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彈道導(dǎo)彈和巡航導(dǎo)彈在運行軌跡、制導(dǎo)方式、速度、攻擊模式以及突防方式等方面存在顯著差異。

彈道導(dǎo)彈是一種依靠火箭發(fā)動機推動，以高拋物線軌跡飛行的導(dǎo)彈。它們在上升段和下降段具有明顯的彈道，并在飛行過程中進行制導(dǎo)。彈道導(dǎo)彈的制導(dǎo)方式包括初始段制導(dǎo)（在導(dǎo)彈飛行的初期階段引導(dǎo)導(dǎo)彈進入預(yù)定的軌道）、中段制導(dǎo)（在飛行中期控制導(dǎo)彈保持在預(yù)定高度和方向）以及末段制導(dǎo)（在最后階段調(diào)整導(dǎo)彈姿態(tài)以確保命中精度）。

巡航導(dǎo)彈則以巡航狀態(tài)在稠密大氣層內(nèi)飛行，其飛行速度較慢，飛行高度較低。巡航導(dǎo)彈采用多種動力方式，如渦扇和渦噴發(fā)動機、火箭發(fā)動機以及沖壓發(fā)動機等。它們通常以亞音速超低空突防，可以根據(jù)需要進行變軌飛行，也可以規(guī)劃不同的彈道飛行。巡航導(dǎo)彈的攻擊模式更為靈活，可進行貼地15米高飛行，部分巡航導(dǎo)彈只在末端超音速飛行。

在突防方式上，彈道導(dǎo)彈主要利用速度突防，即使是洲際飛行也只需要半小時就能到達，短程的甚至只有幾分鐘。彈道導(dǎo)彈的發(fā)射目標(biāo)較大，容易被發(fā)現(xiàn)，但一旦被發(fā)現(xiàn)，很難對其進行攔截。巡航導(dǎo)彈則主要依靠低空隱蔽突防，速度較慢，只要被發(fā)現(xiàn)，攔截就容易得多。

此外，兩種導(dǎo)彈的任務(wù)差別較大。彈道導(dǎo)彈作為三位一體核打擊任務(wù)的重要載體而存在，主要負責(zé)威懾，是核彈的主要載體。而巡航導(dǎo)彈則更多用于裝載常規(guī)彈頭，主要用于打擊機場、港口、指揮中心等重要目標(biāo)。

總的來說，彈道導(dǎo)彈和巡航導(dǎo)彈在多個方面存在顯著差異，包括運行軌跡、制導(dǎo)方式、速度、攻擊模式和突防方式等。了解這些差異有助于更好地理解它們在軍事應(yīng)用中的不同作用。