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AbMole科研快報-IGF2BP2通過m6A增強LincRNA01116的穩(wěn)定性

2023-06-14 16:45 作者:達(dá)則兼濟(jì)天下  | 我要投稿

本期與您分享的是:IGF2BP2通過m6A增強LincRNA01116的穩(wěn)定性:m6A是子癇前期患者的潛在生物標(biāo)志物和治療靶點。

子癇前期(PE)是一種以胎盤重構(gòu)失敗為特征的嚴(yán)重并發(fā)癥,是導(dǎo)致胎盤結(jié)構(gòu)和功能改變的主要原因之一。長鏈非編碼RNA的異常表達(dá)與PE的發(fā)生和發(fā)展有關(guān)。本研究發(fā)現(xiàn),linc01116在PE患者中表達(dá)顯著下調(diào),與子宮螺旋動脈重構(gòu)不良有關(guān)。在體外和體內(nèi),敲低linc01116顯著降低滋養(yǎng)細(xì)胞的血管生成。在機制上,IGF2BP2通過m6A甲基化調(diào)節(jié)linc01116 RNA的穩(wěn)定性。生物信息學(xué)和其他實驗進(jìn)一步揭示了linc01116通過吸附miR-210-3p在滋養(yǎng)細(xì)胞中上調(diào)AAMP的表達(dá)。

綜上所述,本研究揭示了linc01116在調(diào)節(jié)滋養(yǎng)細(xì)胞血管生成中的關(guān)鍵作用。此外,本研究為PE的胎盤病理檢測提供了新的線索。

Actinomycin D(Abmole,M4881,純度>99%)

Actinomycin D(Abmole)(https://www.abmole.cn/products/actinomycin-d.html)是一種從土壤細(xì)菌中分離出來的多肽抗生素。

FIGURE 3 The effect of IGF2BP2 on linc01116 stability and vascularization, migration, and invasion of trophoblasts in vitro.

表觀遺傳調(diào)控的最新進(jìn)展揭示了m6A和lncRNA修飾之間的聯(lián)系。m6A修飾的“閱讀器”蛋白在調(diào)節(jié)甲基化mRNA的命運中起著關(guān)鍵作用。多項研究表明PE胎盤組織中m6A甲基化水平異常升高,因此本研究旨在建立m6A的變化與PE中l(wèi)inc01116低表達(dá)之間的關(guān)系。

根據(jù)在線數(shù)據(jù)庫ENCORI(https://starbase.sysu.edu.cn/)中的數(shù)據(jù),linc01116可以綁定IGF2BP2和YTHDF1(圖3A)。SRAMP數(shù)據(jù)庫(http://www.cuilab.cn/sramp/)中的在線生物信息學(xué)數(shù)據(jù)揭示了linc01116中潛在的m6A甲基化位點。

研究人員對linc01116與m6A“閱讀器”蛋白的結(jié)合情況進(jìn)行了研究,證實了linc01116與IGF2BP2的結(jié)合比YTHDF1更強(圖3B)。IGF2BP2作為m6A的“讀取器”,主要穩(wěn)定RNA23,使用放線菌素D阻斷細(xì)胞RNA轉(zhuǎn)錄,發(fā)現(xiàn)HTR-8/SVneo細(xì)胞中IGF2BP2的敲低顯著縮短了linc01116的半衰期(圖3C)。上述實驗表明,linc01116-結(jié)合蛋白IGF2BP2維持了mRNA的穩(wěn)定性。

此外,MeRIP-qPCR分析顯示,抗m6A抗體在linc01116的200-300bp片段中高度富集(圖3D),而抗m6A抗體在linc01116的200-300bp片段中高度富集(圖3E)。這些發(fā)現(xiàn)表明IGF2BP2通過m6A依賴的方式增強linc01116 RNA的穩(wěn)定性。

此外,5個配對胎盤樣本中IGF2BP2的免疫組化染色(圖3F)和western blot分析結(jié)果(圖3G)顯示,PE中IGF2BP2的表達(dá)水平下調(diào),與RT-qPCR分析結(jié)果一致(圖3H)。

隨后,我們評估了IGF2BP2對滋養(yǎng)細(xì)胞的影響,包括網(wǎng)絡(luò)形成能力、遷移和侵襲能力。與其他三種細(xì)胞系相比,HTR-8/SVneo中IGF2BP2 mRNA的表達(dá)明顯高(圖3I)。因此,我們選擇si-IGF2BP2-1#和si-IGF2BP2-3#進(jìn)行后續(xù)實驗(圖3J)。用siRNA抑制IGF2BP2表達(dá)可減少HTR-8/SVneo和HUVECs形成的網(wǎng)狀結(jié)構(gòu)(圖3K)。

總之,這些發(fā)現(xiàn)表明IGF2BP2的沉默抑制了HTR-8/SVneo和HUVECs的侵襲和遷移(圖3L)。因此,IGF2BP2敲低會干擾滋養(yǎng)層細(xì)胞和HUVECs細(xì)胞的侵襲、遷移和網(wǎng)絡(luò)形成。PE胎盤組織IGF2BP2下調(diào)通過m6A修飾增加linc01116的降解,抑制滋養(yǎng)細(xì)胞的血管生成。

FIGURE 6 The effects of IGF2BP2 on the stability and transcription of AAMP mRNA.

m6A修飾是人類mRNA中最常見的修飾。根據(jù)生物信息學(xué)SRAMP數(shù)據(jù)庫(http://www.cuilab.cn/sramp/)的數(shù)據(jù),AAMP mRNA潛力具有m6A甲基化位點(圖6A)。RIP實驗表明IGF2BP2可以與AAMP mRNA結(jié)合(圖6B)。

此外,與對照組相比,si-IGF2BP2-感染HTR-8/SVneo細(xì)胞中AAMP的mRNA(圖6C)和蛋白(圖6D)水平隨著時間的推移而下降。盡管如此,MeRIP-qPCR分析顯示,m6A僅在AAMP mRNA的1380-1538 bp片段中高度富集(圖6E)。然而,IGF2BP2在預(yù)測位點內(nèi)并未富集(圖6F)。

綜上所述,這些結(jié)果表明IGF2BP2可以提高AAMP mRNA的穩(wěn)定性,但可能不會促進(jìn)m6A修飾。

AbMole(http://www.abmole.cn/)精研抑制劑十年,最新的科研動態(tài)不斷與您分享。

鳴謝:

Tingting Zhang, et al. J Cell Biochem. 2023 Feb;124(2):239-253.


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