蛋白的關(guān)系我知道，蛋白互作網(wǎng)絡(luò)分析
爾云間? 一個(gè)專門做科研的團(tuán)隊(duì)
小果今天遇到了蛋白互作網(wǎng)絡(luò)分析的任務(wù)，這個(gè)任務(wù)其實(shí)還挺常見(jiàn)的，小果今天就帶大家來(lái)看看小果是怎么做的吧。
首先是準(zhǔn)備要分析的蛋白，一般是直接輸入基因symbol就可以了。然后找到分析的網(wǎng)站。
https://cn.string-db.org/
這個(gè)網(wǎng)站長(zhǎng)這樣
這里我們要做的是蛋白之間的互作關(guān)系的分析，所以要選擇多重蛋白這一條，然后把準(zhǔn)備好的蛋白名粘貼進(jìn)去。
下面物種選擇人，點(diǎn)擊search就可以進(jìn)行分析了。
之后是下面這個(gè)頁(yè)面，沒(méi)有特別要求的話，點(diǎn)繼續(xù)就可以了。
然后就能看到分析結(jié)果了。
整個(gè)圖比較長(zhǎng)，這里只展示了部分內(nèi)容，圖片下面有一些設(shè)置的內(nèi)容。
Settings里有設(shè)置調(diào)整的內(nèi)容，不過(guò)因?yàn)槲覀冇懈鼘I(yè)的調(diào)整工具，所以這里就直接導(dǎo)出了，這里選擇第一個(gè)tsv，單向的關(guān)系線。
下面就輪到我們的另一個(gè)主角了，這是一個(gè)軟件，叫做Cytoscape，打開(kāi)之后界面如下
左上角有一個(gè)箭頭，節(jié)點(diǎn)和線段的圖標(biāo)，點(diǎn)一下，就可以導(dǎo)入之前保存的tsv文件
選擇打開(kāi)就可以了，不過(guò)有一點(diǎn)要注意一下，打開(kāi)的時(shí)候有很多列，這里選擇前面的兩列，后面都使用禁止符號(hào)就可以了。
剛打開(kāi)之后，界面如下
左上角選擇style進(jìn)行調(diào)整
小伙伴們選擇自己的style就好了，下面是小云設(shè)置的參數(shù)
做出來(lái)的效果如下
這些節(jié)點(diǎn)線段都是可以拖動(dòng)的，小伙伴們可以自由調(diào)節(jié)。
好了，今天的內(nèi)容就是這些了，小伙伴們有什么問(wèn)題歡迎來(lái)和小果討論啊。
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