發(fā)卡(Stem-loop)
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“啪——” ,敲下回車鍵后,侯米一口氣喝光杯里剩下的可樂。盡管因為冰塊早已融化,可樂味道變淡不少,但他仍感覺到十足的暢快。
終于搞定了這個突然出現(xiàn)的 bug —— 在這款名為《進(jìn)化輪(The Evolving Cycles)》的生物進(jìn)化模擬游戲里,用戶創(chuàng)造的“虛擬生物”在多輪進(jìn)化以后,原本用來作為用戶標(biāo)記的“基因水印”序列,出現(xiàn)了不少突變,導(dǎo)致“虛擬生物”一旦進(jìn)入“公共進(jìn)化池”,就再也找不回來了。
不知不覺已是清晨5點,太陽稍稍冒了個頭。
剛合上電腦,打算好好睡一覺,侯米就收到一條語音消息:“米哥,我北京時間早上6點到10點都有空,你隨時都可以過來?!?/p>
“emmmmm,ok,我這就過去?!?忍住想罵人的心情,侯米簡單收拾了一下,便帶著電腦,往地鐵站走去。
給他發(fā)消息、并親切稱呼他作“米哥”的,是他從本科時候起的好友——魏吉,因為比他小一歲,所以就一直叫他“米哥”了。
魏吉現(xiàn)在是一位遺傳咨詢師,也是《進(jìn)化輪》這款游戲的科學(xué)顧問。氣人的是,因為最近的合作對象主要是南半球的客戶,所以魏吉的作息也相應(yīng)地改成了大洋洲時間,每天“早睡早起”;這對魏吉剛懷孕數(shù)周的妻子倒是不錯,但大多數(shù)時候都是半夜工作的侯米卻是叫苦不迭,可誰讓這位老友是游戲重要的科學(xué)顧問呢,只得依著他的時間來了。
0.1
經(jīng)過一個多小時的路程,侯米終于來到魏吉家里,正碰上出門去工作的魏吉妻子給他開了門,然后就輕車熟路地走到書房。
正盯著屏幕,托腮思考的魏吉,還沒發(fā)現(xiàn)已站在他面前的侯米。
直到侯米打了個響指,被嚇一跳的魏吉才匆忙關(guān)掉電腦屏幕,倆人一塊去客廳的沙發(fā)坐下。
魏吉一邊打開外賣軟件,一邊問道:“怎么樣?這次的 bug 解決的還順利嗎?”
“別提了,剛剛忙完,昨晚一夜沒睡。”侯米重重地靠在沙發(fā)背上,“感覺還是上次版本更新的問題,你當(dāng)時說要更真實地模擬生物狀態(tài),我們就花了不少時間,寫了一個會自動生成遺傳序列突變的程序,突變率也大概控制在和自然界差不多的水平,還能夠隨著環(huán)境改變有些微小變化;相對應(yīng)的,我們還強(qiáng)化了基因編碼的數(shù)據(jù)庫讀取。確實,用戶反饋說有‘自然選擇’那味了,也有時候會突變出不少好玩的性狀?!?/p>
“是吧,這才算得上是稍微觸碰到真實‘進(jìn)化’的皮毛了?!蔽杭咽謾C(jī)遞給侯米,“你看看你要喝啥?”
