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AAV病毒和它的血清型們

2021-05-15 21:20 作者:Cas9X海星生物  | 我要投稿

腺相關(guān)病毒(Adeno-associated virus,AAV)是細(xì)小病毒科(Parvoviridae)的病毒,病毒顆粒大小約為 20-25 nm,是目前已知的最小的動(dòng)物病毒。AAV是一種復(fù)制缺陷型病毒,其增殖復(fù)制需要腺病毒(Adenovirus,Ad)或者單純孢疹病毒(Herpes simplex virus,HSV)的輔助。在缺乏輔助病毒的情況下,AAV可以在許多類型的細(xì)胞中長(zhǎng)期潛伏存在。

雖然AAV感染在人類中很常見,但與任何已知疾病無關(guān),加上其轉(zhuǎn)導(dǎo)分裂細(xì)胞和靜止細(xì)胞的能力、非常低的免疫原性以及轉(zhuǎn)基因長(zhǎng)期表達(dá)(與野生型AAV病毒感染后整合到宿主細(xì)胞DNA不同,重組AAV載體主要作為染色體外游離體長(zhǎng)期存在)。這些特性使AAV作為一種高效安全的轉(zhuǎn)基因載體,被廣泛應(yīng)用于基因治療、神經(jīng)環(huán)路標(biāo)記、活體成像、基因編輯以及神經(jīng)系統(tǒng)疾病動(dòng)物模型的制備等方面。

AAV是單鏈 DNA 病毒,基因組結(jié)構(gòu)簡(jiǎn)單,全長(zhǎng)約 4.7kb。AAV基因組DNA的兩端為145個(gè)核苷酸長(zhǎng)度的反向末端重復(fù)序列(inverted terminal repeat,ITR),ITR序列折疊成發(fā)卡結(jié)構(gòu),是DNA復(fù)制起始和包裝重組AAV基因組為感染性的病毒顆粒所需的順式作用元件。ITR 序列之間為病毒編碼區(qū),含有Rep和Cap兩個(gè)基因。其中Rep基因編碼Rep78、Rep68、Rep52和Rep40四種蛋白質(zhì),主要作用于病毒基因組復(fù)制以及與宿主基因組的整合;而Cap基因編碼VP1、VP2 和VP3三種病毒衣殼蛋白和組裝激活蛋白AAP,主要作用于病毒基因組的包裝以及從宿主細(xì)胞中的分泌。

VP1和VP2蛋白共享VP3序列,并在其N端具有其他殘基。VP1的N端具有一個(gè)保守的磷脂酶A2序列,該序列與病毒從體內(nèi)逃逸有關(guān),并對(duì)其感染性至關(guān)重要;VP2蛋白對(duì)于組裝或者感染并非比不可少;VP3蛋白的核心由保守的β-桶基序組成,決定了不同血清型AAV與宿主細(xì)胞作用受體的差異。

?現(xiàn)在發(fā)現(xiàn)的十多種常見血清型以及上百種病毒變種的主要區(qū)別在于衣殼蛋白Cap基因的不同,編碼結(jié)構(gòu)蛋白的不同從而導(dǎo)致不同血清型的 AAV 對(duì)不同的組織和細(xì)胞感染效率不同。AAV2是人類發(fā)現(xiàn)最早、研究最早的血清型,在這幾十年的研究中AAV2是研究得最清楚的血清型。但AAV2有一定的局限性,它對(duì)很多組織和細(xì)胞的感染效率不高。

通過對(duì)AAV2 進(jìn)行改造,即利用攜帶有目的血清型的cap基因和AAV2 Rep基因的輔助包裝質(zhì)粒、腺病毒輔助質(zhì)粒以及含有 AAV2 ITR(兩個(gè)末端倒轉(zhuǎn)重復(fù)序列)及目的基因表達(dá)的AAV載體質(zhì)粒三質(zhì)粒一起轉(zhuǎn)染 293細(xì)胞,可獲得不同血清型的重組AAV(rAAV)。


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腺相關(guān)病毒的轉(zhuǎn)導(dǎo)效率與細(xì)胞類型有關(guān)。有些細(xì)胞類型顯示較低的轉(zhuǎn)導(dǎo)效率,而有些細(xì)胞類型則顯示較高的效率。在設(shè)計(jì)腺相關(guān)病毒的轉(zhuǎn)導(dǎo)實(shí)驗(yàn)時(shí),可使用表達(dá)綠色熒光蛋白的不同血清型的腺相關(guān)病毒來確定待轉(zhuǎn)導(dǎo)組織或者細(xì)胞的最適血清型。

對(duì)于不難感染的細(xì)胞,轉(zhuǎn)導(dǎo)細(xì)胞的初始MOI可在1×104-1×106 genome copy(GC)之間。對(duì)于較難感染的細(xì)胞則需要更高的MOI。如果腺相關(guān)病毒應(yīng)用于體外細(xì)胞實(shí)驗(yàn),超純化處理不是必須的。對(duì)于體內(nèi)研究(動(dòng)物實(shí)驗(yàn)),使用超純化的、無雜質(zhì)(無活性的病毒顆粒、細(xì)胞碎片和培養(yǎng)液成分)的腺相關(guān)病毒在避免引發(fā)強(qiáng)免疫反應(yīng)方面至關(guān)重要。此外,超純化處理可提升病毒滴度至適合體內(nèi)實(shí)驗(yàn)的水平。

AAV在組織中的轉(zhuǎn)導(dǎo)效果可以持續(xù)2-6個(gè)?,并且通常在注射后2-4周可以達(dá)到表達(dá)峰值。不同血清型的 AAV 對(duì)不同的組織感染效率不同。例如,使用AAV重組病毒載體治療神經(jīng)系統(tǒng)疾病時(shí),一般選用AAV9的血清型以穿越血腦屏障,而基于AAV9型改造的兩個(gè)新型AAV血清型:AAV-PHP.eB和AAV-PHP.S分別對(duì)中樞神經(jīng)系統(tǒng)和外周神經(jīng)系統(tǒng)具有更好的嗜性。

而在肝臟研究中,AAV2 首先被報(bào)道在小鼠體內(nèi)實(shí)施靜脈注射后具肝嗜性。隨后,多 種常用的 AAV 血清型載體(AAV1-9、rh10)在小鼠體內(nèi)被證實(shí)具有肝嗜性,其中AAV8 轉(zhuǎn)導(dǎo)效率非常高。

海星生物目前提供十多種常見血清型的AAV病毒包裝和純化服務(wù),我們推薦的不同AAV血清型組織嗜性如下表所示:

?參考文獻(xiàn):

(1) Grieger J C , ?Samulski R J . Adeno-associated virus vectorology, manufacturing, and clinical applications.[J]. Methods in Enzymology, 2012, 507:229-254.

(2)?Chahal P S , ?Schulze E , ?Tran R , et al. Manufacturing of Adeno-Associated Viruses of Different Serotypes for Gene Therapy Applications[C]// 12th Annual Meeting of the American Society of Gene Therapy. 2009.

(3)?Lykken EA, Shyng C, Edwards RJ, Rozenberg A, Gray SJ. Recent progress and considerations for AAV gene therapies targeting the central nervous system. J Neurodev Disord. 2018 May 18;10(1):16.


作者:海星生物? ? ? ?

公眾號(hào):Cas9X細(xì)胞基因編輯

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