蒙古之行
????1217年，蒙古軍隊大肆進(jìn)軍，這打斷了阿泰爾改革刺客組織的進(jìn)程，他懷疑成吉思汗的崛起是依靠另一件伊甸神器。既為了查明真相，也為了阻止戰(zhàn)爭，阿泰爾將馬斯亞夫交給馬利克管理，自己和瑪利亞、大兒子達(dá)利姆前往了蒙古。成婚不久的賽夫則和自己的家人留在了馬斯亞夫。
????一行人去了波斯，印度和蒙古。在蒙古刺客呼蘭噶剌的幫助下，他們于1227年抵達(dá)西夏興慶，來到成吉思汗的營帳附近。在瑪利亞和達(dá)利姆的掩護(hù)下，阿泰爾與呼蘭噶剌潛入蒙古營地，發(fā)現(xiàn)了成吉思汗已以及其手中的一把伊甸寶劍?。但阿泰爾驚動了警衛(wèi)，并在爭斗中被刺傷，呼蘭噶剌帶著他躲進(jìn)了一間帳篷。
????在帳篷里，呼蘭噶剌殺死了留守的蒙古士兵，救下了一名提前來此地偵查的年輕刺客乃里古翼。阿泰爾勸兩人丟下他繼續(xù)完成任務(wù)，但遭到了呼蘭噶剌的反對，他認(rèn)為阿泰爾的知識和經(jīng)驗是屬于兄弟會的無價之寶，不應(yīng)隨意放棄。阿泰爾無法反駁，只好隨他們撤出營地重新擬定計劃。
????瑪利亞提議將成吉思汗誘出營地進(jìn)行刺殺，于是他們利用黑火藥箭矢在營地內(nèi)放火，成吉思汗隨后帶領(lǐng)一隊騎兵逃出。達(dá)利姆與呼蘭噶剌抓住機(jī)會騎馬追趕，最后成功殺死了成吉思汗，但他們沒來得及拿到伊甸圣劍。
????最后，阿泰爾一家同兩名蒙古刺客分別，各自踏上了新的道路。

馬斯亞夫之變
????當(dāng)遠(yuǎn)行歸來的一家三口回到馬斯亞夫，一切都變了。村民們看著他們的眼神帶著警惕，阿泰爾心生不安。當(dāng)年離開時留下的一名弟子斯瓦米告訴阿泰爾，當(dāng)年的同袍拉烏夫已于多年前死于熱病，他將三名歸來者帶進(jìn)了一間小石屋而非導(dǎo)師的塔樓。
????面對虛偽的斯瓦米，瑪利亞忍著厭惡開口詢問小兒子賽夫的去向，卻得知他和家人一起去了阿拉穆特，但離開的原因斯瓦米沒有透露。憤怒的阿泰爾要求見到馬利克，被他震懾住的斯瓦米只得交代馬利克已被囚禁，現(xiàn)在的兄弟會由一個新建立的委員會管理，而委員會的主席是阿巴斯。阿泰爾壓抑住自己的情緒，提出第二天去見委員會，當(dāng)斯瓦米離開后，他又讓達(dá)利姆速去阿拉穆特帶回小兒子賽夫。
????第二天，斯瓦米強(qiáng)制帶領(lǐng)阿泰爾和瑪利亞前往主塔樓，路上阿泰爾發(fā)現(xiàn)過去的訓(xùn)練場地早已荒廢，他的心情愈發(fā)沉重。委員會早已匯聚一堂，阿巴斯的眼中不再只有憤怒和仇恨，這一刻阿泰爾看到的是一個平等的對手，他不能也不愿再憐憫阿巴斯了。
????委員會除了阿巴斯之外基本都是軟弱無能之人，他們疏于訓(xùn)練，只是追隨著阿巴斯。阿巴斯讓兩人講述在蒙古的經(jīng)歷，瑪利亞卻急于詢問馬斯亞夫的情況，但阿巴斯警告瑪利亞注意自己的身份，并讓警衛(wèi)解除了阿泰爾的武裝。無奈的阿泰爾只能先講述了自己的故事。聽著他的講述，阿巴斯突然點(diǎn)破了達(dá)利姆現(xiàn)在的行動，阿泰爾更加擔(dān)憂，詢問馬利克為何被捕。阿巴斯的回答出人意料：馬利克謀殺了賽夫。
