Easyfig軟件版本問(wèn)題
我們常用的Easyfig版本為2.2.3,雖然目前已更新至2.2.5版本,但在實(shí)際的使用過(guò)程中發(fā)現(xiàn)2.2.5并不如2.2.3版本好用。
要正常使用Easyfig,最重要的一點(diǎn)在于將blast添加至Easyfig軟件,完成初始化的設(shè)置。而目前自動(dòng)化下載安裝blast的功能已經(jīng)不太好使了,這可能是由于外網(wǎng)“墻”的存在。那就只能通過(guò)手動(dòng)的方式去添加blast,結(jié)果我們測(cè)試發(fā)現(xiàn),由于未知原因2.2.5版本每次打開Easyfig后都需要重新添加一遍blast才能正常使用,而2.2.3版本僅需要完成一次設(shè)置。
我們?cè)谛峦瞥龅恼n程《基于Easyfig軟件實(shí)現(xiàn)基因簇結(jié)構(gòu)比較及雜合質(zhì)粒形成分子證據(jù)研究》中給大家提供了不需要添加blast,打開即可正常使用的Easyfig 2.2.3安裝包。這是因?yàn)槲覀冊(cè)贓asyfig基礎(chǔ)安裝包中附加了“makeblastdb.exe、blastn.exe、tblastx.exe”這三個(gè)文件。同時(shí)只要把這三個(gè)文件添加至2.2.5版本,也能解決其無(wú)法正常使用的問(wèn)題。
此外,本套課程不是簡(jiǎn)單的軟件操作指南,而是以常見(jiàn)科學(xué)問(wèn)題為指引,教會(huì)大家如何通過(guò)easyfig軟件實(shí)現(xiàn)比較基因組研究中常見(jiàn)熱點(diǎn)問(wèn)題的高效解決:
A. 目標(biāo)基因簇結(jié)構(gòu)的進(jìn)化變異;
B. 目的基因遺傳環(huán)境的多樣性分析;
C. 基因水平轉(zhuǎn)移分子證據(jù)研究;
D. 雜合質(zhì)粒形成的分子證據(jù)研究;
E. 其他與基因結(jié)構(gòu)變異相關(guān)的科學(xué)問(wèn)題的解決。
本套課程中不僅包含對(duì)軟件所有功能的介紹、操作演示,輸入文件的準(zhǔn)備、調(diào)整、修改,圖片的高級(jí)加工等,同時(shí)對(duì)該軟件能解決的科學(xué)問(wèn)題進(jìn)行系統(tǒng)的說(shuō)明,從理論背景、問(wèn)題提出、問(wèn)題解決、結(jié)果呈現(xiàn)等環(huán)節(jié)教給大家問(wèn)題的解決方案。
【課程】基因組結(jié)構(gòu)分析神器Easyfig實(shí)操精品課
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