VASP計算擴散能壘
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本教程為使用VASP 5.4.4軟件計算擴散能壘教程,請?zhí)崆鞍惭bVESTA(用于建模及轉(zhuǎn)換格式)、materials studio(較大,若已安裝VESTA可不安裝,用于建模)。
以計算LiF中Ca離子擴散能壘為例,大致步驟為,下載LiF晶體結(jié)構(gòu) – 擴胞 – 優(yōu)化 – 構(gòu)建Ca離子在LiF中初末態(tài)構(gòu)型 – 優(yōu)化 – 生成中間態(tài)構(gòu)型 – 優(yōu)化 – 處理數(shù)據(jù)。
一、獲得初末態(tài)離子遷移模型
l? ??同計算吸附能部分從materials project下載LiF (mp-1138) cif文件,擴胞2*2*2,生成VASP計算文件,結(jié)構(gòu)優(yōu)化后CONTCAR去MS添加Ca在LiF間隙位點,獲得初末態(tài)離子遷移模型,左圖為MS顯示圖,右圖為VESTA圖,VESTA圖更便于觀察配位情況。
二、生成中間態(tài)遷移路徑模型
l? ??同計算吸附能部分生成VASP計算文件,更改INCAR中ISIF=2再優(yōu)化結(jié)構(gòu),將計算初末態(tài)得到的CONTCAR更改為新的POSCAR,分別命名文件夾為start和end,用neb_path.py代碼生成9個path的遷移路徑
l? 此時文件夾下出現(xiàn)11個遷移路徑的VASP計算文件夾
l? ??生成的11個文件夾中,0和10為start和end的POSCAR,僅需計算1-9即可,使用start和end相同的INCAR、POTCAR和KPOINT,逐個計算。
三、生成遷移路徑能壘圖
l? 將服務(wù)器計算得到的OUTCAR和CONTCAR保存到各自文件夾下,使用neb_barrier.py代碼自動生成Ca遷移路徑圖,同使用neb_path.py的命令,先cd到當(dāng)前文件夾路徑下,再執(zhí)行python neb_barrier.py命令,即可自動生成遷移路徑能壘pdf文件
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