????阿泰爾希望收回組織的領(lǐng)導(dǎo)權(quán)，但被占盡聲勢的阿巴斯否決，兄弟會不再歸阿泰爾領(lǐng)導(dǎo)。回到石屋的阿泰爾夫婦開始思考剛剛聽到的一切：馬利克和賽夫因組織的領(lǐng)導(dǎo)權(quán)爆發(fā)爭執(zhí)，賽夫認(rèn)為馬利克要奪取導(dǎo)師之位，馬利克為了保密殺死了他。阿泰爾對馬利克的信任產(chǎn)生了動搖，他甚至懷疑馬利克仍是在為當(dāng)年的事報復(fù)，瑪利亞批評了他，認(rèn)為阿泰爾的心智被金蘋果扭曲了。阿泰爾沒有回應(yīng)瑪利亞毀掉金蘋果的要求，但他決定查明真相。
????憑借自己對馬斯亞夫的熟悉，阿泰爾溜進(jìn)地牢見到了馬利克，昔日的伙伴此刻瘦骨嶙峋，很明顯阿巴斯在說謊，這個可憐人被關(guān)了絕對不止一個月。阿泰爾救出馬利克，當(dāng)后者清醒時眼里滿是感激，這徹底打消了阿泰爾的懷疑。
????在小屋里，馬利克說出了真相：兩年前阿巴斯發(fā)動政變，殺死賽夫后嫁禍給馬利克，隨后阿巴斯控制了一切對外通信，并大肆修改組織的律法。安撫了陷入自責(zé)的馬利克后，阿泰爾和瑪利亞決定和阿巴斯當(dāng)面對質(zhì)，不以復(fù)仇之名，而是以為了組織的名義。
????來到主院，夫妻倆在不知不覺中被所有刺客包圍。阿巴斯出現(xiàn)了，他要求阿泰爾為擅闖地牢一事做出解釋，阿泰爾回應(yīng)是為了找到兒子死亡的真相。但阿巴斯叫來了斯瓦米，那個混蛋拿一個麻袋，里面是馬利克的頭顱。阿巴斯將馬利克之死也推到了阿泰爾夫婦身上，阿泰爾憤怒的吼出真相，收獲的只是斯瓦米鄙夷的目光，這一刻他意識到，這個年輕人才是那個殺死賽夫的人，現(xiàn)在他又殺死了馬巴斯。金蘋果在阿泰爾懷中顫動著，但他沒有使用這件神器，因為他曾許下諾言。
????阿巴斯用瑪利亞威脅阿泰爾，要他交出金蘋果，當(dāng)年艾哈邁德用來自裁的匕首，刺客抵在瑪利亞的脖頸。阿巴斯不斷煽動旁觀者們的情緒，以此進(jìn)一步逼迫阿泰爾，最終阿泰爾掏出了神器。
????斯瓦米走上前想要觸碰它，同時他告訴阿泰爾，當(dāng)時他是以奉阿泰爾之命為由，殺死了賽夫。阿泰爾實(shí)在無法抑制內(nèi)心的怒火了，金蘋果陡然發(fā)動，斯瓦米不受控制地在眾人面前撕下了自己那張丑陋的臉。

????在蘋果的影響下，阿泰爾沒能聽到瑪利亞的呼喊，也沒注意阿巴斯將她推到了一邊。斯瓦米開始用匕首瘋狂地刺向自己，當(dāng)她要刺出最后一下時，瑪利亞阻止了阿泰爾，但她因此被斯瓦米劃中了脖子。看著奄奄一息的妻子，阿泰爾愣住了。
“你要堅強(qiáng)。”
????這是瑪利亞留下的最后一句話，庭院里只能聽到那個失去摯愛的男人無助的啜泣。
????阿巴斯再次下令抓住阿泰爾，出于對金蘋果的畏懼無人上前，但大部分人出于本能拔劍?？粗矍盎靵y的人群，毀掉一切的愿望在阿泰爾腦中變得無比強(qiáng)烈。但最終他忍住了，趁著沒有人敢靠近的機(jī)會，他爬上塔頂，縱身躍下。

奪回一切
????阿泰爾掉進(jìn)了村外的小河，遇到了歸來的達(dá)利姆，被他帶到了賽夫的家人身邊，他們一起開始隱居生活。
????由于得不到阿泰爾的重視，賽夫的妻子帶著兩個女兒搬去了埃及的亞歷山大港。達(dá)利姆也因無法忍受父親的悔恨以及對伊甸神器的癡迷選擇離開，他去了法國和英國，提醒當(dāng)?shù)厥最I(lǐng)警惕蒙古軍隊。孑然一身的阿泰爾整日面對著金蘋果，展開了新的研究。
????這些年里，阿泰爾進(jìn)行了哲學(xué)方面的思考，進(jìn)行了新裝備的設(shè)計，并回憶了自己的一生。除此以外，他還按照金蘋果內(nèi)的信息，找到了另一套神器并將其隱藏。當(dāng)然，他始終為瑪利亞的死而自責(zé)、哀傷。