“嗐,你也別高興的太早,昨晚的 bug 還不就是因為這個。”侯米的指尖在手機(jī)屏幕上滑了滑,“就超大杯冰美式吧,再加一份意式濃縮。”
接過侯米遞回的手機(jī),魏吉輸著支付密碼,確認(rèn)了訂單。
看著魏吉放下手機(jī),侯米打開了筆記本電腦,登陸進(jìn)游戲后臺,然后把屏幕轉(zhuǎn)向魏吉,說道:“煩人的是,我們忘記突變還可能出現(xiàn)在‘水印’上了?!?/p>
“水印?”魏吉有點困惑。
侯米接著說道:“前兩個月你不是忙嗎?我們就自己想辦法搞了這個系統(tǒng)。為了增加可玩性和玩家之間的交互,用戶可以把自己創(chuàng)造的生命放進(jìn)‘公共進(jìn)化池”,這樣,環(huán)境因素或者生物與生物之間的相互作用,也能夠影響進(jìn)化的進(jìn)程。每個用戶的生物基因里頭,都有一段專屬的水印序列,后臺就能夠幫忙進(jìn)行匹配,所以就算生物變了個樣,也能很快認(rèn)領(lǐng)、找回?!?/p>
“哦哦哦,懂了。”魏吉咬著拇指的指甲,“‘水印’一旦突變,玩家的生物就相當(dāng)于弄丟了。”
侯米敲了敲鍵盤,點開了他昨晚的修訂記錄,然后說:“對的。你看,雖然昨晚我們憑著用戶遺傳序列庫的歷史記錄,給那些為數(shù)不多的丟失用戶找回了他們的生物,但這樣效率太低,以后要是用戶多了,再出現(xiàn)這種情況也不是個辦法。你覺得有什么好的解決方案嗎?而且是不違背進(jìn)化規(guī)則的那種?!?/p>
“這個其實好辦,把‘水印’調(diào)整成‘突變致死’的基因就好了?!蔽杭屏送票橇荷系难坨R,“只不過說著容易,但要實現(xiàn)的話,你們的工作量應(yīng)該不小?!?/p>
“突變致死?”侯米想了想,“就是說讓‘水印’序列承擔(dān)一個對生物來說至關(guān)重要的作用,只要突變就死亡,然后用戶端顯示的生物,就還是上一代沒有出現(xiàn)突變的那個?感覺可行啊?!?/p>
魏吉頓了頓,說道:“確實可行,但是實際做起來就沒那么簡單了。首先你還是得確保每個用戶的”水印“序列是獨一無二的吧,如果以后用戶數(shù)量比較多,你就很難找到那么多不一樣的‘突變致死’基因;其次,自然界的突變有很多都是‘無義突變’,也就是說,即便突變了,也對于后面編碼產(chǎn)生的蛋白質(zhì)沒什么影響,也就算不上‘致死突變’了?!?/p>
“還會這樣呢??”侯米邊說著便退出了游戲后臺。
“對呀,你忘記以前高中學(xué)的密碼子表了?DNA轉(zhuǎn)錄到RNA以后,三個連續(xù)的堿基對應(yīng)一個氨基酸,但生物通常有 ATCG 四種堿基,所以排列組合就是64種組合,但是常見的氨基酸就20種,所以有很多‘密碼子’會表達(dá)相同的氨基酸,如果出現(xiàn)這些密碼子之間的突變,也就是 ‘無義突變’了?!蔽杭卮鸬溃安粌H如此, 真實情況下,用來配對氨基酸和密碼子的轉(zhuǎn)運RNA(tRNA)有時候沒那么精準(zhǔn),會發(fā)生所謂‘?dāng)[動性’的情況,‘無義突變’也就更多了?!?/p>
“好吧,生命也太麻煩了……”侯米顯得有點無奈,右手食指不斷敲擊著筆記本的 C 面下沿,突然眼睛一亮,“那如果這樣呢?在每個水印前面加上一個短的先導(dǎo)序列,然后根據(jù)這個先導(dǎo)序列,給后面的水印序列一個獨特的編碼系統(tǒng),這樣就能解決‘突變致死’基因比較少的問題了?!?/p>
魏吉忍不住大笑:“哈哈哈哈,那你這個先導(dǎo)序列突變率怎么辦?這不是走進(jìn)了一個死循環(huán)嗎?”
“噢,也是……”侯米顯得有些喪氣,“看來這個‘突變致死’的辦法可能行不通了,你還有什么其它招嗎?”
