轉(zhuǎn)錄組是指生物體在特定生長(zhǎng)發(fā)育時(shí)期或不同生理病理?xiàng)l件下轉(zhuǎn)錄得到的所有mRNA的集合。根據(jù)中心法則可知，DNA通過轉(zhuǎn)錄成mRNA再翻譯成蛋白質(zhì)，mRNA在遺傳法則中處于中央樞紐地位，可以作為橋梁將基因表達(dá)與下游的最終翻譯物質(zhì)聯(lián)系起來。轉(zhuǎn)錄組分析是功能基因的研究利器，分析轉(zhuǎn)錄組學(xué)數(shù)據(jù)可以得到大量差異表達(dá)的基因以及眾多調(diào)控網(wǎng)絡(luò)，但是難以確定關(guān)鍵調(diào)控途徑以及控制關(guān)鍵途徑的物質(zhì)。

代謝組是指生物體在不同時(shí)期或不同生理狀態(tài)下新陳代謝產(chǎn)生的所有內(nèi)源性小分子代謝物，是生物體在內(nèi)外調(diào)控下基因轉(zhuǎn)錄的最終結(jié)果，也是生物體表型的基礎(chǔ)和直接體現(xiàn)者?；虮磉_(dá)以及表型性狀的微小變化會(huì)在代謝層面得以放大，因此，代謝組學(xué)分析可以反映表型變化的分子機(jī)理。將轉(zhuǎn)錄組與代謝組進(jìn)行聯(lián)合分析可以實(shí)現(xiàn)基因表達(dá)與表型變化之間的連接，從“因”和“果”兩個(gè)層面剖析生物學(xué)問題，通過篩選某一生物學(xué)過程中的關(guān)鍵基因以及代謝產(chǎn)物，構(gòu)建核心的生物學(xué)代謝通路以及調(diào)控網(wǎng)絡(luò)，解釋影響表型的基因機(jī)理，從整體上深度解析生物系統(tǒng)的生長(zhǎng)發(fā)育和病變過程。