相信各位小伙伴們在聽過酸菜大大的生信導學課后，都知道了生信的核心乃是數(shù)據(jù)，沒有數(shù)據(jù)就好比巧婦難為無米之炊~

尤其是針對分析腫瘤領(lǐng)域的小伙伴們，不光需要豐富的數(shù)據(jù)來支持自己的各項分析，而且還需要“獨特”的數(shù)據(jù)來彰顯自己分析的與眾不同。

那么下面小編就給大家?guī)硪粋€包含人類多個癌癥細胞系（即包含基因表達數(shù)據(jù)、染色體拷貝數(shù)據(jù)和大規(guī)模平行測序數(shù)據(jù)）的神仙級數(shù)據(jù)庫——CCLE數(shù)據(jù)庫。

CCLE數(shù)據(jù)庫支持操作者在線查詢基因在腫瘤細胞系的表達和突變情況，通過對該數(shù)據(jù)庫的靈活使用可以讓你的生信分析從更多維度解釋腫瘤中基因表達譜的變化，并且不光是數(shù)據(jù)豐富，就連其自帶的可視化操作工具都可以做到，只需要鼠標簡單操作即可分分鐘可視化發(fā)表級圖表。

那么下面就讓我們進行CCLE數(shù)據(jù)庫的詳細解讀吧~

CCLE數(shù)據(jù)庫簡介

CCLE數(shù)據(jù)庫全稱——Cancer Cell Line Encyclopedia即癌癥細胞系百科全書，其數(shù)據(jù)庫內(nèi)包含對上千種癌細胞系的多組學圖譜深度解析且于2019年進行更新后，更是新增了1000多個細胞系的遺傳突變、RNA剪接DNA甲基化、組蛋白修飾等相關(guān)信息。

不光數(shù)據(jù)方面十分豐富，就連可視化方面都做得都與前者旗鼓相當，其基因表達數(shù)據(jù)能可視化為條形圖、基因甲基化可以通過氣泡圖來可視化而且支持在不同細胞系中進行可視化分析，更為重要的是支持單個細胞系突變數(shù)據(jù)的在線查看和下載，滿足你的一切生信需求，既可以當作數(shù)據(jù)的豐富來源，又可以分分鐘可視化出發(fā)表級圖片。是你腫瘤分析中的不二選擇。

CCLE數(shù)據(jù)庫頁面介紹

登錄CCLE數(shù)據(jù)庫，點擊導航欄中的“about”可以進入about頁面，此頁面展示的是CCLE數(shù)據(jù)庫的基本數(shù)據(jù)信息，包括數(shù)據(jù)數(shù)目及種類等等。

點擊導航欄“Data”可進入Data頁面之后可以查看和下載所要搜索的細胞系或基因組的相關(guān)數(shù)據(jù)，這里的數(shù)據(jù)會分為三個模塊（小編提示：但是必須登錄網(wǎng)站才可以查看和下載哦~）

小編劃重點~~~，如果你的分析中想做耐藥實驗，想對某個靶點進行藥物處理，這時候你也可以使用這個數(shù)據(jù)庫，只需要在某個細胞系中，查詢其IC50值，即可作為藥物濃度參考（藥理學的小伙伴們都驚呆了~）

CCLE數(shù)據(jù)庫核心功能詳解（可視化）

俗話說的好“一圖勝千言”，優(yōu)秀的數(shù)據(jù)結(jié)果，如果沒有一個優(yōu)秀的可視化結(jié)果豈不是一大憾事！那么接下來就帶大家大致了解一下CCLE數(shù)據(jù)庫可視化步驟，詳細的學習請參見解螺旋精品單元課哦~

繪制基因表達譜

在檢索欄輸入基因或細胞系名稱，以“TP53”為例，點擊“Search”，待頁面刷新后，可視化結(jié)果即立刻呈現(xiàn)（不是吧~居然這么簡單）。

敲黑板劃重點啦~不光有箱線圖，散點圖也可以通過鼠標點點點的操作進行即時可視化哦~

這時候可能有小伙伴會問了，小編，你說這么好的數(shù)據(jù)庫，為什么我在以前沒有注意到呢，是不是很少有人使用?。?br>面對這類的提問，小編的回答只有一個“NO~NO~NO”其實有很多文章都使用了這個數(shù)據(jù)庫，只不過平時的你可能沒有注意到罷了，下面這篇文章就用了CCLE數(shù)據(jù)庫進行了部分可視化：

如果覺得影響因子不夠高，我們這里還有更高的哦~

都看到這里了，小伙伴們還有理由不去學習這個數(shù)據(jù)豐富+分分鐘可視化發(fā)表級圖片+高影響因子雜志“紅人”的神仙級數(shù)據(jù)庫嗎？

說了這么多，為了更好的幫助你成長，CCLE數(shù)據(jù)庫教程現(xiàn)在限時免費領(lǐng)取，僅限300個名額！

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