Cre-loxP重組酶系統(tǒng)應(yīng)用全攻略
Cre-loxP重組酶系統(tǒng)應(yīng)用全攻略
Cre-loxP重組酶系統(tǒng)
Cre-loxP系統(tǒng)是一種重組酶系統(tǒng),能在DNA特定位點上執(zhí)行刪除、插入、易位及倒位,是一種廣泛應(yīng)用的基因編輯工具,可以達到在基因水平上對生物體進行定向遺傳改造的目的,在真核和原核系統(tǒng)中均適用。
Cre重組酶(Cyclization Recombination Enzyme)
是由大腸桿菌噬菌體P1的Cre基因編碼,全長1029bp(EMBL數(shù)據(jù)庫登錄號X03453),編碼由343個氨基酸組成的38kDa蛋白。Cre重組酶是一種位點特異性的DNA重組酶,能特異識別loxp位點,介導(dǎo)loxp位點間的序列刪除或重組。
loxP位點
locus of X-over P1來源于噬菌體P1,是一段長度為34bp的DNA序列,包括兩個13bp的反向重復(fù)序列和一個不對稱的8bp間隔區(qū)組成。反向重復(fù)序列是Cre重組酶的特異識別位點,而間隔區(qū)域決定了loxP位點的方向。其序列如下:
ATAACTTCGTATA - NNNTANNN - TATACGAAGTTAT
(N 表示堿基可能發(fā)生變化)
Cre-loxP系統(tǒng)作用方式
Cre重組酶介導(dǎo)兩個LoxP位點間的重組是一個動態(tài)、可逆的過程,可以分成三種情況:
1、如果兩個LoxP位點位于一條DNA鏈上,但方向相反,Cre重組酶能導(dǎo)致兩個LoxP位點間的序列翻轉(zhuǎn);
2、如果兩個LoxP位點位于一條DNA鏈上,并且方向相同,Cre重組酶能有效切除兩個LoxP位點間的序列;
3、如果兩個LoxP位點分別位于兩條不同的DNA鏈或染色體上,Cre酶能介導(dǎo)兩條DNA鏈的交換或染色體易位。
圖1.Cre-loxP誘導(dǎo)基因重組的方式
另外,Cre不僅可以識別LoxP的2個13bp的反向重復(fù)序列和8bp的間隔區(qū)域,而且當一個13bp的反向重復(fù)序列或者8bp的間隔區(qū)發(fā)生改變時仍能識別并發(fā)生重組。利用這一特點,人們在構(gòu)建載體時可以根據(jù)需要改造LoxP位點序列,以用于特定的基因突變或修復(fù),增加了該系統(tǒng)的應(yīng)用范圍。
Cre-loxP重組系統(tǒng)在轉(zhuǎn)基因中的應(yīng)用
Cre-loxP重組系統(tǒng)的優(yōu)勢,主要體現(xiàn)在:時空特異、高效性、準確性、快速性。由于Cre-loxP重組系統(tǒng)的高效簡單的作用方式,它已成為體內(nèi)外DNA重組的有力工具。
圖2.Cre-loxP重組系統(tǒng)在轉(zhuǎn)基因中的應(yīng)用
應(yīng)用Cre-loxP重組系統(tǒng)較為常見的形式是兩種轉(zhuǎn)基因動物的雜交。
(1) 通過轉(zhuǎn)基因動物辦法獲得一只“Cre小鼠”或“floxed小鼠”;
(2) 病毒注射“Cre小鼠”或“floxed小鼠”,引入loxP或Cre重組酶元件。
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