空間代謝組整合網(wǎng)絡(luò)毒理學(xué)和質(zhì)譜成像探究何首烏D組分肝毒性機(jī)制
前言
何首烏(PM)作為傳統(tǒng)中藥具有廣泛的藥理活性且臨床應(yīng)用廣泛,其肝毒性一直備受關(guān)注,但由于其多成分、多靶點(diǎn)的特性,其毒性物質(zhì)和機(jī)制尚未闡明。前期研究發(fā)現(xiàn)PM 70%乙醇提取物中,D組分(95%EtOH洗脫,PM-D的肝毒性最高,然而PM-D的肝毒性機(jī)制尚不清楚。
2022年8月,北京協(xié)和醫(yī)學(xué)院藥物研究所靳洪濤、賀玖明團(tuán)隊(duì)在Journal of Ethnopharmacology 發(fā)表了題為“Integrated spatially resolved metabolomics and network toxicology to investigate the hepatotoxicity mechanisms of component D of Polygonum multiflorum Thunb”,提出系統(tǒng)整體的中藥毒理研究策略,整合網(wǎng)絡(luò)毒理學(xué)和空間質(zhì)譜成像技術(shù)探究何首烏D組分肝毒性的潛在靶點(diǎn)及代謝機(jī)制,為何首烏肝毒性機(jī)制發(fā)現(xiàn)及中草藥的相關(guān)組分藥理毒理機(jī)制研究提供了新的方法和技術(shù)支持。
中文標(biāo)題:整合空間分辨代謝組學(xué)和網(wǎng)絡(luò)毒理學(xué)探究何首烏D組分的肝毒性機(jī)制
研究對(duì)象:何首烏D組分
發(fā)表期刊:Journal of Ethnopharmacology
影響因子:5.195
發(fā)表時(shí)間:2022年8月
運(yùn)用方法:網(wǎng)絡(luò)毒理學(xué)和空間質(zhì)譜成像技術(shù)
研究背景
前期基于斑馬魚(yú)胚胎模型對(duì)何首烏不同組分及單體成分進(jìn)行肝毒性評(píng)估,發(fā)現(xiàn)何首烏D組分的急性毒性和肝毒性明顯高于其他提取物,并分離鑒定了PM-D中27個(gè)化學(xué)成分,主要包含蒽醌類(lèi)、多酚類(lèi)、蒽酮類(lèi)、二蒽酮類(lèi)等,進(jìn)一步以斑馬魚(yú)胚胎模型的表型終點(diǎn)(肝臟大小、肝臟灰度值和卵黃囊面積)評(píng)價(jià)何首烏D組分中主要化學(xué)成分的毒性,發(fā)現(xiàn)蒽醌和二蒽酮類(lèi)與其他成分相比具有顯著的肝毒性。前期的毒性篩選確定潛在毒性物質(zhì)基礎(chǔ)有助于進(jìn)一步闡明其肝毒性分子機(jī)制。
本研究首次整合了網(wǎng)絡(luò)毒理學(xué)和質(zhì)譜成像技術(shù)應(yīng)用于中藥毒理機(jī)制研究,網(wǎng)絡(luò)毒理學(xué)基于系統(tǒng)和整體的角度衡量復(fù)雜的“成分-靶點(diǎn)-疾病”網(wǎng)絡(luò)關(guān)系為中藥毒性機(jī)制探索提供了新的思路?;谫|(zhì)譜成像技術(shù)衍生的空間分辨代謝組學(xué)技術(shù)可在保留空間位置信息的基礎(chǔ)上揭示生物組織中代謝物的時(shí)空分布特征,有助于理解代謝活動(dòng)時(shí)空變化與組織病理和生理功能之間的關(guān)聯(lián)和作用機(jī)制。以何首烏D組分的肝毒性機(jī)制研究為例,兩種方法的整合應(yīng)用為中藥藥理毒理機(jī)制研究提供新的研究策略。
技術(shù)流程
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研究結(jié)果
1、病理及生化指標(biāo)
急性毒性實(shí)驗(yàn)中,14 d內(nèi)所有劑量均未觀察到小鼠死亡或異常毒性癥狀且大體解剖未見(jiàn)明顯病理改變。2g/kg劑量反復(fù)給藥7天后,組織病理學(xué)檢查發(fā)現(xiàn)給藥組肝細(xì)胞腫脹,肝竇輕度擴(kuò)張,少量微肉芽腫,肝細(xì)胞輕度變性/壞死等改變,血清生化分析顯示,血清AST活性和TBIL含量顯著升高,ALT和ALP活性水平呈上升趨勢(shì)(圖1)。
圖1 | PM-D給藥后小鼠病理及生化指標(biāo)變化
2、毒性物質(zhì)的定量檢測(cè)
PM-D中蒽醌類(lèi)化合物大黃素和大黃素-8-β-D-葡萄糖苷的含量分別為3,989.820 μg/g和12,677.423 μg/g (圖2)。反式-大黃素-大黃素二蒽酮和順式-大黃素-大黃素二蒽酮含量分別為1,847.708 μg/g和1,455.940 μg/g(圖3)。
圖2 | HPLC譜圖
標(biāo)準(zhǔn)溶液(A)和樣品溶液(B), 大黃素-8-β-D-葡萄糖苷(1)和大黃素(2)
圖3 | MS譜圖
標(biāo)準(zhǔn)溶液(A)和樣品溶液(B), 反式-大黃素-大黃素二蒽酮(1)和順式-大黃素-大黃素二蒽酮(2)。
3、網(wǎng)絡(luò)毒理學(xué)分析
3.1PM-D肝毒性靶點(diǎn)和網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建