魏吉低頭看了看咬過的右手大拇指,丑的有點兒不像話。突然他猛地抬起頭,可以明顯看到透過眼鏡,眼睛里放出來的光:“我想到一個大膽的想法,只不過你和你們公司的程序員可能要不開心了?!?/p>
0.2
“你先說說看,我再評估一下可不可行?!焙蠲子峙d奮又無奈。
魏吉笑著說:“就是可能得把你們的水印系統(tǒng)換個底朝天?!?/p>
緊閉嘴唇,咧著嘴的侯米用力咽了咽口水。
看他沒說什么,魏吉便接著說:“既然又不想破環(huán)自然規(guī)則,又想水印保持超自然的穩(wěn)定和保守性,那就用一個自然界沒有的復(fù)制方式。你知道‘中心法則’吧,就是 DNA 能夠自我復(fù)制,然后 DNA 轉(zhuǎn)錄 RNA,RNA 翻譯蛋白質(zhì)的基本通路。后來很多研究不斷補(bǔ)充,就有了 RNA 的自我復(fù)制,RNA 逆轉(zhuǎn)錄成 DNA。但是蛋白質(zhì)反向翻譯成 RNA 或 DNA,以及蛋白質(zhì)的自我復(fù)制暫時還沒有,或者說還沒被發(fā)現(xiàn)。”
侯米插了句嘴:“我記得不是有個叫做朊病毒(Prion Virus)的嗎?”
“對的,但也稍微有點點不同。正常的朊病毒蛋白(Prion Protein,PrP)其實是我們細(xì)胞里面編碼出來的產(chǎn)物,會存在細(xì)胞膜上,而且現(xiàn)在已經(jīng)找到了編碼它的DNA 序列,就在人體細(xì)胞第20號染色體的短臂上。如果正常朊病毒蛋白(PrPc)的結(jié)構(gòu)發(fā)生改變,在 α-螺旋以外還出現(xiàn)了大量 β-折疊,它就變成具有感染性的朊病毒(PrPSc),能夠進(jìn)一步改變接觸到的正常朊病毒蛋白的構(gòu)象,實現(xiàn)傳染和復(fù)制的目的?!?/p>
“哦哦哦,所以它其實只是改變結(jié)構(gòu),然后再影響功能。感覺就像你以前和我講過的‘分子伴侶’?”侯米抬起腿,盤坐在沙發(fā)上。
魏吉瞟了眼侯米被染得五顏六色的白襪,邊笑邊說:“也不完全是,朊病毒可能要復(fù)雜得多。有一些學(xué)者認(rèn)為它可以通過序列,一個一個單元地自我復(fù)制,只不過有人認(rèn)為可能是通過逆翻譯和逆轉(zhuǎn)錄,甚至有人覺得可以直接在氨基酸水平上進(jìn)行復(fù)制。”
“有意思。”侯米直了直身子。
“你們就可以用這后面一種假說,雖然目前還沒有確定的證據(jù),但可以參照 DNA 的復(fù)制編一個。因為目前你們只做細(xì)胞生物,所以可以在最開始單細(xì)胞的時候,就給每個用戶的細(xì)胞里加入一個作為‘水印’的氨基酸序列,然后用一個獨立的、不會出錯的氨基酸復(fù)制系統(tǒng),專門用來保證‘水印’在進(jìn)化過程中的保守性?!蔽杭秸f越興奮,“這個‘水印’多肽不需要有什么具體功能,但要注意不影響其它各種細(xì)胞活動?!?/p>
“等等,等等?!焙蠲宗s忙打斷說到興頭上的魏吉,“難道這個復(fù)制系統(tǒng)不會碰到之前說的那個‘死循環(huán)’嗎?”
“可以避免的,我們可以直接把氨基酸復(fù)制系統(tǒng)放在‘水印’里,中間加上一個可以自剪切的短肽就好了。”魏吉似乎絲毫不在意侯米潑的“冷水”,“而且不僅僅是細(xì)胞生物,其實大部分病毒也可以用這個‘水印’標(biāo)記,除了極少數(shù)沒有任何衣殼或囊膜的病毒以外,這種‘水印’模式應(yīng)該都是合理的,且不會有所影響,而且不管是 DNA 還是 RNA 作為遺傳物質(zhì)都是可行的。甚至你們還可以開辟一個生物進(jìn)化的新模式,試試從氨基酸作為生命最初的形式,開始進(jìn)化和演化的過程,這太酷了!這可是和現(xiàn)有的假設(shè)和認(rèn)知都完全不同的東西!”
