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質(zhì)譜流式細(xì)胞技術(shù):高通量單細(xì)胞蛋白質(zhì)組技術(shù)

2022-08-03 08:27 作者:上海歐易生物  | 我要投稿

細(xì)胞是生物體最基本的結(jié)構(gòu)和功能單位,蛋白質(zhì)是生命活動(dòng)的功能直接執(zhí)行者,不同的細(xì)胞決定了組織器官的特異性功能。隨著單細(xì)胞分析技術(shù)發(fā)展,多維單細(xì)胞組學(xué)數(shù)據(jù)在分析細(xì)胞種類和功能層面帶給我們更廣闊更深入的視角,單個(gè)細(xì)胞的蛋白質(zhì)動(dòng)態(tài)變化及細(xì)胞功能亞群深入研究,可以幫助我們更好地揭示單細(xì)胞層面的精細(xì)變化,解析復(fù)雜的生物學(xué)問題。


質(zhì)譜流式細(xì)胞技術(shù)(Mass Cytometry,CyTOF)結(jié)合了傳統(tǒng)流式技術(shù)高效的單細(xì)胞研究能力和飛行時(shí)間質(zhì)譜的全譜高分辨率優(yōu)勢,采用金屬標(biāo)記抗體與待測抗原結(jié)合,實(shí)現(xiàn)了單細(xì)胞水平的高通量分析,并且能夠同時(shí)獲得單個(gè)細(xì)胞的多種參數(shù),識(shí)別不同靶向蛋白。質(zhì)譜流式與單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測序相比,質(zhì)譜流式技術(shù)能夠直接獲得蛋白水平的信息,捕獲檢測的細(xì)胞也更多信息更豐富。



質(zhì)譜流式單細(xì)胞蛋白質(zhì)組技術(shù),在推出基布魯克tims TOF Pro2 4D蛋白質(zhì)組質(zhì)譜平臺(tái)的單細(xì)胞蛋白質(zhì)組后,再度推出基于質(zhì)譜流式平臺(tái)的新一代高通量單細(xì)胞蛋白質(zhì)組技術(shù)。

Starion星瀚質(zhì)譜流式系統(tǒng),具有高通量高分辨率超高速的特點(diǎn),可實(shí)現(xiàn)在單細(xì)胞分辨率下同時(shí)對(duì)數(shù)十種目標(biāo)蛋白的深度分析。進(jìn)一步豐富鹿明生物單細(xì)胞多組學(xué)技術(shù)服務(wù)產(chǎn)品線,為科研工作者提供全面深入的科研技術(shù)服務(wù)。

技術(shù)流程


質(zhì)譜流式技術(shù)采用金屬標(biāo)記的抗體識(shí)別細(xì)胞表面或胞內(nèi)的抗原,標(biāo)記后的細(xì)胞經(jīng)霧化后被分離成單個(gè)細(xì)胞進(jìn)入電感耦合等離子體矩管中進(jìn)行離子化,離子云隨后被傳輸至飛行時(shí)間質(zhì)量分析器中,檢測器依次記錄各種金屬離子到達(dá)的時(shí)間,檢測出每個(gè)細(xì)胞中各種標(biāo)簽金屬的含量,最終形成不同的金屬離子信號(hào)峰。檢測產(chǎn)生單個(gè)細(xì)胞質(zhì)譜數(shù)據(jù),再通過分類、聚類和降維算法進(jìn)行處理,反映基于靶蛋白豐度的各種細(xì)胞群體的表型和功能。



質(zhì)譜流式作為一項(xiàng)新興的高通量單細(xì)胞分析技術(shù),已廣泛應(yīng)用于腫瘤、免疫、生物標(biāo)志物、疾病分型、細(xì)胞治療、疫苗、藥物研發(fā)等生物學(xué)及醫(yī)學(xué)研究的諸多領(lǐng)域。自首篇文獻(xiàn)報(bào)道以來,相關(guān)文獻(xiàn)呈現(xiàn)逐年快速上升趨勢,其中近40%發(fā)表于CNS等頂級(jí)學(xué)術(shù)期刊及其子刊上,近五年發(fā)表文獻(xiàn)IF影響因子均值為13.84



產(chǎn)品優(yōu)勢


  • 超高通量:能捕獲超過百萬個(gè)細(xì)胞的單細(xì)胞蛋白質(zhì)數(shù)據(jù);

  • 真單細(xì)胞:能獲得單個(gè)細(xì)胞水平的蛋白質(zhì)定量,同步實(shí)現(xiàn)對(duì)單細(xì)胞表型、信號(hào)通路及功能的數(shù)據(jù)整合分析

  • 精細(xì)分型:同時(shí)檢測數(shù)十個(gè)蛋白Marker,實(shí)現(xiàn)更加精細(xì)的細(xì)胞分型及細(xì)胞亞群的功能研究;

  • 快速檢測:30min運(yùn)行時(shí)間內(nèi)檢測50萬個(gè)細(xì)胞;

  • 準(zhǔn)確性:四極桿設(shè)計(jì)精準(zhǔn)篩選標(biāo)記的金屬離子,無背景信號(hào)干擾;

  • 高分辨率:全新設(shè)計(jì)的飛行時(shí)間質(zhì)量分析器分辨率≥700。


應(yīng)用領(lǐng)域



研究思路


目前已經(jīng)有大量的單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組+質(zhì)譜流式相結(jié)合的高分文章發(fā)表,給我們提供了非常值得借鑒的研究思路,既可以同時(shí)進(jìn)行聯(lián)合分析,也可以基于其中一種研究結(jié)果采用另外一種技術(shù)進(jìn)行后續(xù)的驗(yàn)證或者深入分析。例如,一方面可以對(duì)前期單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組的研究結(jié)果,采用質(zhì)譜流式在單細(xì)胞蛋白質(zhì)層面進(jìn)行驗(yàn)證,也可以對(duì)單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組篩選到的關(guān)鍵細(xì)胞亞群通過質(zhì)譜流式進(jìn)行蛋白層面更精細(xì)的細(xì)胞分群分析,分析稀有的細(xì)胞亞群。另一方面也可以基于質(zhì)譜流式的細(xì)胞分群信息,對(duì)篩選到的關(guān)鍵細(xì)胞亞群進(jìn)行單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組的研究。最后還可以采用基于單細(xì)胞蛋白質(zhì)組技術(shù)對(duì)鎖定的關(guān)鍵細(xì)胞亞群進(jìn)行深度的蛋白質(zhì)組研究,在蛋白層面進(jìn)一步進(jìn)行機(jī)制機(jī)理等研究。




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本文系鹿明生物原創(chuàng)

質(zhì)譜流式細(xì)胞技術(shù):高通量單細(xì)胞蛋白質(zhì)組技術(shù)的評(píng)論 (共 條)

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