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深度解析人參的網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)經(jīng)典研究——IPA案例22

2023-11-01 15:50 作者:源資科技  | 我要投稿

網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)被廣泛用于中藥活性成分篩選、藥物重定位、中藥配伍機制探索,以及中醫(yī)藥多成分、多靶點以及多通路的作用機制闡釋等。IPA憑借其豐富且不斷更新的知識庫、方便靈活的分析工具,已經(jīng)成為中醫(yī)藥藥理基礎(chǔ)與作用機制研究的熱門工具。

圖注:使用網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)方法實現(xiàn)草藥衍生靶點發(fā)現(xiàn)、效果預(yù)測、機制闡明和新藥輔助發(fā)現(xiàn)

人參是一種常用的中藥,被廣泛用于治療多種疾病,并且在許多國家中被作為保健品使用。其中,人參皂苷是其主要活性成分之一,已被證明具有多種藥理作用,如抗氧化、抗炎、抗腫瘤。然而,目前對人參皂苷的藥理作用及其作用機制仍存在許多未知,亟需進一步深入研究。美國的Alexander Panossian教授團隊利用IPA對人參進行了一系列深入的研究。接下來將對此系列文獻進行解讀。


第一部分 人參皂苷Rg5在生理和亞生理濃度下的作用

研究人員使用IPA軟件對基因表達譜進行網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)分析,表明在低生理濃度下,人參皂苷Rg5有可能激活膽固醇的生物合成,并在衰老、神經(jīng)炎癥、細胞凋亡和免疫反應(yīng)方面表現(xiàn)出可預(yù)測的效果,這表明它具有作用溫和,對機體死亡、運動障礙和癌癥的恢復(fù)都有益處。

具體而言,研究人員使用IPA在轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)集上進行了不同的預(yù)測計算,產(chǎn)生的分析結(jié)果包括(i)經(jīng)典通路,顯示了公認的信號或代謝通路中感興趣的分子;以及(ii)上游分析,預(yù)測可能被激活或抑制的上游調(diào)節(jié)因子(包括任何可以影響另一分子轉(zhuǎn)錄或表達的分子),并對所研究數(shù)據(jù)集中的表達變化進行解析。

圖注:七種不同濃度的Rg5對神經(jīng)遞質(zhì)與神經(jīng)系統(tǒng)(左上)、細胞免疫反應(yīng)、應(yīng)激和損傷(右上)、核受體與轉(zhuǎn)錄調(diào)控(左下)、細胞凋亡和癌癥(右下)經(jīng)典通路的影響
圖注:Rg5對神經(jīng)炎癥信號通路的影響
圖注:Rg5對細胞凋亡(左)和運動障礙(右)的作用(預(yù)測)

第二部分 紅參和人參皂苷Rg5在癌癥和心臟病中的作用差異

研究人員利用IPA進行顯著上調(diào)或下調(diào)基因的分析,得出對細胞功能和疾病的預(yù)期影響。基因表達譜的網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)分析表明,紅參根制劑HRG80?在神經(jīng)炎癥、衰老、凋亡和免疫反應(yīng)方面表現(xiàn)出可預(yù)測的積極作用,這表明血液中廣泛低濃度的HRG80?對癌癥、胃腸道和內(nèi)分泌系統(tǒng)疾病和障礙具有有益的作用。

圖注:白參對腎上腺髓質(zhì)素、PKA、sirtuin和雌激素受體信號通路的影響。

第三部分 測定紅參和丹參組合的抗腫瘤潛力

研究人員對紅參和丹參制劑處理后的小鼠HT22海馬細胞培養(yǎng)物,進行全轉(zhuǎn)錄組信使核糖核酸微陣列分析。利用IPA確定了該制劑對生理和細胞功能以及疾病的預(yù)期影響。結(jié)果表明該制劑解除了1028個癌癥相關(guān)基因和139個轉(zhuǎn)移相關(guān)基因的調(diào)控,表明該制劑對各種信號和代謝通路的影響及其治療癌癥的潛在療效。

圖注:紅參和丹參制劑對糖酵解的影響:強烈下調(diào)編碼葡萄糖代謝通路的8種酶的基因表達,顯著抑制糖酵解的主要調(diào)節(jié)因子HIF-1α信號通路,并激活抗腫瘤單磷酸激活蛋白激酶(AMPK)

網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)和IPA的應(yīng)用前景廣闊,可以為疾病機制研究、中藥復(fù)方和配伍研究提供有力的支持。歡迎聯(lián)系源資科技體驗IPA的強大功能!

1.?Noor F, Tahir ul Qamar M, Ashfaq UA, Albutti A, Alwashmi ASS, Aljasir MA. Network Pharmacology Approach for Medicinal Plants: Review and Assessment. Pharmaceuticals. 2022; 15(5):572.

2.?Panossian A, Abdelfatah S, Efferth T. Network Pharmacology of Red Ginseng (Part I): Effects of Ginsenoside Rg5 at Physiological and Sub-Physiological Concentrations. Pharmaceuticals. 2021; 14(10):999.

3.?Panossian A, Abdelfatah S, Efferth T. Network Pharmacology of Ginseng (Part II): The Differential Effects of Red Ginseng and Ginsenoside Rg5 in Cancer and Heart Diseases as Determined by Transcriptomics. Pharmaceuticals. 2021; 14(10):1010.

4.?Panossian A, Abdelfatah S, Efferth T. Network Pharmacology of Ginseng (Part III): Antitumor Potential of a Fixed Combination of Red Ginseng and Red Sage as Determined by Transcriptomics. Pharmaceuticals. 2022; 15(11):1345.

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