最近看到不少網(wǎng)友在討論“達(dá)爾文錯(cuò)了嗎？”，那今天就從生物學(xué)的演化方面來說說進(jìn)化論是正確與否。

其實(shí)，進(jìn)化論（演化論）在目前的認(rèn)知領(lǐng)域里，是正確的。但是這個(gè)話題太大了，我只能部分解讀一下。這里，我要特別強(qiáng)調(diào)一點(diǎn)，我說的演化論，不是達(dá)爾文的粗略的描述，也不是地質(zhì)學(xué)發(fā)掘化石的證明，更不是猴子變成人這種怪誕的稱法，而是生物學(xué)上的演化，是來自生物學(xué)的證據(jù)。

現(xiàn)在的進(jìn)化論早已經(jīng)不是部分人以為的達(dá)爾文學(xué)說了。如果說達(dá)爾文更多是一種現(xiàn)象描述或者假設(shè)提出者，現(xiàn)在，進(jìn)化論是一種實(shí)實(shí)在在的證據(jù)和存在。生物學(xué)上，演化論的依據(jù)是遺傳物質(zhì)的演化，這是我們討論的基石。

01，DNA是進(jìn)化的基礎(chǔ)

我們認(rèn)為，所有的生物學(xué)功能和特征，其最基礎(chǔ)的部分，永遠(yuǎn)是DNA（蛋白質(zhì)是DNA翻譯合成的，RNA也是轉(zhuǎn)錄于DNA也可以作用于DNA。以前寫過一篇《“基因決定形狀”這句話是完全正確的嗎？》感興趣的也可以去解讀下。

當(dāng)然，有部分生物并沒有DNA，比如朊病毒，或者RNA病毒（依然依賴DNA），不在本文討論范疇。

02，DNA進(jìn)化分析

自從有了測序技術(shù)，我們可以對(duì)DNA進(jìn)行分析了。DNA就是ATGC四個(gè)堿基組成，因此，讀出了這些內(nèi)容，就可以對(duì)DNA進(jìn)行解讀。而隨著二代測序的快速發(fā)展，我們從曾經(jīng)的兩三年測一個(gè)人的基因組到現(xiàn)在幾天就可以完成一個(gè)人的基因組測序。

而有了序列，我們就可以對(duì)基因進(jìn)化進(jìn)行分析了，最基礎(chǔ)核心當(dāng)然就是比對(duì)了。通過對(duì)不同物種的基因組分析，我們可以對(duì)我們關(guān)注的基因的一個(gè)發(fā)展歷程進(jìn)行一個(gè)分析

03，現(xiàn)代進(jìn)化分析的過程

下面我用【人類走出非洲理論是怎么得出的】來說一下現(xiàn)代進(jìn)化分析的過程。

第一步，線粒體—母系遺傳的典范

由于特殊的受精機(jī)制，受精卵中的線粒體遺傳信息幾乎全部來自于卵細(xì)胞中，同時(shí)由于 mtDNA 不存在重組，子代個(gè)體中的線粒體遺傳信息能夠遵循嚴(yán)格的母系遺傳規(guī)律將過去所積累的所有變異信息忠實(shí)而連續(xù)地遺傳下去，因而能夠被廣泛地運(yùn)用于追溯群體的起源及母系進(jìn)化歷史等研究領(lǐng)域。

一句話，線粒體只能母系遺傳

上圖是線粒體（mitochondria）及線粒體基因組（mitochondrial DNA）的示意圖

其中，線粒體基因組是我們研究的關(guān)鍵

第二步 線粒體基因組結(jié)構(gòu)

這個(gè)大家可以一筆帶過，反正你就知道，線粒體基因組是有序列的，而且，16569個(gè)堿基（人類基因組是30億）

我描述下，一個(gè)個(gè)完整的mtDNA基因組由編碼區(qū)與非編碼區(qū)組成。其中雙鏈編碼區(qū)共包含37個(gè)編碼基因；非編碼區(qū)即控制區(qū)（control region），又稱D-loop 區(qū)（displancement loop），全長 1122bp，D-loop 區(qū)包含2段長度約為300-400bp但富含突變信息的核苷酸片段，被稱為高變Ⅰ區(qū)和高變Ⅱ區(qū)

