1.微生物對含氮的有機物轉(zhuǎn)化

土壤中含氮有機質(zhì)可分為蛋白質(zhì)類型和非蛋白質(zhì)類型，如甲殼素、尿素和葉綠素。在土壤微生物的作用下，土壤中含氮有機質(zhì)分解為無機氮。

①水解過程

在微生物分泌的蛋白水解酶的作用下，蛋白質(zhì)被分解為單一的含氮氨基酸。

②氨化過程

蛋白質(zhì)進行水解反應(yīng)生成的氨基酸在多種不同微生物技術(shù)及其分泌酶的作用下，產(chǎn)生氨的過程。

③硝化過程

在通氣具有良好的情況下，氨化作用可以產(chǎn)生的氨在土壤環(huán)境微生物的作用下，可經(jīng)過研究亞硝酸的中間發(fā)展階段，進一步氧化成硝酸，這個由氨經(jīng)微生物重要作用氧化成硝酸的作用方式叫做硝化影響作用。將硝酸鹽轉(zhuǎn)化成亞硝酸鹽的作用過程稱為亞硝化功能作用。

④反硝化過程

在通風(fēng)不良的土壤中，硝酸鹽還原為氣態(tài)氮(N2O和N2)，這是一種被稱為反硝化的生化反應(yīng)。

2.微生物對含磷有機物的轉(zhuǎn)化

土壤中的有機磷只有在被微生物分解成無機可溶性物質(zhì)后才能被植物吸收和利用。大約20% -50% 的土壤表面處于有機磷狀態(tài)，主要是核蛋白、核酸、磷脂、核素等，分解的最終產(chǎn)物是可供植物利用的正磷酸鹽及其鹽類。

3.微生物對含硫有機物的轉(zhuǎn)化

土壤中含硫的有機結(jié)合化合物如含硫蛋白質(zhì)、胱氨酸等，經(jīng)微生物的腐解作用可以產(chǎn)生以及硫化氫。硫化氫在通氣具有良好的條件下，在硫細(xì)菌的作用下氧化成一個硫酸，并和中國土壤中的鹽基離子反應(yīng)生成硫酸鹽，不僅能夠消除由于硫化氫的毒害影響作用，而且我們能成為一種植物易吸收的硫素養(yǎng)分。

據(jù)估計，有機質(zhì)在降解一年后有2/3以上作為二氧化碳丟失，有機質(zhì)在土壤中的殘留量不到1/3，其中土壤微生物量占3-8%，多糖、糖苷、有機酸等非腐殖質(zhì)物質(zhì)占3% -8%，腐殖質(zhì)占10% -30%。植物根系在土壤中的年殘留量略高于地上部分。