,高血壓,肥胖是糖尿病前三重要相關(guān)因子。

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Toby老師用informative value方法來(lái)評(píng)估變量重要性,發(fā)現(xiàn)年齡
高血壓
插管的
重癥監(jiān)護(hù)室
肺炎
慢性腎炎
肥胖
新冠感染情況
心血管疾病
提供護(hù)理的國(guó)家衛(wèi)生系統(tǒng)的機(jī)構(gòu)類(lèi)型
慢性阻塞性肺病

這些變量都屬于糖尿病相關(guān)的有效因子,其中最重要因子還是年齡和高血壓。

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1.性別 VS 糖尿病

在其他糖尿病數(shù)據(jù)集里,由于數(shù)據(jù)樣本量有限,往往得到性別是糖尿病重要因子。通過(guò)百萬(wàn)患者臨床實(shí)驗(yàn),Toby老師再次驗(yàn)證了性別變量不屬于糖尿病的顯著因子。Toby老師通過(guò)查詢美國(guó)疾控中心CDC糖尿病數(shù)據(jù),也得到性別不是糖尿病顯著因子結(jié)論。大家不要有太多性別擔(dān)憂。

2.年齡 VS 糖尿病

Toby老師把年齡分類(lèi)0-33歲,34-40歲,41-49歲,50-54歲,54-58歲,59歲+,這6個(gè)階段。Toby老師觀察到隨著年齡階段上升,糖尿病概率隨之上升,非常顯著。

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隨著年齡增長(zhǎng),身體器官老化,胰島素?cái)?shù)量分泌不足,胰島素質(zhì)量變差,
胰島素被攔截,胰島素遲到,胰島素傳遞信號(hào)異常,胰島素受體異常,運(yùn)輸胰島素的蛋白質(zhì)數(shù)量不足或治療太差都可能發(fā)生。因此隨著年齡增大,器官老化,糖尿病概率會(huì)上升。

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雖然我們不能控制年齡變量,但適當(dāng)鍛煉,合理飲食,可以讓身體更年期,延緩衰老。

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3.高血壓 VS 糖尿病

在12萬(wàn)糖尿病患者中,53%患者有高血壓(66006人)。這個(gè)結(jié)論讓Toby老師也非常吃驚。美國(guó)CDC疾控中心統(tǒng)計(jì)數(shù)據(jù)顯示,大約十分之六的糖尿病患者同時(shí)患有高血壓。這與Toby老師統(tǒng)計(jì)53%數(shù)字非常接近。

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16萬(wàn)高血壓患者中有41%同時(shí)患有糖尿。這雙向統(tǒng)計(jì)按時(shí)了我們高血壓和糖尿病的緊密聯(lián)系。

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4.肥胖VS 糖尿病

通過(guò)數(shù)據(jù)分析,Toby老師發(fā)現(xiàn)并非所有糖尿病患者都有肥胖,但糖尿病患者中有27%的人有肥胖。因此肥胖是糖尿病患者的一個(gè)顯著特征,也需要我們引起重視,嚴(yán)格控制BMI指數(shù)。

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16萬(wàn)肥胖人群中有21%人同時(shí)患有糖尿病。這雙向統(tǒng)計(jì)按時(shí)了我們肥胖和糖尿病的緊密聯(lián)系。

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肥胖患者脂肪較多,過(guò)多脂肪會(huì)干擾細(xì)胞與血糖接收信號(hào),導(dǎo)致部分血糖不能進(jìn)入細(xì)胞里,游離在血液,尿液,造成糖尿病。


如何處理肥胖問(wèn)題,Toby老師建議少吃,適當(dāng)運(yùn)動(dòng)。平時(shí)用餐不要太飽,八分飽即可。自助餐最好避免。少吃零食,奶茶,甜食。多在家里做飯吃,少去餐館吃,少點(diǎn)外賣(mài)。一周運(yùn)動(dòng)5次,每次30分鐘。餐后可適當(dāng)運(yùn)動(dòng),消耗體內(nèi)血糖。

如何評(píng)估自己是否肥胖呢?我們可以參考BMI指數(shù)。

BMI指數(shù)

BMI越大,糖尿病風(fēng)險(xiǎn)越大;BMI越小,糖尿病風(fēng)險(xiǎn)越小。左邊有少量紅色點(diǎn),每個(gè)變量有少數(shù)例外,但大趨勢(shì)不變。

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身體質(zhì)量指數(shù),是BMI(Body Mass Index)指數(shù),簡(jiǎn)稱體質(zhì)指數(shù),是國(guó)際上常用的衡量人體胖瘦程度以及是否健康的一個(gè)標(biāo)準(zhǔn)。計(jì)算公式為:BMI=體重÷身高**2。(體重單位:千克;身高單位:米。)

