蛋白質(zhì)單分子測(cè)序就是對(duì)蛋白質(zhì)分子的氨基酸序列進(jìn)行分析，也稱(chēng)蛋白質(zhì)一級(jí)結(jié)構(gòu)分析，主要測(cè)定的內(nèi)容包括組成蛋白質(zhì)的多肽鏈數(shù)目、氨基酸種類(lèi)和排序順序以及二硫鍵的數(shù)目。

蛋白質(zhì)測(cè)序技術(shù)的大致流程主要包括多肽鏈的拆分和數(shù)目測(cè)定、二硫鍵的斷裂、每條多肽鏈的氨基酸組成測(cè)定、多肽鏈N端和C端測(cè)定、多肽鏈斷裂、各肽段的氨基酸組成和序列鑒定、肽段到多肽鏈的拼接以及二硫鍵位置的確定，是一個(gè)從拆分再拼接組合的過(guò)程。常用的蛋白質(zhì)序列測(cè)定技術(shù)主要有Edman降解法、肼解法、羧肽酶法以及質(zhì)譜法等?；谫|(zhì)譜的技術(shù)是目前最先進(jìn)、分辨率最好的最常用的蛋白質(zhì)序列分析技術(shù)，可以實(shí)現(xiàn)蛋白質(zhì)的N/C末端序列分析、全長(zhǎng)序列分析以及從頭分析。