SWATH蛋白組學
SWATH是一種基于質(zhì)譜的數(shù)據(jù)非依賴性的掃描采集模式,主要應(yīng)用于蛋白質(zhì)組定量、和宿主蛋白分析等研究中。百泰派克生物科技提供SWATH定量蛋白組學服務(wù)。
SWATH技術(shù)
SWATH(Sequential Window Acquisition of all Theoretical fragment ions)是一項全新的質(zhì)譜采集模式技術(shù),屬于一種DIA (Data Independent Acquisition)技術(shù)。SWATH將整個質(zhì)譜掃描質(zhì)量范圍分為若干小窗口,依次對每個窗口的所有離子進行碎裂,使其能夠?qū)呙鑵^(qū)間內(nèi)的所有肽段離子進行高速一級MS掃描并采集所有母離子的碎片離子進一步進行二級MS/MS分析。SWATCH技術(shù)可以鑒定復雜樣品中的所有分子,包括低表達蛋白和低豐度的被修飾蛋白,且具有高通量和精準度高的特點。
SWATH蛋白組學
SWATH蛋白組學主要是利用SWATH技術(shù)進行定量蛋白質(zhì)組研究。與label free技術(shù)一樣,SWATH技術(shù)可以不用進行樣品的標記而對樣品蛋白進行定量。SWATH定量蛋白組首先是對細胞或組織等樣品進行蛋白提取和純化,接著對純化蛋白進行還原打開蛋白二硫鍵,并使用Trypsin等蛋白酶將蛋白酶切成多肽片段,多肽片段混合溶液經(jīng)過LC-MS色譜質(zhì)譜串聯(lián)分析技術(shù)進行分離和SWATH質(zhì)譜分析,最后通過軟件分析質(zhì)譜數(shù)據(jù)從而對蛋白質(zhì)組進行鑒定和定量。SWATH對儀器掃描速度和檢測精度要求很高,常用作SWATH分析的儀器平臺為AB SCIEX Triple-TOF 5600-plus或同系列更高端版本的質(zhì)譜儀。