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Toby老師提醒一下,BMI指數(shù)不僅和糖尿病關(guān)系緊密,還和其他諸多慢病關(guān)系緊密。過(guò)高BMI指數(shù)也像一個(gè)潘多拉魔盒,會(huì)釋放諸多疾病。

網(wǎng)上有很多BMI自動(dòng)計(jì)算器,大家可以去看看自己BMI指數(shù)是否正常。

例如http://bmi.wjccx.com/

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5.肺炎VS 糖尿病

Toby老師統(tǒng)計(jì)發(fā)現(xiàn)12萬(wàn)糖尿病患者中有33%肺炎患者??磥?lái)糖尿病患者容易感染肺炎。

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14萬(wàn)肺炎患者中,30%同時(shí)患有糖尿病。


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肺炎是一種常見(jiàn)但通常很?chē)?yán)重的呼吸道感染。據(jù)美國(guó)胸科學(xué)會(huì)稱,僅在美國(guó),每年就有約10o萬(wàn)成年人因肺炎住院,約有5萬(wàn)成年人死于該病。
糖尿病是一種慢性疾病,需要控制一系列癥狀。它還會(huì)削弱您的免疫系統(tǒng),使您更容易患上肺炎等嚴(yán)重感染。
糖尿病引起的高血糖還會(huì)使您的身體在患上肺炎后更難抵抗。這可能導(dǎo)致更嚴(yán)重的肺炎病例和并發(fā)癥增加,包括器官損傷、呼吸衰竭,甚至死亡。
這疾病控制與預(yù)防中心(CDC)“建議所有2歲以上患有糖尿病的人都接種肺炎疫苗以降低這種風(fēng)險(xiǎn)。

為什么糖尿病會(huì)增加患肺炎的風(fēng)險(xiǎn)?
患有糖尿病等慢性疾病的成年人風(fēng)險(xiǎn)增加“發(fā)展為肺炎。這是因?yàn)樘悄虿?huì)削弱您的免疫系統(tǒng)。當(dāng)您患有糖尿病時(shí),高血糖會(huì)使您的白細(xì)胞難以抵抗感染。
糖尿病還會(huì)損害您的血液循環(huán)和神經(jīng),從而對(duì)免疫系統(tǒng)產(chǎn)生負(fù)面影響。這會(huì)使您面臨更高的感染風(fēng)險(xiǎn),包括肺炎。它還會(huì)使您的身體在出現(xiàn)感染時(shí)更難抵抗感染。
糖尿病還會(huì)增加患更嚴(yán)重肺炎的風(fēng)險(xiǎn)
除了患肺炎的風(fēng)險(xiǎn)增加外,糖尿病患者患嚴(yán)重甚至致命的肺炎的風(fēng)險(xiǎn)也增加。疾病預(yù)防控制中心報(bào)告說(shuō),糖尿病患者可能性增加3倍“死于流感或肺炎。

6.腎炎VS 糖尿病

Toby老師統(tǒng)計(jì)中發(fā)現(xiàn)在12萬(wàn)糖尿病患者中,8%患者有慢性腎炎(9816人)。因此糖尿病腎病是我們需要下一步關(guān)注疾病。Toby老師也有專門(mén)糖尿病腎病數(shù)據(jù)集,預(yù)測(cè)模型性能還不錯(cuò)!

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根據(jù)深讀視頻公布數(shù)據(jù)我國(guó)1.14億人中有2430萬(wàn)糖尿病腎病,每5個(gè)糖尿病患者中就有一個(gè)糖尿病腎病。

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每個(gè)腎臟都由數(shù)百萬(wàn)個(gè)稱為腎單位的微小過(guò)濾器組成。隨著時(shí)間的推移,糖尿病引起的高血糖會(huì)損害腎臟和腎單位中的血管,使它們無(wú)法正常工作。許多糖尿病患者還會(huì)出現(xiàn)高血壓,這也會(huì)損害腎臟。

糖尿病腎病需要很長(zhǎng)時(shí)間才能發(fā)展,并且在早期階段通常沒(méi)有任何體征或癥狀。除非您的醫(yī)生檢查您,否則您不會(huì)知道自己患有?糖尿病腎病。

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糖尿病腎病是一型糖尿病的第一大死因,二型糖尿病的第二大死因。因此糖尿病腎病是醫(yī)藥科研機(jī)構(gòu)高度關(guān)注疾病。

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6年內(nèi),25%的糖尿病腎病患者會(huì)發(fā)展成腎衰竭。腎衰竭患者將會(huì)面臨腎透析和腎臟移植手術(shù),后果很?chē)?yán)重。

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通過(guò)基于上百萬(wàn)臨床實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)的糖尿病數(shù)據(jù)挖掘,Toby老師發(fā)現(xiàn)年齡,高血壓,肥胖是糖尿病前三重要相關(guān)因子。糖尿病肺炎和腎炎也要值得我們警惕和預(yù)防。

