結(jié)構(gòu)優(yōu)化中不可不知的約束條件
結(jié)構(gòu)優(yōu)化過程是獲得合理結(jié)構(gòu)的過程,第一性原理計(jì)算中若使用不合理的結(jié)構(gòu)進(jìn)行后續(xù)的計(jì)算,體系能量、電子結(jié)構(gòu)、磁性計(jì)算等結(jié)果將會(huì)出現(xiàn)較大的誤差。

為什么要進(jìn)行約束優(yōu)化
文獻(xiàn)中的參數(shù)設(shè)置


Q:為什么不同的文獻(xiàn)結(jié)構(gòu)優(yōu)化參數(shù)設(shè)置不同呢?
A:結(jié)構(gòu)優(yōu)化中合理的結(jié)構(gòu)即在某些約束條件下獲得能量最低的結(jié)構(gòu)。不同的結(jié)構(gòu)特性(摻雜、維度、吸附等)及優(yōu)化目的將采取不同的約束限制:
① 微量摻雜結(jié)構(gòu):少量的摻雜原子進(jìn)入結(jié)構(gòu)中,對(duì)晶胞參數(shù)大小和形狀的影響較小,但是由于量化計(jì)算對(duì)模型原子數(shù)目的限制,通常用更高濃度的摻雜代表微量摻雜。此時(shí)的結(jié)構(gòu)優(yōu)化通常要限制晶胞參數(shù)的改變,只優(yōu)化原子位置。
② 復(fù)雜的結(jié)構(gòu)可以分步優(yōu)化,即初始只優(yōu)化離子,然后優(yōu)化晶胞,最后優(yōu)化離子和晶胞。
③?表面吸附結(jié)構(gòu)在結(jié)構(gòu)優(yōu)化時(shí)通常固定底層的原子,只優(yōu)化吸附原子以及上層表面的原子。
④?二維結(jié)構(gòu)優(yōu)化時(shí)保證z方向的晶格長(zhǎng)度不變 。
⑤?為了維持實(shí)驗(yàn)得到的晶胞參數(shù)而限制晶胞參數(shù)的改變。

MatCloud+能夠?qū)崿F(xiàn)的約束方式
① 控制約束何種自由度(離子位置、晶胞體積和晶胞形狀)
② 固定基矢(X、Y、Z軸)
③ 固定某一個(gè)原子(種類及坐標(biāo))
④ 固定某一類原子(元素種類)
⑤ 固定某一范圍內(nèi)的原子(距離z軸小于設(shè)定值的所有原子)
⑥ 固定一定層內(nèi)的原子(距離底層一定層數(shù)內(nèi)的所有原子或部分原子)

MatCloud+如何實(shí)現(xiàn)約束優(yōu)化
①?控制約束何種自由度(離子位置、晶胞體積和晶胞形狀)
離子步弛豫控制(ISIF)決定了結(jié)構(gòu)優(yōu)化中允許改變的自由度(離子位置,晶胞體積和晶胞形狀),MatCloud+可通過開關(guān)的形式進(jìn)行設(shè)置:
【Geometry Opticzation】—【Settings】—【Ionic relaxtion】—【ISIF】


注意:此參數(shù)設(shè)置僅支持部分組合(上表中),一些違反常識(shí)的組合將會(huì)出錯(cuò)。
②?固定基矢(X、Y、Z軸)
固定基矢設(shè)置可以控制結(jié)構(gòu)在某個(gè)晶胞方向不優(yōu)化,MatCloud+通過開關(guān)的形式進(jìn)行此參數(shù)設(shè)置:
【Geometry Opticzation】—【Settings】—【Ionic relaxtion】—【Fix Axis】

注意:此設(shè)置僅支持α=β=γ=90°的結(jié)構(gòu)。
③?固定某一個(gè)原子(種類及坐標(biāo))
輸入原子的坐標(biāo)及種類,可控制它在x,y,z軸是否優(yōu)化,MatCloud+可通過開關(guān)的形式進(jìn)行此參數(shù)設(shè)置:
【Geometry Opticzation】—【Settings】—【Selective dynamics】

④?固定某一類原子(元素種類)
選擇結(jié)構(gòu)中的一種元素,可控制它們?cè)趚,y,z軸是否優(yōu)化。

⑤?固定某一范圍內(nèi)的原子(距離z軸小于設(shè)定值的所有原子)
輸入z軸方向自下而上的距離(分?jǐn)?shù)坐標(biāo)),可控制距離z軸小于設(shè)定值的所有原子在x,y,z軸是否優(yōu)化。

⑥?固定一定層內(nèi)的原子(距離底層一定層數(shù)內(nèi)的所有原子或部分原子)
輸入固定的層數(shù),可控制距離底層一定層數(shù)的所有原子或部分原子在x,y,z軸是否優(yōu)化。


如果您對(duì)結(jié)構(gòu)優(yōu)化中不可不知的約束條件還有其它疑問,歡迎在評(píng)論區(qū)留言或私信我們。