????1247年，已經(jīng)82歲的阿泰爾再一次踏上了回馬斯亞夫的路。在一處水潭邊，阿泰爾遇到了同路的商人穆赫利斯。清晨，他們被附近的強(qiáng)盜首領(lǐng)拜哈斯發(fā)現(xiàn)，就在穆赫利斯即將被強(qiáng)盜們殺死的時候，阿泰爾出手了，袖劍彈出，尸體倒地。盡管已經(jīng)二十余年未曾戰(zhàn)斗，阿泰爾依舊能在一開始和強(qiáng)盜們打的有來有回，但歲月不饒人，他的腿被砍出一道傷口。
????阿泰爾開始節(jié)節(jié)后退，鮮血滲入他的靴子，雖然發(fā)過誓，但阿泰爾此時仍動了靠金蘋果結(jié)束戰(zhàn)斗的心思，奈何裝著神器的包藏在一邊，他已經(jīng)無力再戰(zhàn)了。
????當(dāng)強(qiáng)盜想結(jié)束老人性命時，拜哈斯攔住了他的手下，他要親自解決這個不開眼的老頭。但穆赫利斯突然抱住了他，阿泰爾抓住機(jī)會利用最后的力氣將拜哈斯開膛破肚。僅剩的一名強(qiáng)盜見狀逃離。還沒等穆赫利斯表達(dá)自己的感激，阿泰爾就已經(jīng)昏迷倒地。
????為了報答阿泰爾，穆赫利斯將老人帶回了位于馬斯亞夫的家，三天里他一直講述著正在發(fā)生的事情，想要喚醒救命恩人。
????他告訴阿泰爾，拜哈斯的父親派出了使者，希望馬斯亞夫交出殺害他兒子的兇手，他還猜測現(xiàn)在的刺客導(dǎo)師阿巴斯早已和這些強(qiáng)盜同流合污，最，他小心試探，說出了那個一直在他心頭的名字，“大師，阿泰爾·伊本-拉阿哈德”。
????阿泰爾終于睜開了眼，向穆赫利斯證明了自己的身份，商人激動的表達(dá)著對前導(dǎo)師的歡迎，希望他能救贖此地的百姓，并告訴阿泰爾，他已經(jīng)把導(dǎo)師歸來的消息告訴了村民們。阿泰爾為此擔(dān)心，他害怕阿巴斯和他的手下找上門來。
????阿巴斯在過去那些年鎮(zhèn)壓了阿泰爾支持者發(fā)動的暴亂，現(xiàn)在他將自己藏在塔樓，整日疑神疑鬼，處死了所有認(rèn)為可能謀害他的人。傳言這個可憐人一直做著噩夢，擔(dān)心阿泰爾帶著神器找他復(fù)仇。
????聽到這兒，阿泰爾笑了。他表示自己不靠神器打敗阿巴斯，而是靠信仰，對大家以及對刺客的信仰?，F(xiàn)在，他要在村子里宣揚(yáng)刺客精神，并證明它的意義。
????阿泰爾一邊在村里調(diào)停糾紛，一邊讓鐵匠按他的手稿制造新裝備，同時他也注意到有名刺客一直在暗中跟隨。阿泰爾引出跟蹤者，那是個二十出頭的年輕人，男孩表示自己忠于過去的信條，而非阿巴斯的追隨者。他告訴阿泰爾自己有兩個名字，一個是出生時的名字塔齊姆，一個是為紀(jì)念其父而取——馬利克。由于阿巴斯將刺客訓(xùn)練荒廢，二十年來這孩子自行保持著訓(xùn)練，但他缺乏對刺客的認(rèn)知。不過沒關(guān)系，現(xiàn)在阿泰爾回來了，帶著一切刺客們需要的知識。
????阿泰爾要小馬利克集合城堡里反對阿巴斯的人們，他要在強(qiáng)盜法哈德進(jìn)攻馬斯亞夫前掌控局勢。第二天，阿泰爾集合了村民們，同時見到了小馬利克帶來的二十多名勇士，這就是他用來反抗阿巴斯及其三、四十名手下的全部力量。
