上個月2月16日，Scott Nguyen做研究時，他發(fā)現(xiàn)了令人驚訝事情：一種看起來像弗蘭肯斯坦病毒的冠狀病毒變種。

Scott Nguyen是美國華盛頓特區(qū)公共衛(wèi)生實驗室的生物信息學(xué)家。他追蹤了城市周圍新出現(xiàn)的冠狀病毒變種。

Nguyen和其它科學(xué)家在一個名為GISAID的龐大數(shù)據(jù)庫中搜索數(shù)百萬個SARS-CoV-2基因組序列，希望發(fā)現(xiàn)可能改變疫情進(jìn)程的菌株——或者只是讓科學(xué)家更好地了解病毒是如何進(jìn)化的。

例如，在去年11月，在一名受感染新冠病毒者身上就發(fā)現(xiàn)了“一組非常奇怪的……來自南非的一個變種病毒”。那就是omicron（奧密克戎）。

然后在今年2月的一個清晨，Nguyen不僅發(fā)現(xiàn)了另一種變體，還發(fā)現(xiàn)了一類全新的變體病毒：將三角洲和奧密克戎的部分混合在一起的新變體。它們的混合是隨機混在一起的。在某些情況下，病毒似乎正在優(yōu)化組合（從每種組合中選擇傳染性和免疫逃避的最佳特征）。

Deltacron’——Omicron尖峰蛋白和三角洲體

具體而言，Nguyen發(fā)現(xiàn)了一種變體，該變體主要是三角洲，但含有奧密克戎的尖峰蛋白（病毒表面引發(fā)感染的微小螺柱）。Nguyen說，因此病毒的很大一部分尖峰蛋白是奧密克戎，但病毒的身體仍然是三角洲的。這是描述它的最佳方式。

到目前為止，這種被稱為XD的變體很少見。因此，科學(xué)家只在法國、丹麥、比利時、荷蘭和德國發(fā)現(xiàn)了它。但可能有很多這樣的三角洲病毒。加利福尼亞州圣馬特奧的科學(xué)家已經(jīng)在美國發(fā)現(xiàn)了其中的少數(shù)。英國和巴西至少出現(xiàn)了一個。

美國衛(wèi)生官員，包括世界衛(wèi)生組織的衛(wèi)生官員，正在密切關(guān)注這些混合變體。因為它們演示了病毒如何將其最成功的部分快速組合成超級病毒。這個過程被稱為重組，這就是流感毒株的制造有多么危險。

“所以重組通常是我們感染流感大流行的方式”。世界衛(wèi)生組織的邁克·瑞安博士表示。我們必須非常謹(jǐn)慎……我們必須非常非常密切地關(guān)注這些重組事件。

例如，奧密克戎的尖峰蛋白特別容易將病毒隱藏在我們的免疫系統(tǒng)，特別是我們的抗體中。因此，XD變體本質(zhì)上是戴著奧密克戎隱形斗篷的三角洲變體。

Nguyen說，從變體的角度來看，它們進(jìn)化得很完美。

弗蘭肯斯坦雜交種是如何誕生的？

那么病毒是如何做到這一點的呢？

基因組學(xué)公司Helix的生物信息學(xué)家Shishi Luo說，首先，一個人必須同時捕獲Omicron和delta。因此，一個人必須在足夠短的時間內(nèi)接觸這兩種變體，以便他們在這個系統(tǒng)中同時擁有這兩種變體。

Shishi Luo和她的同事最近分析了去年11月至今年2月美國疫情高峰期間近3萬名感染SARS-CoV-2的美國人的樣本。他們發(fā)現(xiàn)20人同時感染了三角洲和奧密克戎。換句話說，他們被感染了兩次。

Shishi Luo解釋說，奧密克戎發(fā)生在圣誕節(jié)和新年前后，當(dāng)時有很多社交聚會。所以你可以想象，你去參加一個社交聚會，接觸到三角洲，然后你去參加另一個社交聚會，然后你又接觸到奧密克戎。

如果兩種變種同時感染同一細(xì)胞，那么病毒最終可能會重組。本質(zhì)上，在復(fù)制過程中，一個變體從另一個變體中竊取了一大批基因。因此，三角洲變體在某種程度上抄襲了奧密克戎的部分遺傳密碼。

比如：如果你正在寫文檔，你可以用錯別字來更改單個字母。但你也可以復(fù)制、粘貼和移動大塊文本。這就是重組，其中一種變體，在這種情況下是delta，從omicron中提取了一大塊文本”。

抓住大塊代碼而不僅僅是單個字母，使病毒更具延展性或靈活性，因此它可以快速進(jìn)化出新的變體，包括那些可以逃避我們免疫保護的變體。

重組可能是SARS-CoV-2過去和未來的關(guān)鍵

科學(xué)家剛剛開始了解重組對SARS-CoV-2進(jìn)化有多重要?！氨娝苤偟膩碚f，冠狀病毒有很多重組。對于SARS-CoV-2來說，這是我們第一次看到如此多證據(jù)表明它正在發(fā)生。

事實上，重組可能是SARS-CoV-2首先存在的原因。上個月，格拉斯哥大學(xué)的科學(xué)家發(fā)表了一項研究，其中他們推測了SARS-CoV-2的起源。他們的分析表明，武漢海鮮市場的一只動物可能同時感染了兩種冠狀病毒——這兩種病毒像奧密克戎和三角洲現(xiàn)在所做的那樣，重新組合在一起，以生成初始版本。

在疫情的早期，我們都預(yù)計SARS-CoV-2不會發(fā)生太大變異。Nguyen認(rèn)為這些重組變體為這種病毒接下來將如何進(jìn)化提供了一些有趣的線索——以及下一個令人擔(dān)憂的變體可能出現(xiàn)得有多快。