第三，對(duì)線粒體基因組進(jìn)行分析分類

根據(jù)從線粒體中提取的序列信息，我們將一組具有相同特征性突變的 mtDNA 序列劃

分到一特定的群體中，即作為一種單倍型類群（haplogroup）。就如下圖所示，根據(jù)圖中加框的地方堿基不同，可以分為1,2,3,4這是個(gè)單倍群，這是接下來劃分的基礎(chǔ)

第四步，人類走出非洲結(jié)論得出

第三條我們說了，根據(jù)單倍群來分類，那么，每個(gè)人都可以屬于某一個(gè)群。

1987年美國遺傳學(xué)家Rebecca Cann等于在《Nature》上發(fā)表了文章《Mitocondrial DNA and Human Evolution》，奠定了“非洲夏娃學(xué)說”，可以說是進(jìn)化史上最為顛覆的一次，什么元謀人，北京人都一下子傻眼了。這是怎么做到的呢？就是用線粒體基因組。

他們對(duì)來自全世界各地區(qū)共計(jì)147名婦女胎盤細(xì)胞的線粒體DNA全序列進(jìn)行 PCR-RFLP分析（由12種高分辨率的限制性內(nèi)切酶所組成的酶切圖譜），結(jié)果顯示所有個(gè)體的 mtDNA單倍型的系統(tǒng)發(fā)育均顯示出非洲的根，即所有非洲個(gè)體均可劃分到最古老的支 L 中，而 L 支所衍生的 L3 支系則囊括了部分的非洲個(gè)體以及其他各大洲所有群體的 mtDNA 單倍型類群。其中由L3支系所衍生出的所有非洲以外的 mtDNA 譜系可分為M 和N兩大支系。N支系包括了所有西部歐亞特異的單倍型類群(H、I、J、K、T、U等)，東亞特異的(A、B、R9、N9 等)單倍型類群以及大洋洲特異的 P 單倍型類群。M 支系下游的譜系分布在東非(M1)、南亞(M1-M6)、大洋洲(Q/M12)和東亞(C、D、G、M7、M8、M9 等)的人群中。

大體上，是這樣一個(gè)分類圖

也就是說，世界上，大部分人是來自于L3群體。感興趣的可以進(jìn)一步去細(xì)看（

PhyloTree.org）

放到地圖上，是下面這樣的。亞洲，歐洲，南美北美，大洋洲，都是L3的后裔，而亞洲和南美是M類群，北美是N類群，歐洲和美國是R類群

如圖，各種顏色代表了各種單倍型

在這以后，各地學(xué)者對(duì)不同人群的 mtDNA 進(jìn)行了大規(guī)模的研究，其結(jié)果均支持“非洲起源學(xué)說”。

第五步，進(jìn)化時(shí)間計(jì)算

由于古老的線粒體DNA單倍群在向其它大陸或區(qū)域遷徙的過程中，線粒體DNA上不斷積累的變異成為了現(xiàn)今在各大洲人群中所觀察到的大洲特異性突變信息，因而可根據(jù)這些變異位點(diǎn)所界定的單倍群地理分布情況來推測群體的遷移模式、群體的歷史動(dòng)態(tài)以及群體擴(kuò)張和遷移發(fā)生的時(shí)間。目前根據(jù)這一理論對(duì)全世界范圍內(nèi)的群體遷移已做出來較多的論述，認(rèn)為現(xiàn)代人類的祖先大約于十到二十萬年前起源于非洲，六七萬年前遷入亞洲，三至五萬年前遷進(jìn)入歐洲，然后大約一至三萬年前從亞洲的北部或歐洲移至美洲。

就是我們最初提到的圖。

好了，以人類為例的一個(gè)進(jìn)化遷徙路線已經(jīng)搞定了。這也是一個(gè)經(jīng)典的進(jìn)化分析途徑。而我們?cè)诜治銎渌倪M(jìn)化的時(shí)候，一般是依據(jù)基因組來判斷。當(dāng)然了，公眾看到的和我們做的還是有細(xì)微區(qū)別的。

我們計(jì)算出來的結(jié)果是這樣的

而你們看到的呢，是這樣的