“聽起來真的可以,我這就在公司的代碼群里說一下,布置個任務(wù),晚上具體計劃方案?!焙蠲椎氖种冈阪I盤上快速的敲擊著。
“如果能夠基于氨基酸作為生命最基本的單位,那生命的多樣性可能會更加豐富,也會更加復(fù)雜。要知道,常見的氨基酸就有二十多種,再加上各種各樣罕見的,還有無窮無盡的修飾類型,那生命得有多少種形態(tài)呀!”魏吉說著便直接站了起來,他的興奮程度好像有點出乎侯米的意料,他好像很久都沒見過這么他這么激動的樣子。
“呱~呱~呱~~”鈴聲伴隨著振動傳遞到茶幾的聲音,魏吉的手機(jī)響了,顯示的是一個沒有存過聯(lián)系人的陌生號碼。魏吉身體抖了一下,似乎是被嚇到了一樣。只不過這時的侯米還在專心盯著屏幕,和程序員同事們交流著,并沒有察覺到魏吉的異樣。
0.3
滑動屏幕接通電話,原來是外賣到了,魏吉暗暗嘆了口氣,徑直走到玄關(guān),開門接過騎手手中密封嚴(yán)實的棕色紙袋。魏吉腳步沉重地走回客廳,從紙袋里取出表面還帶著細(xì)小水珠的大號塑料杯,插上了吸管,放在侯米面前。
“終于交代清楚了,這個月應(yīng)該能上線新的‘水印’系統(tǒng)。就是還得安排一部分人,手動消除現(xiàn)在的 DNA 水印偶爾出現(xiàn)的 bug ?!庇昧ξ艘淮罂诳Х?,侯米發(fā)出一聲愜意的嘬嘴聲,“一下子就不困了,唯一美中不足的就是紙吸管?!?/p>
魏吉緩緩坐下,身體略有些僵硬,雙目無神地不斷攪動著吸管。
侯米這才注意到他身上的異樣,打趣地問道:“怎么了?別激動哈,就算這次你給了這么好的點子,咨詢費也不會變多的?!?/p>
“沒事沒事,只是覺得自己這個想法挺天才的,哈哈哈哈?!蔽杭惹芭d奮、激動的情緒全無,聲音聽起來還略微有些顫抖。
這些細(xì)節(jié)侯米都看在眼里,但既然他說沒事,就不好意思再過問,便岔開話題:“你覺得《進(jìn)化輪》以后還可以怎么發(fā)展?”
魏吉好像聽見了,又好像沒有聽見。
于是侯米接著說:“你剛剛說這個水印系統(tǒng)在病毒里也沒問題,但病毒不形成細(xì)胞結(jié)構(gòu),也就沒法往多細(xì)胞生物的方向發(fā)展,再加上它們進(jìn)化的速度也和其他細(xì)胞生物完全不同,我們需要單獨開設(shè)一個病毒的世界嗎?那會不會降低用戶體驗和社交屬性了?”
吸了一口手中的冰拿鐵,魏吉似乎開始緩過神來,說到:“倒也不是,病毒雖然自己不能進(jìn)化成為細(xì)胞生物、以及更高等的生命形式,但它可以侵染細(xì)胞生物、甚至整合到細(xì)胞生物的基因組里,有很多種和操控細(xì)胞生命的玩家之間交互的方式。其實有了病毒的參與,進(jìn)化才會更加逼近真實世界的樣子。而且因為病毒生命周期短、進(jìn)化快,而且遺傳物質(zhì)不局限于 DNA,還可以是 RNA,可玩性和趣味性肯定大大增加了。就是給你們后臺的壓力也變大了不少。”
“可行性暫且不說,病毒對進(jìn)化真有這么重要嗎?難道人類在演化中的出現(xiàn)也得靠病毒?”侯米感覺這個說法有點懸乎。
“基本上可以這么說吧,雖然很多理論都還沒有特別殷實的證據(jù),但是有不少人相信我們細(xì)胞里面一些重要的細(xì)胞器,其實就是很久以前入侵的病毒逐漸演變而成的;比如線粒體,專門用來給細(xì)胞提供能量的,它里面就有能夠自己復(fù)制的 DNA 序列,能夠編碼一些蛋白在這個細(xì)胞器里面使用,是不是感覺很像一個‘病毒’?”
