DDA分析的非靶向蛋白質(zhì)組學(xué)
非靶向蛋白質(zhì)組學(xué)是相對(duì)于靶向蛋白質(zhì)組學(xué)而言的,靶向蛋白質(zhì)組學(xué)即靶向定量蛋白質(zhì)組學(xué),基于高分辨質(zhì)譜儀對(duì)目標(biāo)蛋白質(zhì)或多肽進(jìn)行選擇性檢測(cè),從而實(shí)現(xiàn)對(duì)目標(biāo)蛋白質(zhì)或多肽的精準(zhǔn)定量。非靶向蛋白質(zhì)組學(xué)顧名思義,對(duì)研究對(duì)象沒(méi)有強(qiáng)烈的針對(duì)性,可對(duì)混合體系中的蛋白質(zhì)或多肽進(jìn)行精確定量。?
DDA是質(zhì)譜分析中的一種數(shù)據(jù)依賴型采集模式,基于DDA采集模式進(jìn)行非靶向定量蛋白組質(zhì)組學(xué)研究分為標(biāo)記和非標(biāo)記兩種策略,非標(biāo)記(Label Free)蛋白質(zhì)定量策略利用液質(zhì)聯(lián)用技術(shù)將蛋白質(zhì)酶解形成多肽后進(jìn)行質(zhì)譜分析,通過(guò)計(jì)算蛋白肽段的鑒定數(shù)目和色譜峰面積進(jìn)行蛋白質(zhì)相對(duì)定量;標(biāo)記策略如SILAC、iTRAQ和TMT等,將蛋白質(zhì)利用不同的同位素標(biāo)簽進(jìn)行標(biāo)記,酶解消化為多肽后進(jìn)行質(zhì)譜分析,通過(guò)質(zhì)譜數(shù)據(jù)如離子峰強(qiáng)度等推斷不同肽段的含量。?
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