擔(dān)心破壞外泌體結(jié)構(gòu)?試試用DNA水凝膠分離吧……

外泌體可作為疾病診斷的生物標(biāo)志物或治療藥物,然而從復(fù)雜生物樣本中分離外泌體仍面臨不少困難。

期刊:Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America;
影響因子:11.1
外泌體參與細(xì)胞間通訊并調(diào)節(jié)一系列生理、病理過(guò)程,因此在疾病早期診斷、發(fā)病機(jī)制分析和預(yù)后監(jiān)測(cè)等方面具有較大的應(yīng)用潛力。從復(fù)雜生物樣本中獲得高純度、低損傷的外泌體是其用于下游生物分析的先決條件,但這在目前仍然較難實(shí)現(xiàn)。
為解決上述難題,本文作者嘗試采用基于DNA水凝膠的外泌體分離方式,實(shí)現(xiàn)對(duì)復(fù)雜樣本中外泌體的特異性、低損傷分離。
DNA水凝膠是一種主要由DNA參與形成的三維網(wǎng)狀聚合物材料,DNA適配體是一類(lèi)篩選得到的對(duì)目標(biāo)物質(zhì)(如外泌體)具有良好特異性與親和力的寡核苷酸序列,利用DNA的序列可編程性和適配體的分子識(shí)別功能,可開(kāi)發(fā)出高特異性的外泌體分離方案。
作者設(shè)計(jì)可以特異性識(shí)別CD63(外泌體表面標(biāo)志物)的適配子,并通過(guò)滾環(huán)擴(kuò)增反應(yīng)合成含有多聚適配體的DNA超長(zhǎng)單鏈,將該單鏈加入含有外泌體的反應(yīng)體系中,由于適配體對(duì)CD63的高親和力,外泌體錨定在DNA超長(zhǎng)單鏈上。

隨后加入另一條DNA超長(zhǎng)單鏈,兩條DNA單鏈通過(guò)堿基互補(bǔ)雜交形成DNA水凝膠,在這個(gè)過(guò)程中,捕獲的外泌體被包裹到固態(tài)網(wǎng)絡(luò)水凝膠中,實(shí)現(xiàn)了與反應(yīng)體系中其他成分的分離。

完成對(duì)外泌體的捕獲后,通過(guò)酶解法或鏈置換法處理DNA水凝膠,可將包裹其中的外泌體重新釋放出來(lái),且外泌體保持良好的結(jié)構(gòu)和成分完整性。

以上述分離方法為基礎(chǔ),作者將分子信標(biāo)/單探針整合到DNA水凝膠中,對(duì)外泌體中的miRNA進(jìn)行檢測(cè),從而實(shí)現(xiàn)了外泌體的分離-檢測(cè)一體化。將乳腺癌臨床樣本和健康供體的外泌體作為檢測(cè)對(duì)象,對(duì)該檢測(cè)方法進(jìn)行驗(yàn)證,結(jié)果顯示能夠?qū)崿F(xiàn)對(duì)兩類(lèi)樣本的精準(zhǔn)區(qū)分。

此外,作者探究了DNA水凝膠捕獲外泌體后用于疾病治療的潛力。以心肌梗死大鼠模型為實(shí)驗(yàn)對(duì)象,將捕獲間充質(zhì)干細(xì)胞來(lái)源外泌體的DNA水凝膠注射到大鼠胸腔,一段時(shí)候后,大鼠心臟功能得到改善,這提示DNA水凝膠可能成為外泌體局部給藥和高效釋放的一種理想載體。

通過(guò)以上研究,作者得出結(jié)論,DNA水凝膠能夠?qū)崿F(xiàn)對(duì)復(fù)雜生物樣本中外泌體的分離,且?guī)缀醪粚?duì)外泌體造成損傷。此外,該方法具有應(yīng)用于疾病診斷和治療的潛力,有望推動(dòng)外泌體在生物醫(yī)學(xué)領(lǐng)域的發(fā)展和應(yīng)用。

Tang J, Jia X, Li Q, Cui Z, Liang A, Ke B, Yang D, Yao C. A DNA-based hydrogel for exosome separation and biomedical applications. Proc Natl Acad Sci U S A. 2023 Jul 11;120(28):e2303822120. doi: 10.1073/pnas.2303822120. Epub 2023 Jul 3. PMID: 37399419.