“有點意思,我記一下?!焙蠲纂S即在電腦上新建了一個備忘錄。
魏吉看著認(rèn)真記錄的侯米,便繼續(xù)說:“葉綠體也是,也包含了能夠自己復(fù)制、編碼的 DNA 序列,然后在光合作用中發(fā)揮作用。前些日子,我還看到說有研究認(rèn)為,人類的胎盤其實是遠(yuǎn)古時期整合在細(xì)胞里的一些病毒表達(dá)產(chǎn)生的,這種說法似乎解釋了為什么胎盤有時候會引發(fā)孕婦的免疫反應(yīng),但具體還有很多問題沒弄清楚。要不這樣吧,我回頭再仔細(xì)查一查,整理一下相關(guān)的資料,一塊打包發(fā)給你,現(xiàn)在口頭說也說不完,還難免會有錯誤。”
“好啊,太好了!感覺未來一年的工作量都被你承包了?!焙蠲装腴_玩笑地回答。
魏吉笑了笑,但很快,他眼里閃爍著一絲神秘和久違的興奮:“除了這個,關(guān)于游戲未來的可能性,我其實還有一個很天馬行空的想法,你想聽嗎?”
0.4
“說唄,看來你是要給我制定一個五年計劃了。”侯米雙手交叉,撐在腦后。
“你說在游戲發(fā)展到后期,我是指很靠后的時候,已經(jīng)出現(xiàn)了類似人類、擁有高級智慧的生命,他們是不是可以試著從頭再開始創(chuàng)造生命,然后控制進(jìn)化的進(jìn)程。既然是游戲,你們應(yīng)該可以設(shè)計一些現(xiàn)在還做不到的東西,感覺會很有趣,而且說不定很有價值?!蔽杭粗蠲祝坪跤行┢诖?。
侯米的頭枕著雙手,有節(jié)奏地敲擊著沙發(fā)靠背,“你說的有點太跳躍了,讓我捋一捋。之前我看過,有人在那個游戲,‘我的世界’里面創(chuàng)造出了一臺計算機(jī),還能夠正常的開機(jī)編程,寫一些游戲。所以,你的想法也差不多?讓進(jìn)化后的生命創(chuàng)造生命,再去進(jìn)化?!M(jìn)化套娃’?”
“基本上是這個意思,你舉的這個例子太合適了。他們是在計算機(jī)世界里創(chuàng)造計算機(jī),然后再構(gòu)建新的計算機(jī)世界;我的想法是在生命進(jìn)化的世界里,創(chuàng)造新的生命進(jìn)化,而且是用生命本身的方式?!蔽杭呎f邊樂。
侯米抽開雙手,后腦勺直接撞在靠背上,抬頭看著天花板,說道:“我以為我懂了,但是我沒有。”
“哈哈哈,我想想怎么解釋比較合適。”魏吉再次咬起了手指,“你可以把生命和你最熟悉的計算機(jī)類比,它們都能夠儲存信息、讀取信息,然后執(zhí)行信息包含的一些指令;但區(qū)別是,計算機(jī)用的是人為創(chuàng)造的計算機(jī)語言,而生命使用的是遺傳信息?!?/p>
“嗯嗯,你繼續(xù)?!焙蠲鬃似饋?。
“如果把運行‘我的世界’這個游戲的計算機(jī)級別設(shè)定為‘0’,那這個游戲里面出現(xiàn)的計算機(jī)級別就是‘-1’。那如果把我們這些生命存在的世界級別設(shè)定為‘0’的話,那……”
魏吉話還沒說完,侯米便搶著說道:“《進(jìn)化輪》里的生命世界級別就是‘-1’?!?/p>
魏吉搖了搖頭,解釋道:“不不不,不對。這個游戲雖然是在模擬生物進(jìn)化,但是它的底層信息還是以計算機(jī)語言形式存在的,只有使用相同的信息處理法則,在能夠進(jìn)行’世界級別‘的加減。也就是說,如果人類通過合成之類的方式,創(chuàng)造出能夠自我復(fù)制的物質(zhì),或者說初級的‘生命’,那這個‘生命’的世界級別就是‘-1’?!?/p>
