qPCR可用引物驗證---直接跑qPCR

1. 為什么要做qPCR引物驗證:節(jié)約時間以及試劑成本,避免做了大量樣品結(jié)果分析時不可用;避免珍貴的樣品被浪費,可以將引物驗證好了再做;
2. qPCR引物驗證的方法:取普通的cDNA直接跑qPCR驗證引物的可用性;普通梯度PCR+瓊脂糖凝膠電泳驗證引物的特異性;
3. qPCR預(yù)混反應(yīng)體系(單一反應(yīng)體系):

4. 上樣:用排槍將預(yù)混液按15μL/孔準確加入96孔板中;然后用排槍準確加入5μL樣本(制備的cDNA模板可稀釋后使用),總反應(yīng)體系為20μL;每個樣本各設(shè)3個復(fù)孔;
5. cDNA原液50ng/ul,稀釋10倍后,上樣5ul(25ng);
6. 對照:引物對照(引物,Mix,H2O),陰性對照(水,Mix);
7. 待驗證引物:
一般從文獻中找到之后,可以在NCBI中,先Primer Blast一下,看一下引物是否是特異性的,一般blast結(jié)果中顯示是一個基因,或者是同一個基因的不同轉(zhuǎn)錄本,或者有別的基因出現(xiàn),但product大于500bp以上,就表示該引物是特異性的,可以用;但如果有很多不同基因名的小片段(小于300bp),就表示不可用,可以排除了;

blast過的引物:

8. 板布局:

9. 加樣

10. 實驗結(jié)果分析以及結(jié)果判讀:
?? 根據(jù)qPCR結(jié)果中的CT值,水模板是否起峰;
?? 擴增曲線,是否擴增,擴增曲線是否正常;
?? 溶解曲線,是否為單一峰,是否為非特異性擴增;



注:以上是我自己做qPCR之前會做的引物驗證的實驗流程,如果有幫助的話,算我沒白敲,hhhh