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純干貨輸出——生信分析后要不要加驗證實驗?怎么加實驗?1張圖幫你分析清楚?。?!

2023-02-09 10:53 作者:爾云間  | 我要投稿

生信鳥的各位粉絲小伙伴們,有沒有發(fā)現(xiàn)近期“干濕結(jié)合”類生信文章越來越多了?

整天浸泡在Pubmed中布小谷已經(jīng)敏銳地察覺到:干濕結(jié)合的大趨勢已經(jīng)到來了??!(ps:不是小云自夸,咱對于生信發(fā)展的警覺性還是相當可以的~?~) 從一開始的8分+高分期刊要求加實驗,到現(xiàn)在5分左右甚至3-4分的雜志也開始陸續(xù)出現(xiàn)干濕結(jié)合的文章,可以預見后面雜志對于加實驗的要求會越來越普遍···

發(fā)現(xiàn)了趨勢,就要有相應的對策!那生信分析完以后到底要不要加實驗?如果要加實驗的話需要做到什么程度呢?

今天布小谷就用1張圖給小伙伴們分析清楚

直接上干貨

注:簡單驗證實驗一般包括qPCR、WB、IHC驗證基因表達(臨床樣本、細胞樣本等);中等驗證實驗一般會做到細胞實驗,在干擾/過表達某關(guān)鍵基因后,驗證其功能,有些也會做簡單的通路蛋白表達驗證(比較少);更復雜的驗證實驗會做一些動物模型(更多是非腫瘤疾?。?,在動物模型中研究基因功能。

Tips

小伙伴們可以根據(jù)自己的目標期刊結(jié)合課題創(chuàng)新性以及是否具備實驗條件等情況來評估一下要不要加實驗哦

另外,如果要加驗證實驗或者審稿人要求補實驗,那最簡單也是最容易實現(xiàn)的實驗就是qPCR。那如果實驗條件或經(jīng)費有限,純生信基礎上只加qPCR實驗有沒有意義呢?

首先說結(jié)論:有意義,作用很大!原因如下:

1)?從課題延續(xù)性的角度來看,qPCR驗證實驗可以驗證基因表達,并且有助于篩選下一步實驗/分析所需基因

2)?從選擇期刊投稿的角度來看,純生信補PCR驗證就有非常大的意義,因為你有了更多的期刊可以選擇,投稿命中的機會就大大增加,這樣的純生信更容易被接收。有時候你距離5分+SCI就差一個qPCR驗證,甚至有些期刊直接用補驗證實驗來提高接收純生信的門檻,補了實驗驗證的就送去審稿,沒有補實驗的就立刻秒拒。

布小谷之聲

如果您的時間和精力有限或者缺乏相關(guān)經(jīng)驗,并且對生信分析和思路設計有所需要的話,“小云”非常樂意為您提供如下服務:免費思路評估、付費生信分析和方案設計以及實驗項目實施等,有意向的小伙伴歡迎咨詢布小谷哦!


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