經(jīng)藥物靶點(diǎn)預(yù)測(cè)和疾病靶點(diǎn)收集共獲得了30個(gè)目標(biāo)靶點(diǎn)網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建結(jié)果顯示mTOR、PIK3CA、AKT1、EGFR、ERBB2、ESR1、RPS6KB1、CTNNB1是核心的相關(guān)靶點(diǎn)(圖4)。
圖4 | 網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建及靶點(diǎn)分析
(A)共同靶標(biāo)集合
(B)藥物-靶點(diǎn)-疾病網(wǎng)絡(luò)
(C)PPI網(wǎng)絡(luò)。
3.2 GO和KEGG富集結(jié)果分析
GO富集結(jié)果主要集中在生物過(guò)程中,涉及細(xì)胞內(nèi)信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)的正調(diào)控、TOR信號(hào)、對(duì)外來(lái)生物刺激的響應(yīng)、細(xì)胞對(duì)內(nèi)源性刺激的反應(yīng)、激酶活性的正向調(diào)節(jié)、MAPK級(jí)聯(lián)調(diào)控、凋亡過(guò)程的調(diào)控、活性氧代謝過(guò)程的調(diào)控等(圖5A)。KEGG的富集信號(hào)通路主要包括PI3K-Akt信號(hào)通路、ERBB信號(hào)通路、AMPK信號(hào)通路、mTOR信號(hào)通路、肝細(xì)胞癌、HIF-1信號(hào)通路、Ras信號(hào)通路及MAPK信號(hào)通路等(圖5B)。
圖5 | GO富集分析(A)和KEGG富集分析(B)
3.3分子對(duì)接
分子對(duì)接結(jié)果顯示大部分核心毒性成分都能與靶點(diǎn)緊密結(jié)合,二蒽酮類(lèi)化合物順式-大黃素-大黃素二蒽酮(Cis-emodin-emodin dianthrones),反式-大黃素-大黃素二蒽酮(Trans-emodin-emodin dianthrones),Polygonumnolide C4相較于其他成分結(jié)合能更低。
圖6 |?PM-D中成分與核心靶點(diǎn)的分子對(duì)接分析
(A)結(jié)合能熱圖分析;(B-D)結(jié)合構(gòu)象可視化:
(B)反式-大黃素-大黃素二蒽酮- mTOR;
(C)反式-大黃素-大黃素二蒽酮- EGFR;?
(D)Polygonumnolide C4- mTOR。
4.質(zhì)譜成像分析
4.1高分辨、高覆蓋、高靈敏的代謝物成像
質(zhì)譜成像在單個(gè)像素點(diǎn)提取的代謝物峰可達(dá)數(shù)萬(wàn)種,覆蓋了豐富的代謝物。作者發(fā)現(xiàn)兩種含量較高的藥物成分大黃素和大黃酸相關(guān)代謝產(chǎn)物僅在藥物組的肝臟中高度富集。內(nèi)源性代謝物精氨酸和?;悄懰岬确植季哂袇^(qū)域特異性(圖7)。
圖7 |?AFADESI-MSI可視化PM-D給藥后代謝物變化 (A)負(fù)離子模式下平均質(zhì)譜
(B-E)內(nèi)外源性化合物的空間可視化:大黃素(B), 大黃酚(C),精氨酸(D),?;悄懰峒芭;侨パ跄懰幔‥)。
4.2代謝輪廓分析及差異代謝物鑒定
差異代謝物經(jīng)過(guò)MS/MS鑒定,并采用MassImager軟件可視化其空間分布特征,代表性差異代謝物的質(zhì)譜圖像如圖8所示, 可觀察到精氨酸、鳥(niǎo)氨酸、脯氨酸、?;撬犷?lèi)和肉堿類(lèi)代謝物顯著上調(diào),部分脂質(zhì)類(lèi)代謝物顯著下調(diào)。
圖8 |?代表性差異代謝物質(zhì)譜成像圖
4.3通路富集分析
基于通路富集的結(jié)果,構(gòu)建了包括已鑒定的關(guān)鍵生物標(biāo)志物在內(nèi)的代謝網(wǎng)絡(luò),揭示了膽汁酸合成、嘌呤代謝、脂肪酸氧化、三羧酸(TCA)循環(huán)和脂質(zhì)代謝等參與了PM-D致肝毒性過(guò)程的代謝變化(圖9)。
圖9 | 代謝網(wǎng)絡(luò)分析
研究討論
本研究首次應(yīng)用質(zhì)譜成像技術(shù)可視化PM-D中關(guān)鍵代謝物在肝臟中的分布并首次對(duì)PM中毒性成分二蒽酮類(lèi)化合物進(jìn)行定量檢測(cè)及網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)分析預(yù)測(cè)潛在毒性靶標(biāo)為何首烏毒性物質(zhì)基礎(chǔ)研究及潛在肝毒性靶點(diǎn)發(fā)現(xiàn)奠定了新的基礎(chǔ)。
空間分辨代謝組學(xué)進(jìn)一步挖掘出何首烏D組分的肝毒性生物標(biāo)志物,包括氨基酸、酰基肉堿、膽汁酸、脂類(lèi)等。基因富集和代謝網(wǎng)絡(luò)綜合分析表明,何首烏D組分的毒性機(jī)制可能涉及氧化應(yīng)激、線粒體損傷和AMPK通路等導(dǎo)致的膽汁酸代謝、能量循環(huán)、嘌呤代謝和脂質(zhì)代謝的紊亂相關(guān),該研究有望為臨床診斷和監(jiān)測(cè)何首烏肝毒性的發(fā)生發(fā)展提供參考,并作為代謝適應(yīng)和重編程的資源,以指導(dǎo)未來(lái)臨床預(yù)后研究,為探索中藥毒性機(jī)制提供新思路。
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