APSIM模型參數(shù)優(yōu)化 批量模擬丨物候發(fā)育和光合生產(chǎn)、物質(zhì)分配與產(chǎn)量模擬、土壤水分平衡
隨著數(shù)字農(nóng)業(yè)和智慧農(nóng)業(yè)的發(fā)展,基于過程的農(nóng)業(yè)生產(chǎn)系統(tǒng)模型在模擬作物對氣候變化的響應與適應、農(nóng)田管理優(yōu)化、作物品種和株型篩選、農(nóng)田固碳和溫室氣體排放等領域扮演著越來越重要的作用。APSIM (Agricultural Production Systems sIMulator)模型是世界知名的作物生長模擬模型之一。APSIM模型有Classic和Next Generation兩個系列模型,能模擬幾十種農(nóng)作物、牧草和樹木的土壤-植物-大氣過程,被廣泛應用于精細農(nóng)業(yè)、水肥管理、氣候變化、糧食安全、土壤碳周轉(zhuǎn)、環(huán)境影響、農(nóng)業(yè)可持續(xù)性、農(nóng)業(yè)生態(tài)等諸多與農(nóng)業(yè)生產(chǎn)和科研有關的領域。APSIM模型內(nèi)核算法是基于Fortran語言開發(fā)的,軟件界面是基于C#進行開發(fā),組件式驅(qū)動,各個模塊可以自由組合。了解和熟悉APSIM模型的關鍵算法和軟件的操作是學習APSIM模型的基礎。此外,想要成為一名優(yōu)秀的作物模型使用者與科研團隊不可或缺的人才,除了掌握對作物模型相關知識之外,還要掌握模型的快速模擬和高效數(shù)據(jù)分析能力。R語言是一門應用場景廣泛、簡單易學的程序語言,APSIM模型開發(fā)了許多R語言輔助包,在APSIM模型的氣候、土壤、管理措施等數(shù)據(jù)準備,自動化模擬,參數(shù)優(yōu)化和結果分析上都發(fā)揮著重要的作用。
輔助提高作物模型工作者的APSIM模型使用技術,系統(tǒng)學習如何利用R語言來快速使用APSIM模型。精選大量作物模型應用案例,全程干貨,讓學員全面熟悉APSIM這一綜合型農(nóng)業(yè)生態(tài)系統(tǒng)模型,提高學員模型應用能力、數(shù)據(jù)分析和圖表制作技能。如果你是資深模型愛好者,可以進一步熟悉各個模塊的相關算法;如果你是該模型入門者,將讓你體驗一鍵模擬的樂趣。
專題一 APSIM模型應用與R語言數(shù)據(jù)清洗
1)作物生長模型的概念
2)作物生長模型的發(fā)展現(xiàn)狀
3)APSIM模型的開發(fā)歷程
4)APSIM模型的模塊及模擬流程
5)APSIM模型操作:APSIM的安裝、APSIM模型操作界面講解
6)R語言編程與數(shù)據(jù)清洗(數(shù)據(jù)篩選、合并、切片、重復值、缺失值處理)
專題二 APSIM氣象文件準備與R語言融合應用
APSIM自帶的氣象數(shù)據(jù)的準備
1)APSIM氣象文件.met的介紹
2)日照轉(zhuǎn)輻射算法
3)APSIM氣象文件轉(zhuǎn)化
4)APSIM模型陸氣交換和能量平衡過程
案例一:使用R語言進行氣象文件的生成
案例二:使用R語言將氣象共享網(wǎng)數(shù)據(jù)/NC等數(shù)據(jù)批量生產(chǎn)APSIM氣象文件
案例三:使用R語言批量修改氣象文件及調(diào)用APSIM文件
專題三 APSIM模型的物候發(fā)育和光合生產(chǎn)模塊
APSIM物候發(fā)育和光合生產(chǎn)
1)APSIM模型的生育期尺度
2)APSIM模型的積溫計算
3)APSIM模型的生育期算法
4)APSIM模型的生育期影響因子及算法
5)APSIM模型光合生產(chǎn)算法
案例一:使用APSIM classic 和NG版本模擬生育期和生物量
