各樣本外泌體提取
一、細(xì)胞外泌體提取(以MSC為例)
I. 準(zhǔn)備
1) 將P3-P4 MSC 培養(yǎng)至70%-80%密度,10cm dish 或者T75裝10ml Mediium;T175裝25ml/瓶
2) 厚壁超速離心管清洗后高溫高壓滅菌備用(勿烘干),高速離心管及超離管蓋、薄壁超離管用70% 乙醇浸泡20min消毒,然后用無菌PBS潤洗晾干。
II. Conditioned medium的收集和處理
實驗試劑: IMDM、PBS
準(zhǔn)備耗材:滅菌好的EP管、滅菌好的玻璃瓶、50ml離心管、500ml玻璃瓶(無菌)
實驗儀器:冷凍離心機(jī)、迷你離心機(jī)
實驗步驟:
1.??? 將細(xì)胞培養(yǎng)至密度達(dá)到70%-80%滿(超離一次可最多離心240ml,即24個10cm Dish or 10個 T175)
2.??? 棄去培養(yǎng)基,PBS潤洗2次;
3.??? 換成同等體積的IMDM(如果需要加藥處理,則在Conditioned medium更換前進(jìn)行預(yù)處理)
4.??? 培養(yǎng)箱繼續(xù)培養(yǎng)48小時 (不同細(xì)胞不一樣,如生長較快的細(xì)胞,培養(yǎng)24小時即可)
5.??? 用移液管將conditioned medium收集到50ml離心管中,300g? 4度離心10min(去除死細(xì)胞)
6.??? 利用移液管收集上清至干凈50ml 離心管中,4℃保存最長1周或置于-80℃保存,或直接進(jìn)行外泌體提?。?/p>
注意:conditioned medium收集后應(yīng)盡快進(jìn)行外泌體的提取,保存時間長會損失一些外泌體,也有研究者保存于-80度中數(shù)個月再提取外泌體。
補(bǔ)充:以下是全細(xì)胞裂解液的制備(total cell lysate)(用于外泌體免疫分析時作為對照組)
1.??? 用胰酶消化1-2個培養(yǎng)皿的細(xì)胞并進(jìn)行計數(shù);
2.??? 將1-5×107細(xì)胞裝在小型離心管中(EP管)中,300g 4℃ 離心5min,棄上清,重懸在1ml 預(yù)冷的PBS中,再次離心并重懸在1ml 冷PBS中進(jìn)行清洗,再離心棄上清;
3.??? 加200μl (for 1 × 107 cells) 或 1-ml (for 5 × 107 cells) 細(xì)胞裂解液,冰上孵育20min,孵育開始時和結(jié)束時渦旋混勻。(改為超聲30s后50%pulse冰上輕搖15min,2016.01.29)
4.??? 20,000g 4℃離心20min(改為14,000g 4℃離心15min),收集上清至干凈的微型離心管(EP管)中,-20℃保存最多6個月。
III.外泌體的提取
實驗試劑:處理好的細(xì)胞培養(yǎng)基(Conditioned medium) PBS?
實驗儀器:離心機(jī)?? 離心管?? -80°冰箱
實驗步驟:
1.??? 將實驗2中收集處理好的干凈conditioned medium裝入50ml離心管中
2.??? 2000g 4℃離心20min
3.??? 用移液管吸取上清轉(zhuǎn)移至高速離心管中(注意不要污染,留下0.5厘米的上清不要吸)
4.??? 用記號筆標(biāo)記高速離心,標(biāo)記面朝上放置,16500g 4℃離心30min
5.??? 用移液管吸取上清至新的超速離心管(Type 50.2)里(盛0.5cm液面時就不要吸了)
6.??? 120,000g 4℃離心最少70min
注意:本步驟超速離心應(yīng)保證每個離心管均至少有3/4液體,若不足,則應(yīng)加PBS補(bǔ)足;時間超過70min(不超過3小時)并不會破壞exosome,即保證100000g離心大于60min
7.??? 完全棄除上清
注意:如為固定角度的轉(zhuǎn)子,則本步驟可以傾倒棄除上清;如為懸吊式轉(zhuǎn)子,則應(yīng)用移液管吸棄上清,最后剩2mm液面即可
8.??? 在每管離心管中加入1ml 預(yù)冷PBS,用微量移液器(micropipettor)將沉淀重懸,將同一組細(xì)胞的管子的液體混合放到同一個超速離心管(Type 50.2或SW41均可)里,再加入PBS補(bǔ)足管內(nèi)體積。
注意:本步驟可能并不能肉眼看見沉淀物
9.??? 120,000g 4℃離心60min
10.? 盡可能地棄除上清液,用移液管和微量移液器緩慢棄去上清
11.? 重懸沉淀(即exosome):加少量(100μl/6 10cm dish)的預(yù)冷PBS重懸
12.? 分出10ul裝于新EP管用于測量蛋白濃度,剩余可100μl/EP管分裝成小管-80℃冰箱保存
參考文獻(xiàn):Thery C, Amigorena S, Raposo G, Clayton A. Isolation and characterization of exosomes from cell culture supernatants and biological fluids. Curr Protoc Cell Biol. 2006 Chapter 3:Unit 3 22
二、植物外泌體的提取
1.?????? 對于多汁植物,清潔外皮,使用擠汁器榨汁;對于少汁植物,切成6mm×6mm×6mm左右的小塊,使用榨汁機(jī)榨汁。收集到50ml離心管中。每次提取需集滿4個50ml離心管。
2.?????? 照217的超凈臺。以 3000g 30min 4℃離心以去除死細(xì)胞,收集上清液至高離管(4管→6管)。
3.?????? 以 10000g 60min 4℃離心以去除細(xì)胞碎片。收集上清液。
4.?????? 以 150000g 90min 4℃離心,保留沉淀。每管用2ml 8%蔗糖溶液重懸。
5.?????? 可配制4~6管蔗糖梯度溶液(自上而下15%、30%、45%、60%,各1.5ml)。務(wù)必輕柔操作,以形成分層。
6.?????? 繼而輕柔加入有蔗糖梯度溶液的超離管中。
7.?????? 以 150000g 90min 4℃離心,保留可見的各組分(若能看到條帶,則吸取之;否則,兩組分均收集。實際使用時選擇15/30%和[或]30/45%的)。
8.?????? 剩余100 ul用作NTA/TEM檢測,放入-80℃。
三、動物血清外泌體的提取
1.?????? 獲得血漿:新鮮的全血1600g 20min 4℃離心。通常將1~2ml血漿作為一個樣本。
2.?????? 血漿10000g 30min 4℃離心,去掉細(xì)胞碎片等。下接3.1或3.2。
3. 1 ???? 上清稀釋至~6ml,加入Quick-seal超離管(#344619),100000g 70min 4℃離心×2。
3. 2????? 或使用SBI的試劑盒(例如血清是EXOQ5A),按比例加入后低俗離心即可見沉淀。
4.?????? 上接3.1或3.2。用100ul/超離管預(yù)冷的PBS稀釋,充分吹打。