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史上最易懂的流式細胞實驗設計指南

2023-04-07 14:59 作者:健微講堂  | 我要投稿

流式細胞術是非常讓人著迷的實驗。在眾多醫(yī)學研究手段里,如果說弱水三千只取一瓢的話,那我會首選流式細胞術。從我個人感受來講,流式細胞術高速客觀,具有統(tǒng)計學意義,能夠處理復雜樣本并同時獲取多種參數(shù),最最關鍵的是它性能可靠,可重復性非常好。

雖然也存在一些局限,但流式細胞術比起傳統(tǒng)的細胞生物學研究手段來講完全可以獲得「獨孤求敗」的桂冠了;如果算上共聚焦和膜片鉗,當真可以算拉動現(xiàn)代細胞生物學的「三駕馬車」了。

雖然介紹流式細胞術的入門文章很多,很多同學也對流式細胞術耳濡目染已久,看師兄師姐做過無數(shù),可真到自己做的時候卻又總出問題。據(jù)毛老師多年觀察,很多同學在實驗設計的時候就埋下了隱患,最常見的問題就是對照設置不合理,最后導致整體實驗失敗或數(shù)據(jù)不理想。因此,今天我們來談談成功的流式細胞實驗設計都需要設置哪些對照。

毫不夸張地說,設置合理的對照組是整個實驗成功的關鍵;反過來說,如果你掌握了流式實驗如何設置對照的精髓,對整個免疫學相關的實驗設計都會有極大地幫助。

流式對照至少有 5 種:生物學對照,空白對照,同型對照(Isotype control),補償對照(也叫單陽性對照)和 FMO 對照,主要目的是為了避免出現(xiàn)的假陽性或假陰性結果。下面我們以一個具體的凋亡實驗來看看如何設置對照組。下圖是 Annexin V/PI 檢測凋亡的原理示意圖。

比如有兩組細胞,一組給予藥物處理(Treat 組),一組給予 DMSO 溶劑(Vehicle 組),擬用 Annexin V/PI 檢測凋亡,我們來看看都需要設置哪些對照。

1
生物學對照

這個很容易理解,也是很多同學最早設立的對照。這里 Vehicle 組就是生物學對照組。可能很多同學想象力就局限于此了,有了生物學對照就夠了唄,還需要額外對照嗎?答案是肯定的,別忘了流式細胞術也是一種免疫學實驗,下面我們繼續(xù)來設置對照。

2
空白對照

在流式上機檢測前,我們還需準備額外一組細胞(正?;蛱幚磉^的皆可),什么染料也不加,作為空白對照。為什么要設置空白對照呢?除了陽性熒光信號之外,我們還需要排除樣本是否自帶熒光背景,所以要用空白對照來驗證在各個檢測通道上的信號是否都是陰性。

3
同型對照(Isotype control)

這個對照很多同學都比較陌生。這個還得從抗體結構說起。大家知道抗體是個 Y 字形的,F(xiàn)ab 區(qū)域是特異性識別抗原的。在做蛋白免疫印跡時,只需考慮 Fab 的特異性就可以了,但是細胞的話稍微有點不同,因為有些細胞,特別是免疫細胞(B 細胞,T 細胞,巨噬細胞等等),它們表面有 Fc 受體,所以這個同型對照是為了評估抗體 Fc 段與靶細胞的結合情況。如果還不懂的話請看下圖。

所以在做免疫細胞的流式檢測時,我們通常都需要加入 Fc 受體封閉劑,之后再加入目標抗體的 isotype 作為同型對照,來排除細胞 Fc 受體造成的假陽性結果。一般試劑商都會告知該抗體需要使用哪種同型抗體。

4
補償對照(單陽性對照)

要理解這個對照,首先需要知道什么是熒光補償。一圖勝前言,下面這個示意圖說得比較明白。

簡單來說,需要使用幾種顏色的抗體,就需要設置幾種顏色的單陽性對照。這個對照可以用細胞來做,也可以特殊的微球的來做。這里嚴重推薦使用補償微球來作為補償對照,一是能節(jié)約時間和樣本,二是,有時候自己做的單陽性對照效果不佳,陽性信號不強,就失去了補償對照的意義了。下圖是我用補償微球的效果。

5
熒光減一(FMO,F(xiàn)luorescence minus one)對照

如果只用到兩種顏色的話,這個對照可以用單陽性對照代替,如果三種以上顏色的話,就需要再設置 FMO 對照來評估其他熒光染料的干擾和補償本底,幫助正確設置陽性門。

下圖演示如果按空白對照組設定界線之后得到的細胞比例比 FMO 設定的值要大。從這個圖可以看出,空白對照僅僅是設定陰性界線,但非陰性并不等于就是陽性,所以還需 FMO 來設定陽性界線。再打個比方,比如人體體溫正常是 37°,小于 37°?肯定不是發(fā)熱,那超過 37°?就一定是發(fā)熱嗎,比如 37.1°?(發(fā)熱的診斷界線是 37.3°)。

所以,綜上所述,如果只檢測兩種顏色的話,至少需要 5 個對照(生物學對照 + 空白對照 + 同型對照 + 2 個單陽性對照)。如果要檢測 3 種顏色的話,我們來算算,生物學對照 + 空白對照 + 同型對照(可以不同的 isotype 做在同一管里)+3 個單陽性對照 + 3 個 FMO 對照,一共需要 9 個對照。

只有設置了合理的對照,才能得到準確可靠的結果,小伙伴們 get 到了嗎?下次再去做流式,就不會被流式的老師懟得無地自容了吧。如果覺得對您有所啟發(fā),請點個贊哦,要是感興趣的同學比較多,我們下次再繼續(xù)談談樣本處理和顏色搭配的問題。

最后想提一點冷知識,流式細胞術(Flowcytometry)是近年來流行起來的叫法,但它和 FACS 嚴格來說不是同一個意思,F(xiàn)ACS 意思是 Fluorescence activated Cell Sorting,以前老一輩們都叫熒光激發(fā)細胞分選實驗,S 是分選的意思,但實際上很多流式細胞儀還只能做到檢測分析,不能實現(xiàn)分選,我們只是習慣用 FACS 來指代流式細胞檢測術而已。

來源:“生物學霸”公眾號原創(chuàng)文章,作者“毛阿懋”
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