蛋白質(zhì)組學(xué)（英語：proteomics，又譯作蛋白質(zhì)體學(xué)），是以蛋白質(zhì)組為研究對(duì)象，研究細(xì)胞、組織或生物體蛋白質(zhì)組成及其變化規(guī)律的科學(xué)。這個(gè)概念最早是在1994年，由Marc Wikins首先提出的新名詞。

上周二分享了基礎(chǔ)定義（二），本周二將分享蛋白產(chǎn)品相關(guān)問題（一）~

現(xiàn)在小編將帶您進(jìn)入今日主題

1.label-free分析的優(yōu)點(diǎn)是什么？

答案：蛋白質(zhì)非標(biāo)記定量技術(shù)（Label-Free?）是無需使用同位素標(biāo)簽的，只需分析大規(guī)模鑒定蛋白質(zhì)時(shí)所產(chǎn)生的質(zhì)譜數(shù)據(jù)，比較不同樣品中相應(yīng)肽段的信號(hào)強(qiáng)度，從而對(duì)肽段對(duì)應(yīng)的蛋白質(zhì)進(jìn)行相對(duì)定量。Label-Free的技術(shù)優(yōu)勢(shì)就在于蛋白質(zhì)不需要進(jìn)行標(biāo)記，所需樣品總量少，耗費(fèi)低。無樣本數(shù)量限制，但是建議多次（三次以上）重復(fù)。

2.?iTRAQ?的全名是什么？iTRAQ?標(biāo)記試劑的結(jié)構(gòu)？

答案：相對(duì)和絕對(duì)定量同位素標(biāo)記（isobaric tags for relative and absolute quantitation,iTRAQ）技術(shù)是美國應(yīng)用生物系統(tǒng)公司與2004年推出的一種蛋白組定量分析技術(shù)。iTRAQ包括三部分：報(bào)告基團(tuán)（reporter group?），平衡基團(tuán)（balance group），肽反應(yīng)基團(tuán)（peptide reactive group）。報(bào)告基團(tuán)（reporter group）：質(zhì)量分別為113.1Da、114.1Da、115.1Da、116.1Da、117.1Da、118.1Da、119.1Da、121.1Da。平衡基團(tuán)（balance group）：質(zhì)量分別為192Da、191Da、190Da、189Da、188Da、187Da、186Da、184Da，使得四種iTRAQ試劑報(bào)告基團(tuán)和平衡分子的總分子量均為305.1Da，無論使用哪種iTRAQ試劑，不同同位素標(biāo)記同一肽段后在一級(jí)質(zhì)譜中，分子量完全相同，呈現(xiàn)的都是同一峰值。肽反應(yīng)基團(tuán)（peptide reactive group）：將reporter group與肽N端及賴氨酸側(cè)鏈連接，從而將報(bào)告基團(tuán)和平衡基團(tuán)標(biāo)記到肽段上，幾乎可以標(biāo)記樣本中所有蛋白質(zhì)。

3.?TMT?的全名是什么？TMT?標(biāo)記試劑的結(jié)構(gòu)?

答案：Thermo Scientific?串聯(lián)質(zhì)譜標(biāo)簽試劑Tandem Mass Tag（TMT）?reagents），專為通過串聯(lián)質(zhì)譜（MS）對(duì)不同樣品中的蛋白質(zhì)進(jìn)行鑒定和定量而設(shè)計(jì)。一組標(biāo)簽試劑里的所有標(biāo)簽，均帶有相同的質(zhì)量（例如：同質(zhì)），化學(xué)結(jié)構(gòu)則由一個(gè)胺反應(yīng)性的NHS?酯基團(tuán)，間隔臂（質(zhì)量調(diào)整區(qū)）和質(zhì)量報(bào)告基團(tuán)（圖1）組成。?

4.?iTRAQ /TMT的標(biāo)記定量原理是什么？

答案：

A、使用不同的標(biāo)記試劑對(duì)不用的樣本進(jìn)行標(biāo)記，使肽段上帶上不同的標(biāo)簽，但是總質(zhì)量保持一致，因此不同樣本中的同一肽段的理化性質(zhì)是一致的，在同一個(gè)保留時(shí)間流出。

B、在二級(jí)質(zhì)譜中，標(biāo)記試劑和肽段間的化學(xué)鍵發(fā)生斷裂，報(bào)告離子峰被質(zhì)譜采集到，報(bào)告離子的峰面積即能反映出某肽段在當(dāng)前樣本的含量，因此通過比較不同報(bào)告離子的峰面積就能找到某個(gè)肽段在不用樣本中的表達(dá)差異。

5.iTRAQ/TMT的主要區(qū)別是什么？

答案：TMT（Tandem Mass Tag）和iTRAQ(isobaric tags for relative and absolute quantitation)技術(shù)分別是由美國?Thermo?公司和?AB SCIEX公司研發(fā)的多肽體外標(biāo)記定量技術(shù)，是目前運(yùn)用最廣泛的兩種標(biāo)記定量蛋白質(zhì)組技術(shù)，具有相似的原理。兩主要區(qū)別在于：TMT最高可同時(shí)標(biāo)記16組不同的生物樣品，iTRAQ最高可同時(shí)標(biāo)記8組不同的生物樣品。

本周的FAQ就到此結(jié)束啦~

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