定量質(zhì)譜分析
定量質(zhì)譜分析是指用質(zhì)譜法對(duì)樣品進(jìn)行定量分析。蛋白質(zhì)組定量質(zhì)譜分析就是利用質(zhì)譜技術(shù)對(duì)蛋白質(zhì)組進(jìn)行定量分析。
定量質(zhì)譜分析
定量質(zhì)譜分析是指用質(zhì)譜法對(duì)樣品進(jìn)行定量分析。定量質(zhì)譜分析可以用于對(duì)小分子化合物進(jìn)行定量,也可以用于對(duì)大分子物質(zhì)(如蛋白質(zhì))進(jìn)行定量。這里主要介紹一下蛋白質(zhì)組的定量質(zhì)譜分析。
蛋白質(zhì)組定量質(zhì)譜分析
生物體細(xì)胞中蛋白質(zhì)組的豐度變化對(duì)生命過程有著重要影響。例如,在許多疾病的發(fā)生和發(fā)展進(jìn)程中,常常伴隨著某些蛋白質(zhì)的表達(dá)異常,研究這些異常表達(dá)的蛋白質(zhì)能夠幫助我們了解疾病的發(fā)生和發(fā)展機(jī)制等。
蛋白質(zhì)組定量質(zhì)譜分析是利用質(zhì)譜技術(shù)對(duì)一個(gè)基因組表達(dá)的全部蛋白質(zhì)或一個(gè)復(fù)雜的混合體系中所有的蛋白質(zhì)進(jìn)行精確定量和鑒定。目前,定量蛋白質(zhì)組學(xué)主要有標(biāo)記(Label)和非標(biāo)記(Label Free)兩種定量策略,其中標(biāo)記策略又可分為體內(nèi)標(biāo)記(如 SILAC)和體外標(biāo)記(如 iTRAQ、TMT 標(biāo)記)。基于label free的質(zhì)譜定量蛋白質(zhì)組,是通過液質(zhì)聯(lián)用技術(shù)對(duì)蛋白質(zhì)酶解肽段進(jìn)行質(zhì)譜分析,該方法通過分析大規(guī)模鑒定蛋白質(zhì)時(shí)所產(chǎn)生的質(zhì)譜數(shù)據(jù),比較不同樣品中相應(yīng)肽段的信號(hào)強(qiáng)度,從而對(duì)肽段對(duì)應(yīng)的蛋白質(zhì)進(jìn)行相對(duì)定量?;跇?biāo)記的蛋白質(zhì)組定量質(zhì)譜分析,首先會(huì)對(duì)樣品蛋白進(jìn)行標(biāo)記,然后通過比較帶標(biāo)記與不帶標(biāo)記或帶不同標(biāo)記的質(zhì)譜峰面積來實(shí)現(xiàn)蛋白質(zhì)的相對(duì)定量。