農(nóng)業(yè)生產(chǎn)廢棄物(秸稈類)的腐熟降解是由微生物重要作用可以發(fā)生的，有資料研究表明可高效進(jìn)行降解以及農(nóng)業(yè)發(fā)展廢棄物的菌種高達(dá)上百種，主要內(nèi)容包括纖維素降解菌、半纖維素降解菌和木質(zhì)素降解菌。決定腐熟農(nóng)業(yè)企業(yè)廢棄物資源高效降解的關(guān)鍵問題在于提高纖維素降解菌、半纖維素降解菌和木質(zhì)素降解菌的配比。

　　一、降解木質(zhì)素的主要微生物

　　木質(zhì)素是農(nóng)業(yè)生產(chǎn)廢棄物中最難實(shí)現(xiàn)降解的部分，堆肥技術(shù)想要發(fā)展達(dá)到一個高效的腐熟處理效果，就只有先將影響木質(zhì)素生物降解。目前在降解以及木質(zhì)素中研究方法較多的是放線菌，主要內(nèi)容包括鏈霉菌、節(jié)桿菌、小單孢菌等。降解過程中木質(zhì)素的真菌可以分成軟腐真菌、褐腐真菌和白腐真菌三大類，主要是學(xué)生根據(jù)工作分解作用部位的不同。軟腐真菌主要是由子囊菌和半知菌組成，在潮濕環(huán)境條件下對廢棄物材料表面問題進(jìn)行分析分解。褐腐真菌資源優(yōu)先選擇攻擊軟木，是一組擔(dān)子菌。白腐真菌中擔(dān)子菌占多數(shù)，子囊菌和半知菌占少量。白腐真菌在適宜的條件下，菌絲能夠通過不斷溶解細(xì)胞表面的蠟質(zhì)，再進(jìn)入企業(yè)廢棄物管理內(nèi)部，產(chǎn)生大量纖維素酶、半纖維素酶、內(nèi)切聚糖酶、外切聚糖酶，將廢棄物中木質(zhì)素和纖維素結(jié)構(gòu)轉(zhuǎn)化成CO2和H2O。黃孢原毛平革菌是白腐真菌的一種，因具有相對較強(qiáng)的降解反應(yīng)能力而深受人們重視。

　　二、降解纖維素的主要微生物

　　纖維素降解菌是指能夠產(chǎn)生纖維素酶的微生物。真菌是自然界分解纖維素的主力軍，常見的有氯霉素屬的里氏木霉和哈茨木霉，煙曲霉和米曲霉，青霉屬的一些菌株，以及大型真菌中日常食用的草菇和香菇。在細(xì)菌中，主要有一些能分解纖維素的菌株，如纖維單胞菌、纖維蛋白弧菌、纖維梭菌、纖維梭菌、枯草芽孢桿菌等。劉東波等人分離的纖維素諾卡氏菌是一種以纖維素為碳源生長的固氮菌，在農(nóng)業(yè)應(yīng)用上有很大潛力。

　　三、降解半纖維素的主要微生物

　　半纖維素是纖維素和木質(zhì)素結(jié)合的必要粘合劑，只有降解半纖維素才能降解木質(zhì)素。降解半纖維素的主要真菌有木質(zhì)素木霉、擬康氏木霉、黑曲霉、白曲霉、擴(kuò)展青霉和美麗青霉，它們不僅能降解纖維素，還能有效降解半纖維素。半纖維素降解細(xì)菌的典型例子包括糞纖維單胞菌、凝結(jié)弧菌和嗜熱熱纖維素分解菌，并且由它們產(chǎn)生的木聚糖酶具有更高的熱穩(wěn)定性。放線菌中也有很多降解半纖維素的微生物，如鏈霉菌、假火山嗜酸菌、哥斯達(dá)黎加鏈霉菌、諾卡氏菌樣細(xì)菌等。