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病原微生物檢測王炸產(chǎn)品

2022-02-10 10:16 作者:分子科普小feng子  | 我要投稿

目前針對臨床感染的明確病原多達(dá)26000多種,包含細(xì)菌、真菌、病毒、寄生蟲、支原體和衣原體、分歧桿菌等,對于一些病情危重或者病因不明、特殊類型病原、外科術(shù)后感染可能性高等的患者,采用mNGS檢測技術(shù),是一種不依賴于傳統(tǒng)微生物培養(yǎng),無偏好性的病原檢測技術(shù)。通過直接對臨床樣本中的核酸進(jìn)行高通量測序,然后與數(shù)據(jù)庫進(jìn)行比對分析,根據(jù)比對到的序列信息來判斷樣本包含的病原微生物種類,能夠快速、客觀的檢測臨床樣本中的較多病原微生物(包括病毒、細(xì)菌、真菌、寄生蟲),且無需特異性擴(kuò)增,尤其適用于急危重癥和疑難感染的診斷。

樣本的類型多種多樣,通過感染的部位進(jìn)行采樣,例如腦脊液、肺穿刺、痰液、拭子、肺泡灌洗液、血液等等,部分類型的樣本需要看DNA和RNA的全部數(shù)據(jù),尤其是含有人類宿主類型的樣本為了避免數(shù)據(jù)的浪費(fèi)以及后續(xù)的結(jié)果分析,會去除人和細(xì)菌的rRNA,傳統(tǒng)的雜交捕獲以及RNase H的方法耗時耗力,步驟很多,純化步驟多,而導(dǎo)致起始樣本量較高,由于臨床檢測pcr free的特殊性對于混合去除有了更高的要求,QIAGEN給大家?guī)砹藢iT針對病原微生物需要同時去除人、細(xì)菌的rRNA的產(chǎn)品解決了傳統(tǒng)實驗帶來的弊端。

QIAseq FastSelect Epidemiology Kits

用于從人類、小鼠、大鼠和細(xì)菌樣本中快速去除 RNA-seq 文庫制備的 rRNA

特征

? 與 QIAGEN、Illumina、NEB 和 KAPA 鏈 RNA-seq 文庫試劑盒兼容

? 提供從片段或全長 RNA 中去除泛細(xì)菌 5S/16S/23S rRNA,以及去除人類、小鼠、大鼠和相關(guān)細(xì)胞的細(xì)胞質(zhì)和線粒體 rRNA物種

? 用于細(xì)菌和 HMR(人類、小鼠和大鼠)的單獨(dú)試劑,可靈活用于單或雙 seq 應(yīng)用

? 簡單的程序可與現(xiàn)有工作流程配合使用,以節(jié)省時間

QIAseq FastSelect Epidemiology Kits 專為“雙序列”或“宿主-病原體”RNA-seq 文庫構(gòu)建而設(shè)計。使用 QIAseq FastSelect Epidemiology Kits 構(gòu)建 RNA-seq 文庫的研究人員將去除細(xì)菌 5S/15S/23S rRNA 以及人類、小鼠和大鼠細(xì)胞質(zhì)和線粒體核糖體 RNA。我們的綜合 rRNA 去除試劑設(shè)計使用 16S(近 600,000 個條目)、23S(近 170,000 個條目)和 5S rRNA 序列(超過 7200 個條目)。計算機(jī)模擬預(yù)測所有已知 5S、16S 和 23S rRNA 序列的 rRNA 去除率 >95%??扇菁{從低至 20 ng 到 1 μg 的 RNA 量,具有始終如一的高性能,并且與低質(zhì)量、高度片段化或高質(zhì)量的全長 RNA 兼容。由于 QIAseq FastSelect 不使用酶消化或雜交捕獲程序,快速、簡單的工作流程可在下游應(yīng)用中實現(xiàn)可靠的 rRNA 去除和高重現(xiàn)性。用于去除細(xì)菌和 HMR rRNA 的試劑在單獨(dú)的試管中提供,使研究人員能夠優(yōu)化雙序列、細(xì)菌或 HMR 樣本的 RNA-seq 工作流程。

QIAseq FastSelect Epidemiology Kits 使用一種新方法從您的 RNA-seq 文庫中去除科學(xué)價值低的高豐度 RNA。它們已經(jīng)過 QIAGEN、Illumina、Roche/KAPA 和 NEB RNA-seq 文庫試劑盒的測試,并且與所有主要的 RNA-seq 文庫制備方法兼容。簡單的 14 分鐘 FastSelect 流程和隨后的基于微珠的清理與所有常見的 RNA-seq 文庫試劑盒無縫集成,可用于片段化或全長(非片段化)RNA。我們建議使用QIAseq Stranded RNA Library Kits為高質(zhì)量和高度片段化的 RNA 快速、可靠地制備鏈特異性 RNA-seq 文庫。并且可以設(shè)計您自己的定制 QIAseq FastSelect 試劑,以從您的 RNA-seq 文庫中刪除您希望的任何 RNA。

QIAseq FastSelect Kit 工作流程

只需將 QIAseq FastSelect 試劑(rRNA Removal 和/或 Globin Removal)添加到您的 RNA 樣本中,進(jìn)行片段化(如果需要),然后在 14 分鐘內(nèi)從 75°C 逐步冷卻至 25°C。然后,研究人員無需對其工作流程進(jìn)行任何額外更改即可完成剩余的文庫制備步驟。QIAseq FastSelect 在有或沒有 RNA 片段化的情況下均可使用,提供了使用 FFPE 或降解的 RNA 樣本或高質(zhì)量 RNA 作為標(biāo)準(zhǔn) RNA-seq 文庫構(gòu)建工作流程的一部分的靈活性。

QIAseq FastSelect –5S/16S/23S 與其他方法比較:rRNA 去除

還有更多驚喜哦

QIAseq FastSelect –rRNA HMR kits

用于從人類、小鼠、大鼠和其他哺乳動物樣本中快速去除 rRNA 和/或globin?mRNA以制備 RNA-seq 文庫

特點(diǎn):

? 與 QIAGEN、Illumina、NEB 和 KAPA 鏈 RNA-seq 文庫試劑盒兼容

? 用于人、小鼠、大鼠和其他哺乳動物物種的單一試劑

? 僅需 14 分鐘即可去除高性能 rRNA 和/或globin mRNA,然后完成剩余的文庫制備步驟

??只需一個移液步驟——將 QIAseq FastSelect 試劑與 RNA 結(jié)合并孵育

? 無需額外的清理步驟或 NGS流程更改

???也適用于FFPE和降解的RNA樣本

?

整個去除只需將 QIAseq FastSelect 試劑(rRNA 去除和/或globin去除)添加到 RNA 樣品中,進(jìn)行片段化(如果需要),將反應(yīng)從 75°C 逐步冷卻至 25°C共 14 分鐘,然后完成剩余的文庫制備步驟。 除此之外,QIAGEN還提供了果蠅、酵母、線蟲、植物、泛細(xì)菌、魚的FastSelect核糖體去除試劑。


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