????行動即刻展開，在山丘上他們遭遇了阿巴斯派來的偵查員，但阿泰爾不希望刺客們在這里自相殘殺。一名偵查員試圖殺死阿泰爾以結(jié)束起義，但他被導(dǎo)師隨手制服。隨后，小馬利克帶人解決了其他敵人，或是打暈或是俘虜。
????城堡的大門開啟，一大群刺客蜂擁而出，穆赫利斯一再勸阻眾人保持冷靜。伴隨著一聲大喊，兩軍相遇，刀劍相向。阿泰爾始終留意著城頭，防止弓箭手偷襲。他看到了阿巴斯，阿巴斯也看到了他。
????沉默，昔日的友人如今反目成仇。阿巴斯命令弓箭手放箭，但他們臉上都帶著遲疑。抓住機(jī)會，阿泰爾大聲勸告，表示沒人需要死在這里。在阿泰爾的授意下，小馬利克打暈了一名沉浸在殺戮中的暴徒，目睹此景的弓箭手放下了弓起義軍愈戰(zhàn)愈勇，阿巴斯的手下紛紛投降，眾人聚在城門口，將大門砸開。
????所有人都聚到了一起，想要見證兩位導(dǎo)師的對決。阿泰爾讓阿巴斯投降，但阿巴斯叫出了他最后一批黨羽，他將堅守到最后。阿泰爾再一次說出了他重復(fù)過多次的話，阿巴斯犯下的一切罪惡，只不過是他拒絕接受當(dāng)年真相的表現(xiàn).。
????但阿巴斯依舊執(zhí)迷不悟，他內(nèi)心對父親盲目的信任不曾動搖，他要撕破阿泰爾“虛偽”的假面，于是他命令手下殺死對方。
????一聲爆鳴，所有人安靜了，阿泰爾站在原地，一條手臂指向阿巴斯，導(dǎo)師的袖口升起一縷白煙。鮮血在阿巴斯的胸口漾開，張口，他一句話也說不出。阿泰爾新制造的一次性袖槍震懾了所有人，那些抵抗者面對槍口選擇了退縮。
????阿巴斯命不久矣，但他仍然拒絕認(rèn)錯，也拒絕相信阿泰爾口中的真相?；蛟S在另一個世界，他能見到自己的父親，那時候，他才會真正相信阿泰爾。阿巴斯死了。
????阿泰爾奪回了馬斯亞夫，兩天后他將率眾前來的法哈德勸離。

結(jié)局
????阿泰爾奪回領(lǐng)導(dǎo)權(quán)后，便派人取回了他的日記。那里面記載的一切為刺客組織的重建發(fā)揮了巨大的作用，訓(xùn)練場上再次響起金鐵之聲，被遺忘的信條再次走進(jìn)每個人腦海。
????不過阿泰爾認(rèn)為刺客們不再需要馬斯亞夫這樣的大型基地，因為刺客將會遍布全世界。馬斯亞夫的刺客們離開了，只有一小部分留下為阿泰爾修建圖書館。所有這些工作又花費(fèi)了十年。
????1257年，阿泰爾讓達(dá)利姆將尼科洛·波羅和馬費(fèi)奧·波羅兄弟請到了馬斯亞夫，并將自己多年來的手記交給了他們。而他的一生，被尼科洛寫成了書籍，并在未來傳給了兒子馬可·波羅。
????蒙古大軍也是在那一年攻入馬斯亞夫，阿泰爾將五件記憶封印交給尼科洛，讓波羅兄弟帶著它們以及手記離開。可惜的是，手記在波羅兄弟離開后不久被蒙古人奪走。不過憑借在圣地學(xué)到的知識，波羅兄弟依舊回到了東方，并將刺客信條傳播發(fā)揚(yáng)。那五件記憶封印也被他們藏在了君士坦丁堡，等待著未來被艾吉奧發(fā)現(xiàn)。
????波羅兄弟離開后，阿泰爾回到了馬斯亞夫的城堡。確保所有人撤離后，他和達(dá)利姆告別，帶著金蘋果走進(jìn)了圖書館。大門關(guān)閉，阿泰爾留下最后一件記憶封印，然后平靜地離開人世。

傳承
????1269年，尼科洛的兒子馬可·波羅從忽必烈手中拿回了阿泰爾的手記，并將其交給西班牙刺客但丁·阿立吉耶里。得知消息的圣殿騎士襲擊了但丁，手記責(zé)備但丁的護(hù)衛(wèi)多梅尼科帶走。后來多梅尼科和兒子改姓奧迪托雷，定居在意大利的蒙特里久尼。