大家好，歡迎觀看《時(shí)空日?qǐng)?bào)》第37期。本期追蹤到時(shí)空/單細(xì)胞組學(xué)相關(guān)研究文章共計(jì)5篇。以下是應(yīng)用時(shí)空云平臺(tái)STOmics Cloud的StereoCopilot模塊生成的文章概要，并輔以人工審核，供了解參考。

1、空間轉(zhuǎn)錄組學(xué)揭示Duchenne肌肉萎縮小鼠模型組織病理變化的標(biāo)志物

Spatial transcriptomics reveal markers of histopathological changes in Duchenne muscular dystrophy mouse models

Nature communications; IF:16.600; DOI: 10.1038/s41467-023-40555-9

內(nèi)容概要：使用空間轉(zhuǎn)錄組學(xué)技術(shù)，研究了兩種不同疾病嚴(yán)重程度的Duchenne肌肉萎縮癥小鼠模型，發(fā)現(xiàn)Myl4、Sparc、Hspg2等基因在肌肉再生區(qū)域表達(dá)增加，Vim、Fn1、Thbs4等基因在纖維化區(qū)域表達(dá)增加，Bgn、Ctsk、Spp1等基因在鈣化區(qū)域表達(dá)增加。最后，通過(guò)分化動(dòng)態(tài)分析，預(yù)測(cè)了未來(lái)狀態(tài)中可能受影響的肌纖維。這些發(fā)現(xiàn)有助于開發(fā)有效的治療方法。

2、MERFISH技術(shù)實(shí)現(xiàn)單細(xì)胞分辨率下小鼠視網(wǎng)膜的空間組織

Spatial organization of the mouse retina at single cell resolution by MERFISH

Nature communications; IF:16.600; DOI: 10.1038/s41467-023-40674-3

內(nèi)容概要：使用多路復(fù)用防錯(cuò)熒光原位雜交技術(shù)（multiplexed error-robust fluorescence in situ hybridization，MERFISH）生成小鼠視網(wǎng)膜的單細(xì)胞空間圖譜。通過(guò)與scRNA-seq數(shù)據(jù)的整合，發(fā)現(xiàn)8個(gè)以前未知的錯(cuò)位胞質(zhì)細(xì)胞亞型，并建立了許多細(xì)胞亞型的分子分類與它們的空間排列之間的聯(lián)系。此外，還發(fā)現(xiàn)了亞型之間的空間依賴性差異基因表達(dá)，表明神經(jīng)元類型可能會(huì)根據(jù)位置進(jìn)行功能調(diào)節(jié)。

3、正電子發(fā)射斷層掃描和人腦多巴胺能系統(tǒng)的死后基因表達(dá)揭示蛋白質(zhì)分布和基因表達(dá)的關(guān)聯(lián)

Association of protein distribution and gene expression revealed by positron emission tomography and postmortem gene expression in the dopaminergic system of the human brain

European Journal of Nuclear Medicine and Molecular Imaging; IF:9.100; DOI: 10.1007/s00259-023-06390-2

內(nèi)容概要：通過(guò)使用正電子發(fā)射斷層掃描和基因表達(dá)譜圖相結(jié)合的研究策略，發(fā)現(xiàn)D1和D2受體的mRNA表達(dá)水平與其相應(yīng)的蛋白質(zhì)分布呈正相關(guān)，而多巴胺轉(zhuǎn)運(yùn)體的mRNA表達(dá)水平與其蛋白質(zhì)分布之間沒有明顯的相關(guān)性，為神經(jīng)影像學(xué)研究提供了更廣泛的應(yīng)用前景。

4、周圍神經(jīng)損傷引起的神經(jīng)病理性疼痛與星形膠質(zhì)細(xì)胞衰老樣反應(yīng)相關(guān)

Astrocyte senescence-like response related to peripheral nerve injury-induced neuropathic pain

Cellular and Molecular Biology Letters; IF:8.300; DOI: 10.1186/s11658-023-00474-5

內(nèi)容概要：該研究通過(guò)scRNA-seq技術(shù)鑒定出與星形膠質(zhì)細(xì)胞衰老相關(guān)的分子反應(yīng)，并驗(yàn)證了簇蛋白（clusterin，CLU）的表達(dá)，表明星形膠質(zhì)細(xì)胞衰老可能在周圍神經(jīng)損傷后的神經(jīng)炎癥中發(fā)揮重要作用，并建議針對(duì)星形膠質(zhì)細(xì)胞中CLU的激活提供新的治療策略來(lái)治療神經(jīng)病理性疼痛。

5、IFN?而非IFNα增加對(duì)胰島素缺陷核糖體產(chǎn)物衍生抗原的識(shí)別從而放大胰島自身免疫

IFN? but not IFNα increases recognition of insulin defective ribosomal product-derived antigen to amplify islet autoimmunity

Diabetologia; IF:8.200; DOI: 10.1007/s00125-023-05991-8

內(nèi)容概要：通過(guò)單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組技術(shù)，發(fā)現(xiàn)IFN?誘導(dǎo)內(nèi)分泌β細(xì)胞中編碼免疫蛋白酶體β2i催化亞基的PSMB10轉(zhuǎn)錄本的表達(dá)，揭示了其在胰島素缺陷型核糖體產(chǎn)物（defective ribosomal products，DRiP）衍生肽呈遞給T細(xì)胞中的關(guān)鍵作用。此外，PSMB10在一種β細(xì)胞亞群中上調(diào)，這種亞群在1型糖尿病患者的胰腺中被優(yōu)先破壞。這些數(shù)據(jù)強(qiáng)調(diào)了降解機(jī)制在β細(xì)胞免疫原性中的作用以及評(píng)估靶向免疫蛋白酶體抑制劑以限制1型糖尿病中β細(xì)胞破壞的必要性。

《時(shí)空日?qǐng)?bào)》是華大時(shí)空基于時(shí)空云平臺(tái)STOmics Cloud的StereoCopilot功能板塊，推出的聚焦于時(shí)空組學(xué)領(lǐng)域?qū)W術(shù)前沿的欄目。該欄目以實(shí)時(shí)、精準(zhǔn)追蹤時(shí)空組學(xué)前沿為目標(biāo)，共享最新時(shí)空知識(shí)，助力生命科學(xué)和臨床醫(yī)學(xué)發(fā)展。