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CADD+ROSetta(線下)+分子動力學(xué)-amber+Namd入門合集

2023-06-25 17:01 作者:點點課  | 我要投稿

Rosetta 是一套用于模擬大分子結(jié)構(gòu)的綜合軟件,具有靈活、多用途的應(yīng)用。包括蛋白質(zhì)和

核酸的結(jié)構(gòu)預(yù)測、設(shè)計以及重塑。Rosetta 的 web 服務(wù)器已經(jīng)運(yùn)行了數(shù)十億的結(jié)構(gòu)預(yù)測和蛋白質(zhì)

設(shè)計模擬,研究人員利用 Rosetta 可以更好地了解傳染病、癌癥和自身免疫性疾病的治療方法,

進(jìn)一步應(yīng)用于包括開發(fā)疫苗、新材料、靶向蛋白粘合劑和酶設(shè)計等。

分子動力學(xué)模擬是分子模擬中最接近實驗條件的模擬方法,能夠從原子層面給出體系的微觀

演變過程,直觀的展示實驗現(xiàn)象發(fā)生的機(jī)理與規(guī)律,促使學(xué)術(shù)研究向著更高效、更經(jīng)濟(jì)、更有預(yù)

見性的方向發(fā)展。可以解決和研究 DNA 的折疊和性質(zhì)、蛋白與配體的識別機(jī)制、跨膜蛋白的工作

機(jī)理、蛋白酶與底物的反應(yīng)、蛋白與蛋白的耦合、比較野生型與突變蛋白的不同特性等。

近年來,利用高性能計算機(jī)來進(jìn)行藥物虛擬篩選已經(jīng)被廣泛應(yīng)用,計算機(jī)輔助藥物設(shè)計可以

提高藥物研發(fā)的成功率,降低研發(fā)成本,縮短研發(fā)周期,是目前創(chuàng)新藥物研究的核心技術(shù)之一。

隨著醫(yī)藥大數(shù)據(jù)的積累和人工智能技術(shù)的發(fā)展,運(yùn)用 AI 技術(shù)并結(jié)合大數(shù)據(jù)的精準(zhǔn)藥物設(shè)計也不

斷推動著創(chuàng)新藥物的發(fā)展

7-8月安排的《 (線下北京)Rosetta +(線上)CADD-AMBER-NAMD四個》學(xué)習(xí)項目,誠邀您的參與。
項目一:計算機(jī)輔助藥物設(shè)計--蛋白對蛋白-分子對接-虛擬篩選等內(nèi)容(線上六天),
項目二:Rosetta抗體設(shè)計優(yōu)化結(jié)構(gòu)(線下三天),北京
項目三:Amber結(jié)合自由能設(shè)計計算應(yīng)用--線上四天
項目四:NAMD生物材料計算應(yīng)用(線上三天)

微信:1047608967

  1. 公眾號:

(無限次回放視頻+班級微信群+講義資料+全部案例模型)

Rosetta 專題講師:由國家雙一流、985 高校特聘研究員、博士生導(dǎo)師講授。近五年發(fā)表

SCI 研究論文 20 余篇,獲國際生物設(shè)計會議獎勵(The International BioDesign Research

Conference)。主持基金委蛋白質(zhì)設(shè)計相關(guān)項目和科技部重點研發(fā)計劃課題多項。主要擅長分

子設(shè)計、分子模擬方法研究。

NAMD 專題講師:來自國家“雙一流”建設(shè)高校,“211’工程。擁有近 10 年豐富的 NAMD

使用經(jīng)驗。以第一/通訊作者在《

ACS advanced materials & interface》等國際 top 期刊發(fā)

表論文數(shù)十篇。擅長領(lǐng)域:蛋白質(zhì)分子動力學(xué),蛋白質(zhì)納米材料相互作用機(jī)制,蛋白質(zhì)測序等。

AMBER 專題講師:山東省重點高校特聘教授、省優(yōu)青團(tuán)隊人員,研究團(tuán)隊在國際知名期刊

發(fā)表 SCI 論文 50 余篇。其中以第一作者發(fā)表的兩篇 JACS 屬于本領(lǐng)域頂級 TOP 期刊(一區(qū)論文,

IF: 14.612)。主持國家自然科學(xué)基金及省部級課題多項。主要從事生物分子量化計算和分子

動力學(xué)模擬研究,在動力學(xué)模擬、量化計算、結(jié)合自由能計算等積累了豐富的經(jīng)驗。

CADD 專題講師:由全國重點大學(xué)、國家“雙一流”、“211 工程”重點建設(shè)醫(yī)藥類高校副

教授,碩士生導(dǎo)師講授。發(fā)表 SCI 研究論文 20 余篇,主持和參與國家級、省部級自然科學(xué)基

金項目多項。擁有多年新藥分子設(shè)計和開發(fā)經(jīng)驗,主要擅長 CADD、AIDD 等藥物設(shè)計方法研究。




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