為什么糖尿病這么可怕?它就像一個(gè)潘多拉魔盒,一旦打開(kāi)后可能釋放更多妖魔。我們想象一下,如果糖尿病患者發(fā)送繼發(fā)性肺炎,腎炎,視網(wǎng)膜病變,呼吸系統(tǒng),排毒系統(tǒng),視覺(jué)系統(tǒng)都會(huì)出現(xiàn)問(wèn)題。那么糖尿病患者后期很可能喪失工作能力,在家修養(yǎng),生活質(zhì)量越來(lái)越差。


血常規(guī)檢測(cè) VS 糖尿病

Toby老師把之前多個(gè)糖尿病數(shù)據(jù)挖掘結(jié)果做一下關(guān)聯(lián)。在血常規(guī)檢測(cè)中,如果發(fā)現(xiàn)血糖,甘油三酯,r-谷氨?;D(zhuǎn)換酶,紅細(xì)胞體積分布寬度等指標(biāo)異常,也要警惕糖尿病風(fēng)險(xiǎn)。


1.血糖升高

血糖正常值是指人空腹的時(shí)候血糖值在3.9~6.1毫摩爾/升,血糖值對(duì)于治療疾病和觀察疾病都有著指導(dǎo)意義??崭寡獫{血糖超過(guò)7.0毫摩爾/升有可能是糖尿病。因此血糖指標(biāo)是糖尿病最直接定義指標(biāo)。對(duì)糖尿病患者或BMI指數(shù)較高人群,血糖定期檢測(cè)非常重要。

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2.甘油三酯升高,暗示糖尿病風(fēng)險(xiǎn)升高。

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血清甘油三酯的正常參考值:0.45~1.69mmol/L。依據(jù)2007年《中國(guó)成人血脂異常防治指南》地劃分標(biāo)準(zhǔn),空腹 (禁食12小時(shí))甘油三酯在1.70mmol/L以下為適當(dāng)水平;1.70-2.25mmol/L為邊緣升高;≥2.26mmol/L為升高。


甘油三酯超量壞處
當(dāng)我們的飲食過(guò)好、過(guò)多,吃進(jìn)去的甘油三酯無(wú)法消耗完,人就會(huì)逐漸地變胖,血脂就會(huì)升高。甘油三酯升高后會(huì)有以下壞處:
一、導(dǎo)致胰島素抵抗,誘發(fā)糖尿病。人體內(nèi)甘油三酯積蓄過(guò)多,除了發(fā)胖之外,還會(huì)造成胰島素不敏感,出現(xiàn)胰島素抵抗,就會(huì)誘發(fā)糖尿病、冠心病、腦梗塞等。
二、誘發(fā)急性胰腺炎。如果體內(nèi)的甘油三酯超過(guò)了5.6mmol/L時(shí),非常容易誘發(fā)急性胰腺炎。


3.r-谷氨酰轉(zhuǎn)移酶升高,暗示糖尿病風(fēng)險(xiǎn)升高。

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r-谷氨酰轉(zhuǎn)移酶主要臨床參考意義在肝臟。隨著建模和數(shù)據(jù)挖掘,我們發(fā)現(xiàn)r-谷氨酰轉(zhuǎn)移酶和血糖值也有一定聯(lián)系。

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在參考論文:r-谷氨酰轉(zhuǎn)移酶VS 糖尿病,觀察性研究中,高水平的血清 γ-谷氨酰轉(zhuǎn)移酶 (GGT) 與前驅(qū)糖尿病和 2 型糖尿病的風(fēng)險(xiǎn)增加有關(guān)。

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在美國(guó)NCBI發(fā)表文章顯示:測(cè)量 2 型糖尿病患者 FDR 中的 GGT 可能有助于評(píng)估糖尿病風(fēng)險(xiǎn);長(zhǎng)期高 GGT 的人應(yīng)被視為糖尿病的高危人群。


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備注,糖尿病數(shù)據(jù)獨(dú)家震撼挖掘-基于上百萬(wàn)臨床實(shí)驗(yàn)數(shù)的實(shí)驗(yàn)結(jié)果為相對(duì)數(shù)據(jù),并非絕對(duì)數(shù)據(jù),僅供參考。隨著樣本量變化和抽樣改變,實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)可能發(fā)送變化。


糖尿病治療方法比較多,常見(jiàn)的是胰島素,拜糖平等藥物。中醫(yī)也有多部記錄糖尿病治療的醫(yī)書(shū)。

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如果您們對(duì)糖尿病模型項(xiàng)目感興趣,歡迎各大醫(yī)療機(jī)構(gòu),科研機(jī)構(gòu),生物醫(yī)藥企業(yè)與up主聯(lián)系。

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