“我想我大概懂了,那《進(jìn)化輪》里的世界級別可能頂多算個‘i’吧,虛數(shù),哈哈哈。”侯米撓了撓頭,“只不過你說的這個,確實很復(fù)雜,而且工作量也很大,我得好好花時間琢磨一下,不一定能夠?qū)崿F(xiàn)?!?/p>
魏吉笑著說:“我也就是突然想到,是有點異想天開了,你也別勉強(qiáng)。”
“沒事沒事,很有意思,而且很重要。原本我以為這個游戲就這樣了,以后只是日常維護(hù)一下,但聽你這么說,可以玩的還挺多的,未來還可以開發(fā)各種低級別的世界?!焙蠲滓荒樥J(rèn)真的說著。
“其實這個構(gòu)想從另一個角度來看,挺瘋狂的?!蔽杭吹胶蠲装阉南敕ó?dāng)回事了,就多說了一些:“如果我們所處的世界級別是‘0’的話……”
侯米接過魏吉的話,搶著說:“是不是有可能存在更高級別的世界,也就是‘+1’的世界?”
0.5
“也不是沒有這個可能,這個世界上我們不知道的事情太多了,尤其和生命有關(guān)的事情?!蔽杭c點頭,接著說:“你想呀,地球上的生命歷經(jīng)好幾次誕生、進(jìn)化和毀滅,是不是就像你玩游戲一樣,失敗了就重來,第二次可能比第一次玩的好一點。”
“可能我們的世界也只是一個儲物柜而已,哈哈哈哈?!焙蠲渍f完就笑了起來。
“哈哈哈哈哈哈~”魏吉也應(yīng)聲大笑,“就和我們以前看過的《黑衣人》一樣。”
侯米又喝了一大口咖啡,被子幾乎快要見底了,然后說:“你是不是還想說,這個高級別世界的想法,還能解釋很多世界上的未解之謎?!?/p>
“對呀,比如生命是怎么來的?比如遺傳物質(zhì)為什么是 DNA?比如 DNA 到蛋白質(zhì)之間為啥要有 RNA?……”魏吉似乎一下子打開了話匣子,想要滔滔不絕的來個貫口一般。
“打住,打住?!焙蠲走B忙打斷他,“你這么說,可以說好幾天。”
“可能還不止,哈哈哈哈?!蔽杭獰o奈地把嘴邊的話都憋了回去,喝了口咖啡。
“就算像你說的,有更高級別的生命在操縱著我們的世界,那我們也沒法證明呀。就像我們能夠?qū)τ螒蚶锏慕巧l(fā)出指令,進(jìn)行修改,他們也不能主動和我們溝通。”侯米雙手抱拳,繼續(xù)說道:“你這就是鉆了邏輯上的漏洞,因為也沒辦法證偽來反對你這個說法。”
魏吉又咬起了手指,陷入了沉默。
侯米也沒說話,享受這難得的寧靜。
0.6
嘆了口氣,魏吉推了推鼻上的鏡框,開口說:“如果我說,可能找到了和他們溝通的方法呢?”
侯米的五官幾乎縮在一塊,不用開口就能看得出他的疑惑。
“你有沒有覺得,病毒和我們熟悉的動物、植物,甚至是細(xì)菌都很不一樣?它可以說是生命,但在我看來,它們更像是工具。如果操作對象是細(xì)胞生物,你可以用病毒做到很多事情。最基本的,可以用各種病毒去消滅一種生物;除此以外,還有很多更加高級的做法,例如讓病毒潛伏在細(xì)胞里,長時間監(jiān)視這種生物;又或者是讓病毒嵌合進(jìn)入基因組,或者修改、修飾基因組,進(jìn)而對這個生物發(fā)出指令,讓它做出相應(yīng)的變化,就像你們編寫計算機(jī)程序一樣。”魏吉這一段話說的很緊湊,似乎是刻意不給侯米插嘴的機(jī)會。“但不同的是,你們編寫的程序還沒有發(fā)現(xiàn)自己是一串串代碼的表現(xiàn),但我們現(xiàn)在掌握了生命的編碼語言,就差打開那扇和更高級別世界交互的門了?!?/p>
帶著驚愕的口吻,侯米問道:“所,所以,你找到這扇門了?”
