記筆記自用1

液氮裂解細(xì)胞
小分子結(jié)合→不同梯度加熱→離心取上清液→跑Western電泳→轉(zhuǎn)膜→封閉→孵抗體→顯隱
DNA膠制作→跑電泳→回收DNA→測(cè)濃度→同源重組
提質(zhì)粒→測(cè)濃度
液氮反復(fù)凍融細(xì)胞裂解液(細(xì)胞+PBS)是最溫和的裂解細(xì)胞的方式,可以用于研究蛋白質(zhì)的天然結(jié)構(gòu),小分子結(jié)合等。
具體操作:1 min凍+37℃水浴融化40% 反復(fù)
這里師姐是要看小分子與蛋白質(zhì)的結(jié)合對(duì)蛋白質(zhì)的影響,用溫度來(lái)體現(xiàn)。要設(shè)置對(duì)比組(不加小分子的)
目的:將已經(jīng)克隆在一個(gè)載體上的基因克隆在另一個(gè)載體上。
實(shí)驗(yàn)思路:①設(shè)計(jì)一對(duì)引物(目的基因兩端+新載體同源臂),以原載體為模板,利用該引物將目的基因從原載體上p出來(lái),這時(shí)目的基因上兩端攜帶了新載體的同源臂序列。②用引物將目的基因p出。(師姐前面已經(jīng)做完了)③DNA電泳回收目的基因。④同源重組
加熱3 min
1%(1 g / 100 mL)的DNA膠配50 mL:
1.稱0.5 g AGAROSE G-10膠于錐形瓶;
2.加入50 mL的1×TAE buffer(用50×稀釋好的);
3.將錐形瓶放入微波爐,最高溫度,沸騰后每30s拿出來(lái)晃一晃,反復(fù)3-4次,使溶解充分均勻;
4.錐形瓶放入60℃水冷卻;⑥加入5 μL核酸紅色染料(10000× Ultra GelRed),搖勻;
5.取模具,倒入模具,放置10 min
1.常溫放兩分鐘,拿手指上震蕩,甩一下,放冰上
2.全部轉(zhuǎn)移到1.5 mL離心管(這里要很多管),4℃離心 最高轉(zhuǎn)速15 min
1.挑一個(gè)點(diǎn)搖一夜
2.離心, 4000 J 6 min
3.取質(zhì)粒試劑盒(質(zhì)粒試劑盒有大中小三個(gè)規(guī)格,10 mL以內(nèi)mini,20 mL midi,100 mL max)
1.溫柔取下梳子,在裝了TAEbuffer的電泳槽中溫柔剝下膠,用刀片切下不用的,存儲(chǔ)在裝有TAE的塑料袋中,4℃
2.取1 kb Ladder;10× DNA Loading buffer
3.在DNA(25 μL)中加入2 μL的10× DNA Loading buffer
4.上Ladder
5.蓋蓋子,連電線,設(shè)置30 min(電壓沒記下)
這里DNA帶負(fù)電,往正極(紅色)跑
按照提質(zhì)粒試劑盒操作(P1混勻→P2溫和混勻放置3-5 min變清亮粘稠→E3顛倒出絮狀放3-5min離心取上清→上清過(guò)濾柱離心取濾液→加異丙醇→柱平衡→柱子中放入加異丙醇的混合液→離心棄濾液→吸附柱加buffer PW→離心棄廢液→再離心)
跑電泳:取上清液加PAGE loading buffer→shake→95℃金屬熱變性10 min
開紫外→關(guān)上→切下條帶放入離心管→根據(jù)Fast Pure Gel DNA Extraction Mini Kit 試劑盒說(shuō)明提純
1.一個(gè)電泳槽跑兩張膠,短槽朝里(放膠沒有拍到)
2.配1 L電泳液:1L 1×Running buffer(10×Running buffer配方:432g Glycine+90.0gTris 加水3L)+另加 10mL 10% SDS(10g/100mL 十二烷基磺酸鈉)
3.加電泳液入電泳槽(內(nèi)槽填滿,外槽有一些就行),拔梳子
4.金屬加熱后的蛋白放室溫冷卻,震蕩一下
5.上樣
6.電壓先低后高120V
儀器:Nano drop spectra photometer(蛋白和核酸濃度均可測(cè))
1.用水洗三次
2.用水blank,做空白對(duì)照
3.加2 μL 質(zhì)粒 測(cè)出濃度為471 ng/μL(某個(gè)比值>2認(rèn)為有RNA污染,<1.8認(rèn)為有蛋白污染,1.8-2為核酸)
4.加2 μL DNA 測(cè)出濃度為44 ng/μL
5.水洗兩次
菌:載體PET28A
細(xì)胞:載體PRT5
轉(zhuǎn)膜重要!看姐手法 很多細(xì)節(jié)
1.轉(zhuǎn)膜液提前預(yù)冷4℃(具體什么沒記下來(lái))
2.轉(zhuǎn)膜液用甲醇激活,去掉上一層下一層藍(lán)色保護(hù)紙
3.轉(zhuǎn)膜夾,黑膠白膜:白底→海綿→濾紙→膜→趕氣泡→膠(分正反 右上角切角)→趕氣泡→濾紙→海綿
4.轉(zhuǎn)膜裝置:黑對(duì)黑 白對(duì)紅
5.轉(zhuǎn)膜液倒入裝置
6.冰塊放入轉(zhuǎn)膜液
7.蓋蓋子紅對(duì)紅 黑對(duì)黑
8.200mA 1h
9.之后把膜放到20 mL 5%牛奶中,搖床封閉1h(5g/100mL 用TBST溶),再之后加抗體4℃過(guò)夜孵育一夜,第二天來(lái)顯隱