專題四 APSIM物質(zhì)分配與產(chǎn)量模擬
1 APSIM模型的物質(zhì)分配算法
2 APSIM模型產(chǎn)量模擬模塊
1)APSIM模型的穗粒數(shù)模擬
2)APSIM模型的產(chǎn)量模擬
3)APSIM模型的產(chǎn)量相關參數(shù)
案例一:作物潛在生物量和潛在產(chǎn)量的模擬
案例二:不同品種參數(shù)下作物產(chǎn)量的模擬
專題五 APSIM土壤水平衡模塊
APSIM模型的土壤水分平衡算法
1)土壤水蒸散和植物蒸騰算法
2)土壤水徑流和排水算法
3)土壤水力參數(shù)的測試
案例一:APSIM模型輸入?yún)?shù)和土壤文件的制備
案例二:APSIM模型土壤參數(shù)在數(shù)據(jù)缺失情況下的近似估算
案例三:使用R語言批量修改APSIM模型土壤參數(shù)
案例四:APSIM模型模擬土壤水分動態(tài)
專題六 APSIM土壤碳、氮平衡模塊
APSIM模型土壤養(yǎng)分動態(tài)過程模擬及溫室氣體排放的模擬
1)氮素的礦化和固定過程
2)氮素的硝化作用與反硝化作用
3)土壤N2O的模擬
案例一:APSIM模型N2O排放模擬
案例二:APSIM模型模擬土壤No3和NH4的動態(tài)變化
專題七 APSIM土壤碳、氮平衡模塊
APSIM模型土壤碳庫模型及土壤有機碳SOC的模擬
1)土壤碳庫模型的發(fā)展歷程
2)土壤碳的周轉(zhuǎn)模型
3)土壤有機碳的模擬
案例一:APSIM模型土壤碳庫模型參數(shù)率定
案例二:APSIM模型模擬秸稈還田對土壤碳庫變化的影響
專題八 APSIM農(nóng)田管理模塊與情景模擬
APSIM模型的農(nóng)田管理措施的準備
1)APSIM模型播期和播種密度設置
2)APSIM模型施肥設置(化肥+有機肥)
3)APSIM模型的灌溉設置
4)APSIM模型秸稈還田設置
5)APSIM模型多年模擬和輪作模擬
案例一:APSIM模型模擬氣候變化對作物生長的影響
案例二:APSIM模型模擬多年輪作下土壤有機碳和溫室氣體排放的影響
案例三:APSIM模型模擬作物單做、連作和輪作
案例四:APSIM模型模擬玉米大豆復合種植(間作)
案例五:使用R語言對APSIM管理文件進行批量修改及批量運行
專題九 APSIM模型Next Generation(NG)版本
APSIM模型Next Generation(NG)版本異同
1)APSIM模型NG版本與Classic版本的區(qū)別
2)APSIM模型NG版本Clock模塊、氣象土壤模塊、Factors模型、品種模塊
3)APSIM模型NG版本管理模型設置
案例一:APSIM模型NG版本設置多種管理情景組合
案例二:APSIM模型NG版本復現(xiàn)Classic版本的案例
專題十 APSIM模型參數(shù)優(yōu)化和結果分析與模型評價
APSIM模型的參數(shù)優(yōu)化
1)APSIM模型的主要遺傳參數(shù)
2)APSIM模型的參數(shù)優(yōu)化方法
案例一:使用頻率派和貝葉斯派(MCMC)等多種方法對APSIM模型Classic和NG版本進行參數(shù)優(yōu)化
案例二:使用R語言批量讀取模擬結果以及對APSIM模型進行評價
案例三:使用R語言對模擬結果進行可視化(模擬結果的動態(tài)圖和1:1圖等)
專題十一 APSIM模型源代碼解析
APSIM模型源代碼解析
1)APSIM模型源代碼的結構解析
2)APSIM模型源代碼編譯
案例一:更改APSIM模型源代碼參數(shù)進行編譯
案例二:運用編譯源代碼后的模型進行模擬
專題十二 更多案例模擬與疑難解答

基于Citespace、vosviewer、R語言文獻計量學可視化分析及全流程文獻可視化SCI論文寫作