“可能是,也可能不是。但即便是,我也還打不開這扇門,頂多是敲一敲?!蔽杭穆曇舻统亮讼聛恚骸拔易罱盏搅艘粋€疑似問候的信息,只不過還不確定是不是來自這個更高級別的世界,又或者只是有人在惡作劇也說不定?!?/p>
“這個信息具體是什么?你是怎么收到的?不可能是短信或者郵件吧?”侯米越發(fā)感到不解。
“說起來有一點點復(fù)雜,我盡量簡化一點來講?!蔽杭氖种覆粩嗄﹃骂M,“不知道你有沒有聽過生物界的一句玩笑話——‘遇事不決,腸道菌群’,主要是說現(xiàn)在不少研究都認(rèn)為人身上的各種現(xiàn)象都和消化道里面的微生物有關(guān)系。甚至還有人覺得,腸道微生物的重要性堪比大腦,能在生理和心理層面同時對人造成影響?!?/p>
侯米覺得話題的跨度有點大,連忙追問:“所以呢?這和你接收到信息有啥關(guān)系?”
“我最近就正好在處理這方面的數(shù)據(jù),分析一些腸道微生物宏基因組的序列。原本是想看看和不同疾病之間發(fā)生的相關(guān)性,但卻發(fā)現(xiàn)了一些詭異的事情。雖然微生物的多樣性有不小的差異,但不論是來自南半球的樣本,還是我們本國的樣本,都無一例外地出現(xiàn)了一個很罕見的結(jié)構(gòu)——原本雙鏈的 DNA 基因組,其中一條鏈多出了一小段。因為兩條 DNA 鏈的其他部分還是正常配對,所以這一小段就會凸出來。不僅如此,這凸出來的一小段首尾也能夠相互配對,就像疊起來了一樣,展現(xiàn)出來的二級結(jié)構(gòu)就類似一個長長的發(fā)卡。”魏吉繼續(xù)低聲說道。
可能是聽得太過專注,也可能是聽得有點懵,侯米眼睛盯著魏吉,但嘴唇一直吮吸著杯中所剩不多的咖啡,不時發(fā)出吸到冰塊時特有的聲響。
“事實上,類似的發(fā)卡結(jié)構(gòu)在生物體里面十分常見,但這個發(fā)卡也太長了,長到有點不真實,并且序列高度穩(wěn)定,所以我猜測這個多出來的發(fā)卡序列,可能是某種病毒在這些腸道微生物基因組里留下的痕跡?!蔽杭埠攘丝诳Х?,然后說道:“這個折疊的轉(zhuǎn)角處,會有一些沒法和其他序列配對的堿基,它們在轉(zhuǎn)角處會形成一個小環(huán),最神奇也最詭異的事情就發(fā)生在這個小環(huán)上。其他同行手里的數(shù)據(jù)無一例外都顯示,這個小環(huán)的序列是‘TTTTTTTTT’,但我手里的每一份測序結(jié)果都不是這個,而是‘CAC?ATA?ATG?AGA?TGG?GAA?ATT’。”
侯米立即拋出一連串問題:“這個序列有什么特殊的含義嗎?那要怎么解讀呢?翻譯成氨基酸?”
“對,如果翻譯成氨基酸,并用單字母代碼表示的話,就是‘HI, MR. WEI’?!闭f完,魏吉倒吸了一口涼氣,“但這也有點不真實,同時也還有很多奇怪的地方,這個序列是怎么出現(xiàn)的?如果是用病毒作為工具,病毒又是怎么來的?是怎么進(jìn)入腸道菌群的?太多問題都沒辦法解釋了。”
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“現(xiàn)在又多了一個。”雙眼瞪得巨大的侯米,將手中只剩冰塊的杯子舉到魏吉面前。
里面居然有一個,發(fā)卡……