差異代謝物分析
差異代謝物指不同生理病理狀態(tài)、藥物治療情況下機(jī)體產(chǎn)生的不同濃度和比例的內(nèi)源代謝物,是外源物質(zhì)、疾病、藥物或遺傳變異與生命體相互作用的產(chǎn)物,研究差異代謝物可以從本質(zhì)上了解某一生物表型或生理狀態(tài)間的差異。
通常利用OPLS-DA模型基于相關(guān)系數(shù)(Correlation Coefficient)以及VIP (Variable importance in the projection)指標(biāo)進(jìn)行差異代謝產(chǎn)物篩選,因?yàn)檫@種方法所有跟分組相關(guān)的信息都集中在第一維,更容易進(jìn)行模型解釋,一般設(shè)定對應(yīng)的P值 < 0.05,VIP閾值 >1,篩選在此范圍內(nèi)的代謝物。除此之外,還可以通過基于單維檢驗(yàn)和變化倍數(shù)所作的火山圖進(jìn)行差異代謝物篩選。篩選到差異代謝物后可以進(jìn)行代謝通路分析(如富集分析和通路分析)以挖掘和這些代謝物相關(guān)的代謝通路,了解機(jī)體新陳代謝的規(guī)律和本質(zhì)。
百泰派克生物科技采用Thermo Fisher的Orbitrap Fusion Lumos質(zhì)譜平臺結(jié)合Nano-LC納升色譜,提供代謝組學(xué)分析服務(wù)技術(shù)包裹,可對各種代謝物進(jìn)行高效精確的定性定量鑒定,并以此為依據(jù)尋找差異代謝物等,以研究特定的代謝網(wǎng)絡(luò),歡迎免費(fèi)咨詢。
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